| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP002416 | 2367077 = | 107 (1.250) | 78 (0.940) | 69/290 | 0.3 | 42.8% | intergenic (‑142/+1039) | Clo1313_2006/Clo1313_2008 | ADP‑ribosylation/Crystallin J1/transposase mutator type |
| ? | CP002416 | = 2369929 | NA (NA) | intergenic (‑590/+1366) | Clo1313_2008/Clo1313_2009 | transposase mutator type/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 225 total aligned reads displayed.
ATTGCCATACTTATTTTCTCCTTTCAGTATTCAAATAAAATTTCATCTGGTCTTTTTCCGTTCCTGACGATCCTACTCCAATTTGTACTTACTACATCAGGTGCAATAAATATTCTCATACCAAAAATAGAATACGTTTTCAGTATGGCTGATTATAATGCTCCCCATTGTCAAGACAGTTTTTTAGCTTTTCTAAGTTAGCTCTCCTTTCTTAATTTTGTATAATCTTTACAACTGTGCACTCTGTTGGAGGATGTCAAGGGCGAGCGTAAGCGAGTTCATCTTGACCCTTGACATCC > CP002416/2366928‑2367226 | ttcatacgactgtttgaccttctctacttcatcagtttccttgctgaatactctgcccgcattgcttatgaattcagtcttccagcgacttaacaggtttggatgaattccatattctgcagcaatctcattcagcgttctttctccctt > 1:5151‑M1/150‑150 (MQ=255)ttcatacgactgtttgaccttctctacttcatcagtttccttgctgaatactctgcccgcattgcttatgaattcagtcttccagcgacttaacaggtttggatgaattccatattctgcagcaatctcattcagcgttctttctccctt > 1:10444‑M1/150‑150 (MQ=255)ttcatacgactgtttgaccttctctacttcatcagtttccttgctgaatactctgcccgcattgcttatgaattcagtcttccagcgacttaacaggtttggatgaattccatattctgcagcaatctcattcagcgttctttctccctt > 1:5147‑M1/150‑150 (MQ=255)ttcatacgactgtttgaccttctctacttcatcagtttccttgctgaatactctgcccgcattgcttatgaattcagtcttccagcgacttaacaggtttggatgaattccatattctgcagcaatctcattcagcgttctttctccctt > 1:26418‑M1/150‑150 (MQ=255)ttcatacgactgtttgaccttctctacttcatcagtttccttgctgaatactctgcccgcattgcttatgaattcagtcttccagcgacttaacaggtttggatgaattccatattctgcagcaatctcattcagcgttctttctccctt > 1:10562‑M1/150‑150 (MQ=255)ttcatacgactgtttgaccttctctacttcatcagtttccttgctgaatactctgcccgcattgcttatgaattcagtcttccagcgacttaacaggtttggatgaattccatattctgcagcaatctcattcagcgttctttctccctt > 1:10688‑M1/150‑150 (MQ=255)ttcatacgactgtttgaccttctctacttcatcagtttccttgctgaatactctgcccgcattgcttatgaattcagtcttccagcgacttaacaggtttggatgaattccatattctgcagcaatctcattcagcgttctttctccctt > 1:34904‑M1/150‑150 (MQ=255) ttGCCATACTTATTTTCTCCTTTCAGTATTCAAATAAAATTTCATCTGGTCTTTTTCCGTTCCTGACGATCCTACTCCAATTTGTACTTACTACATCAGGTGCAATAAATATTCTCATACCAAAAATAGAATACGTTTTCAGTATGGCTg > 1:41075/1‑150 (MQ=255) ttGCCATACTTATTTTCTCCTTTCAGTATTCAAATAAAATTTCATCTGGTCTTTTTCCGTTCCTGACGATCCTACTCCAATGTGTACTTACTACATCAGGTGCAATAAATATTCTCATACCAAAAATAGAATACGTTTTCAGTATGGCTg < 1:764296/150‑1 (MQ=255) tcatacgactgtttgaccttctctacttcatcagtttccttgctgaatactctgcccgcattgcttatgaattcagtcttccagcgacttaacaggtttggatgaattccatattctgcagcaatctcattcagcgttctttctccctTg < 1:313001‑M1/2‑1 (MQ=255) tcatacgactgtttgaccttctctacttcatcagtttccttgctgaatactctgcccgcattgcttatgaattcagtcttccagcgacttaacaggtttggatgaattccatattctgcagcaatctcattcagcgttctttctccctTg < 1:125891‑M1/2‑1 (MQ=255) tcatacgactgtttgaccttctctacttcatcagtttccttgctgaatactctgcccgcattgcttatgaattcagtcttccagcgacttaacaggtttggatgaattccatattctgcagcaatctcattcagcgttctttctccctTg > 1:5143‑M1/149‑150 (MQ=255) tcatacgactgtttgaccttctctacttcatcagtttccttgctgaatactctgcccgcattgcttatgaattcagtcttccagcgacttaacaggtttggatgaattccatattctgcagcaatctcattcagcgttctttctccctTg > 1:21876‑M1/149‑150 (MQ=255) tcatacgactgtttgaccttctctacttcatcagtttccttgctgaatactctgcccgcattgcttatgaattcagtcttccagcgacttaacaggtttggatgaattccatattctgcagcaatctcattcagcgttctttctccctTg < 1:467286‑M1/2‑1 (MQ=255) catacgactgtttgaccttctctacttcatcagtttccttgctgaatactctgcccgcattgcttatgaattcagtcttccagcgacttaacaggtttggatgaattccatattctgcagcaatctcattcagcgttctttctcccttaa < 1:5187‑M1/3‑3 (MQ=255) atacgactgtttgaccttctctacttcatcagtttccttgctgaatactctgcccgcattgcttatgaattcagtcttccagcgacttaacaggtttggatgaattccatattctgcagcaatctcattcagcgttctttctccctTGAt > 1:5139‑M1/147‑150 (MQ=255) atacgactgtttgaccttctctacttcatcagtttccttgctgaatactctgcccgcattgcttatgaattcagtcttccagcgacttaacaggtttggatgaattccatattctgcagcaatctcattcagcgttctttctccctTGAt < 1:5191‑M1/4‑1 (MQ=255) atacgactgtttgaccttctctacttcatcagtttccttgctgaatactctgcccgcattgcttatgaattcagtcttccagcgacttaacaggtttggatgaattccatattctgcagcaatctcaatcagcgttctttctccctTGAt < 1:142904‑M1/4‑1 (MQ=255) aCTTATTTTCTCCTTTCAGTATTCAAATAAAATTTCATCTGGTCTTTTTCCGTTCCTGACGATCCTACTCCAATTTGTACTTACTACATCAGGTGCAATAAATATTCTCATACCAAAAATAGAATACGTTTTCAGTATGGCTGATTATaa > 1:41079/1‑150 (MQ=255) tATTTTCTCCTTTCAGTATTCAAATAAAATTTCATCTGGTCTTTTTCCGTTCCTGACGATCCTACTCCAATTTGTACTTACTACATCAGGTGCAATAAATATTCTCATACCAAAAATAGAATACGTTTTCAGTATGGCTGATTATAATGc > 1:41083/1‑150 (MQ=255) ttgaccttctctacttcatcagtttccttgctgaatactctgcccgcattgcttatgaattcagtcttccagcgacttaacaggtttggatgaattccatattctgcagcaatctcattcagcgttctttctccctTGATTATAATGCTc < 1:5247‑M1/14‑1 (MQ=255) tttCTCCTTTCAGTATTCAAATAAAATTTCATCTGGTCTTTTTCCGTTCCTGACGATCCTACTCCAATTTGTACTTACTACATCAGGTGCAATAAATATTCTCATACCAAAAATAGAATACGTTTTCAGTATGGCTGATTATAATGCTcc < 1:41117/150‑1 (MQ=255) tttCTCCTTTCAGTATTCAAATAAAATTTCATCTGGTCTTTTTCCGTTCCTGACGATCCTACTCCAATTTGTACTTACTACATCAGGTGCAATAAATATTCTCATACCAAAAATAGAATACGTTTTCAGTATGGCTGATTATAATGCTcc > 1:41087/1‑150 (MQ=255) ttCTCCTTTCAGTATTCAAATAAAATTTCATCTGGTCTTTTTCCGTTCCTGACGATCCTACTCCAATTTGTACTTACTACATCAGGTGCAATAAATATTCTCATACCAAAAATAGAATACGTTTTCAGTATGGCTGATTATAATGCTccc > 1:41091/1‑150 (MQ=255) ccttctctacttcatcagtttccttgctgaatactctgcccgcattgcttatgaattcagtcttccagcgacttaacaggtttggatgaattccatattctgcagcaatctcattcagcgttctttctccctTGATTATAATGCTCCCCa > 1:38978‑M1/133‑150 (MQ=255) ccttctctacttcatcagtttccttgctgaatactctgcccgcattgcttatgaattcagtcttccagcgacttaacaggtttggatgaattccatattctgcagcaatctcattcagcgttctttctccctTGATTATAATGCTCCCCa < 1:5265‑M1/18‑1 (MQ=255) tttCAGTATTCAAATAAAATTTCATCTGGTCTTTTTCCGTTCCTGACGATCCTACTCCAATTTGTACTTACTACATCAGGTGCAATAAATATTCTCATACCAAAAATAGAATACGTTTTCAGTATGGCTGATTATAATGCTCCCCATTGt < 1:41113/150‑1 (MQ=255) ttCAGTATTCAAATAAAATTTCATCTGGTCTTTTTCCGTTCCTGACGATCCTACTCCAATTTGTACTTACTACATCAGGTGCAATAAATATTCTCATACCAAAAATAGAATACGTTTTCAGTATGGCTGATTATAATGCTCCCCATTGTc > 1:41095/1‑150 (MQ=255) tCAGTATTCAAATAAAATTTCATCTGGTCTTTTTCCGTTCCTGACGATCCTACTCCAATTTGTACTTACTACATCAGGTGCAATAAATATTCTCATACCAAAAATAGAATACGTTTTCAGTATGGCTGATTATAATGCTCCCCATTGTCa < 1:764184/150‑1 (MQ=255) gTATTCAAATAAAATTTCATCTGGTCTTTTTCCGTTCCTGACGATCCTACTCCAATTTGTACTTACTACATCAGGTGCAATAAATATTCTCATACCAAAAATAGAATACGTTTTCAGTATGGCTGATTATAATGCTCCCCATTGTCAAGa > 1:24646/1‑150 (MQ=255) catcagtttccttgctgaatactctgcccgcattgcttatgaattcagtcttccagcgacttaacaggtttggatgaattccatattctgcagcaatctcattcagcgttctttctccctTGATTATAATGCTCCCCATTGTCAAGACAg > 1:10602‑M1/121‑150 (MQ=255) tAAAATTTCATCTGGTCTTTTTCCGTTCCTGACGATCCTACTCCAATTTGTACTTACTACATCAGGTGCAATAAATATTCTCATACCAAAAATAGAATACGTTTTCAGTATGGCTGATTATAATGCTCCCCATTGTCAAGACAGtttttt < 1:41109/150‑1 (MQ=255) ttccttgctgaatactctgcccgcattgcttatgaattcagtcttccagcgacttaacaggtttggatgaattccatattctgcagcaatctcattcagcgttctttctccctTGATTATAATGCTCCCCATTGTCAAGACAGTTTTTTa < 1:5351‑M1/37‑1 (MQ=255) aaaaTTTCATCTGGTCTTTTTCCGTTCCTGACGATCCTACTCCAATTTGTACTTACTACATCAGGTGCAATAAATATTCTCATACCAAAAATAGAATACGTTTTCAGTATGGCTGATTATAATGCTCCCCATTGTCAAGACAGTTTTTTa < 1:764210/150‑1 (MQ=255) tccttgctgaatactctgcccgcattgcttatgaattcagtcttccagcgacttaacaggtttggatgaattccatattctgcagcaatctcattcagcgttctttctccctTGATTATAATGCTCCCCATTGTCAAGACAGTTTTTTAg < 1:24716‑M1/38‑1 (MQ=255) aaaTTTCATCTGGTCTTTTTCCGTTCCTGACGATCCTACTCCAATTTGTACTTACTACATCAGGTGCAATAAATATTCTCATACCAAAAATAGAATACGTTTTCAGTATGGCTGATTATAATGCTCCCCATTGTCAAGACAGTTTTTTAg < 1:14492/150‑1 (MQ=255) tttCATCTGGTCTTTTTCCGTTCCTGACGATCCTACTCCAATTTGTACTTACTACATCAGGTGCAATAAATATTCTCATACCAAAAATAGAATACGTTTTCAGTATGGCTGATTATAATGCTCCCCATTGTCAAGACAGTTTTTTAGCtt > 1:3946/1‑150 (MQ=255) cATCTGGTCTTTTTCCGTTCCTGACGATCCTACTCCAATTTGTACTTACTACATCAGGTGCAATAAATATTCTCATACCAAAAATAGAATACGTTTTCAGTATGGCTGATTATAATGCTCCCCATTGTCAAGACAGTTTTTTAGCTTTTc < 1:14500/150‑1 (MQ=255) ctctgcccgcattgcttatgaattcagtcttccagcgacttaacaggtttggatgaattccatattctgcagcaatctcattcagcgttctttctccctTGATTATAATGCTCCCCATTGTCAAGACAGTTTTTTAGCTTTTCTAAGTTa < 1:5397‑M1/51‑1 (MQ=255) ctctgcccgcattgcttatgaattcagtcttccagcgacttaacaggtttggatgaattccatattctgcagcaatctcattcagcgttctttctccctTGATTATAATGCTCCCCATTGTCAAGACAGTTTTTTAGCTTTTCTAAGTTa > 1:4899‑M1/100‑150 (MQ=255) ctgcccgcattgcttatgaattcagtcttccagcgacttaacaggtttggatgaattccatattctgcagcaatctcattcagcgttctttctccctTGATTATAATGCTCCCCATTGTCAAGACAGTTTTTTAGCTTTTCTAAGTTAGc > 1:10146‑M1/98‑150 (MQ=255) ttttCCGTTCCTGACGATCCTACTCCAATTTGTACTTACTACATCAGGTGCAATAAATATTCTCATACCAAAAATAGAATACGTTTTCAGTATGGCTGATTATAATGCTCCCCATTGTCAAGACAGTTTTTTAGCTTTTCTAAGTTAGct > 1:3870/1‑150 (MQ=255) tttCCGTTCCTGACGATCCTACTCCAATTTGTACTTACTACATCAGGTGCAATAAATATTCTCATACCAAAAATAGAATACGTTTTCAGTATGGCTGATTATAATGCTCCCCATTGTCAAGACAGTTTTTTAGCTTTTCTAAGTTAGctc > 1:41099/1‑150 (MQ=255) 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tCCTGACGATCCTACTCCAATTTGTACTTACTACATCAGGTGCAATAAATATTCTCATACCAAAAATAGAATACGTTTTCAGTATGGCTGATTATAATGCTCCCCATTGTCAAGACAGTTTTTTAGCTTTTCTAAGTTAGCTCTCCTTTc > 1:38465/1‑150 (MQ=255) cTGACGATCCTACTCCAATTTGTACTTACTACATCAGGTGCAATAAATATTCTCATACCAAAAATAGAATACGTTTTCAGTATGGCTGATTATAATGCTCCCCATTGTCAAGACAGTTTTTTAGCTTTTCTAAGTTAGCTCTCCTTTCtt > 1:1808/1‑150 (MQ=255) cTGACGATCCTACTCCAATTTGTACTTACTACATCAGGTGCAATAAATATTCTCATACCAAAAATAGAATACGTTTTCAGTATGGCTGATTATAATGCTCCCCATTGTCAAGACAGTTTTTTAGCTTTTCTAAGTTAGCTCTCCTTTCtt < 1:14512/150‑1 (MQ=255) tGACGATCCTACTCCAATTTGTACTTACTACATCAGGTGCAATAAATATTCTCATACCAAAAATAGAATACGTTTTCAGTATGGCTGATTATAATGCTCCCCATTGTCAAGACAGTTTTTTAGCTTTTCTAAGTTAGCTCTCCTTTCTTa > 1:38469/1‑150 (MQ=255) tatgaattcagtcttccagcgacttaacaggtttggatgaattccatattctgcagcaatctcattcagcgttctttctccctTGATTATAATGCTCCCCATTGTCAAGACAGTTTTTTAGCTTTTCTAAGTTAGCTCTCCTTTCTTAAt > 1:9712‑M1/84‑150 (MQ=255) 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ctcATACCAAAAATAGAATACGTTTTCAGTATGGCTGATTATAATGCTCCCCATTGTCAAGACAGTTTTTTAGCTTTTCTAAGTTAGCTTTCCTTTCTTAATTTTGTATAATCTTTACAACTGTGCACTCTGTTGGAGGATGTCAAGGGc > 1:835528/1‑150 (MQ=255) tctgcagcaatctcattcagcgttctttctccctTGATTATAATGCTCCCCATTGTCAAGACAGTTTTTTAGCTTTTCTAAGTTAGCTCTCCTTTCTTAATTTTGTATAATCTTTACAACTGTGCACTCTGTTGGAGGATGTCAAGGGCg < 1:2554‑M1/116‑1 (MQ=255) tgcagcaatctcattcagcgttctttctccctTGATTATAATGCTCCCCATTGTCAAGACAGTTTTTTAGCTTTTCTAAGTTAGCTCTCCTTTCTTAATTTTGTATAATCTTTACAACTGTGCACTCTGTTGGAGGATGTCAAGGGCGAg < 1:835416‑M1/118‑1 (MQ=255) tgcagcaatctcattcagcgttctttctccctTGATTATAATGCTCCCCATTGTCAAGACAGTTTTTTAGCTTTTCTAAGTTAGCTCTCCTTTCTTAATTTTGTATAATCTTTACAACTGTGCACTCTGTTGGAGGATGTCAAGGGCGAg < 1:22316‑M1/118‑1 (MQ=255) aTACCAAAAATAGAATACGTTTTCAGTATGGCTGATTATAATGCTCCCCATTGTCAAGACAGTTTTTTAGCTTTTCTAAGTTAGCTCTCCTTTCTTAATTTTGTATAATCTTTACAACTGTGCACTCTGTTGGAGGATGTCAAGGGCGAg < 1:14464/150‑1 (MQ=255) aCCAAAAATAGAATACGTTTTCAGTATGGCTGATTATAATGCTCCCCATTGTCAAGACAGTTTTTTAGCTTTTCTAAGTTAGCTCTCCTTTCTTAATTTTGTATAATCTTTACAACTGTGCACTCTGTTGGAGGATGTCAAGGGCGAGCg > 1:25212/1‑150 (MQ=255) aaaaaTAGAATACGTTTTCAGTATGGCTGATTATAATGCTCCCCATTGTCAAGACAGTTTTTTAGCTTTTCTAAGTTAGCTCTCCTTTCTTAATTTTGTATAATCTTTACAACTGTGCACTCTGTTGGAGGATGTCAAGGGCGAGCGTaa > 1:39961/1‑150 (MQ=255) tcattcagcgttctttctccctTGATTATAATGCTCCCCATTGTCAAGACAGTTTTTTAGCTTTTCTAAGTTAGCTCTCCTTTCTTAATTTTGTATAATCTTTACAACTGTGCACTCTGTTGGAGGATGTCAAGGGCGAGCGTAAGCGAg < 1:25298‑M1/128‑1 (MQ=255) ttcagcgttctttctccctTGATTATAATGCTCCCCATTGTCAAGACAGTTTTTTAGCTTTTCTAAGTTAGCTCTCCTTTCTTAATTTTGTATAATCTTTACAACTGTGCACTCTGTTGGAGGATGTCAAGGGCGAGCGTAAGCGAGTTc > 1:10176‑M1/20‑150 (MQ=255) aaTACGTTTTCAGTATGGCTGATTATAATGCTCCCCATTGTCAAGACAGTTTTTTAGCTTTTCTAAGTTAGCTCTCCTTTCTTAATTTTGTATAATCTTTACAACTGTGCACTCTGTTGGAGGATGTCAAGGGCGAGCGTAAGCGAGTTc < 1:50899/150‑1 (MQ=255) aTACGTTTTCAGTATGGCTGATTATAATGCTCCCCATTGTCAAGACAGTTTTTTAGCTTTTCTAAGTTAGCTCTCCTTTCTTAATTTTGTATAATCTTTACAACTGTGCACTCTGTTGGAGGATGTCAAGGGCGAGCGTAAGCGAGTTCa > 1:50415/1‑150 (MQ=255) cGTTTTCAGTATGGCTGATTATAATGCTCCCCATTGTCAAGACAGTTTTTTAGCTTTTCTAAGTTAGCTCTCCTTTCTTAATTTTGTATAATCTTTACAACTGTGCACTCTGTTGGAGGATGTCAAGGGCGAGCGTAAGCGAGTTCATCt > 1:1726/1‑150 (MQ=255) cgttctttctccctTGATTATAATGCTCCCCATTGTCAAGACAGTTTTTTAGCTTTTCTAAGTTAGCTCTCCTTTCTTAATTTTGTATAATCTTTACAACTGTGCACTCTGTTGGAGGATGTCAAGGGCGAGCGTAAGCGAGTTCATCtt > 1:29660‑M1/15‑150 (MQ=255) ttttCAGTATGGCTGATTATAATGCTCCCCATTGTCAAGACAGTTTTTTAGCTTTTCTAAGTTAGCTCTCCTTTCTTAATTTTGTATAATCTTTACAACTGTGCACTCTGTTGGAGGATGTCAAGGGCGAGCGTAAGCGAGTTCATCTTg > 1:1529002/1‑150 (MQ=255) ttttCAGTATGGCTGATTATAATGCTCCCCATTGTCAAGACAGTTTTTTAGCTTTTCTAAGTTAGCTCTCCTTTCTTAATTTTGTATAATCTTTACAACTGTGCACTCTGTTGGAGGATGTCAAGGGCGAGCGTAAGCGAGTTCATCTTg < 1:50883/150‑1 (MQ=255) gttctttctccctTGATTATAATGCTCCCCATTGTCAAGACAGTTTTTTAGCTTTTCTAAGTTAGCTCTCCTTTCTTAATTTTGTATAATCTTTACAACTGTGCACTCTGTTGGAGGATGTCAAGGGCGAGCGTAAGCGAGTTCATCTTg < 1:25272‑M1/137‑1 (MQ=255) ttctttctccctTGATTATAATGCTCCCCATTGTCAAGACAGTTTTTTAGCTTTTCTAAGTTAGCTCTCCTTTCTTAATTTTGTATAATCTTTACAACTGTGCACTCTGTTGGAGGATGTCAAGGGCGAGCGTAAGCGAGTTCATCTTGa < 1:21956‑M1/138‑1 (MQ=255) aGTATGGCTGATTATAATGCTCCCCATTGTCAAGACAGTTTTTTAGCTTTTCTAAGTTAGCTCTCCTTTCTTAATTTTGTATAATCTTTACAACTGTGCACTCTGTTGGAGGATGTCAAGGGCGAGCGTAAGCGAGTTCATCTTGACCCt < 1:50865/150‑1 (MQ=38) tctccctTGATTATAATGCTCCCCATTGTCAAGACAGTTTTTTAGCTTTTCTAAGTTAGCTCTCCTTTCTTAATTTTGTATAATCTTTACAACTGTGCACTCTGTTGGAGGATGTCAAGGGCGAGCGTAAGCGAGTTCATCTTGACCCtt > 1:50851‑M1/8‑150 (MQ=255) ctccctTGATTATAATGCTCCCCATTGTCAAGACAGTTTTTTAGCTTTTCTAAGTTAGCTCTCCTTTCTTAATTTTGTATAATCTTTACAACTGTGCACTCTGTTGGAGGATGTCAAGGGCGAGCGTAAGCGAGTTCATCTTGACCCTTg < 1:50481‑M1/144‑1 (MQ=255) cTGATTATAATGCTCCCCATTGTCAAGACAGTTTTTTAGCTTTTCTAAGTTAGCTCTCCTTTCTTAATTTTGTATAATCTTTACAACTGTGCACTCTGTTGGAGGATGTCAAGGGCGAGCGTAAGCGAGTTCATCTTGACCCTTGACATc > 1:25152/1‑150 (MQ=32) TGATTATAATGCTCCCCATTGTCAAGACAGTTTTTTAGCTTTTCTAAGTTAGCTCTCCTTTCTTAATTTTGTATAATCTTTACAACTGTGCACTCTGTTGGAGGATGTCAAGGGCGAGCGTAAGCGAGTTCATCTTGACCCTTGACATcc < 1:50521‑M1/150‑1 (MQ=255) | ATTGCCATACTTATTTTCTCCTTTCAGTATTCAAATAAAATTTCATCTGGTCTTTTTCCGTTCCTGACGATCCTACTCCAATTTGTACTTACTACATCAGGTGCAATAAATATTCTCATACCAAAAATAGAATACGTTTTCAGTATGGCTGATTATAATGCTCCCCATTGTCAAGACAGTTTTTTAGCTTTTCTAAGTTAGCTCTCCTTTCTTAATTTTGTATAATCTTTACAACTGTGCACTCTGTTGGAGGATGTCAAGGGCGAGCGTAAGCGAGTTCATCTTGACCCTTGACATCC > CP002416/2366928‑2367226 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |