| Predicted mutation | ||||||
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| MC JC | CP002416 | 3,435,261 | Δ480 bp | coding (45‑524/555 nt) | Clo1313_2927 ← | hypoxanthine phosphoribosyltransferase |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | CP002416 | 3435741 = | 0 (0.000) | coding (44/555 nt) | Clo1313_2927 | hypoxanthine phosphoribosyltransferase | |||||
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
TCCTCATTCTTTATAGCAATATAGCAAAACACTATCTCTCATACATATTATTATAAAATATATATTACATTATATTAACATAACGGTATTAAAAACACAAGAAACCTTTGTATATTTTTTAGTCCATATCTTCTTTGTCCGTATAAACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP002416/3435112‑3435260‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aAGTTCCTCTCTGGTAACCAAAATTTCTTTAATTTGATTTATCATGAGTTTCCTCCTAAATATACGCTTTTTTAAGCTATTTTTAATCTATATATTTTAATCTGTAATCGGGCAATTTATAAGCTAACAATCCATAATTCATAAGACC > CP002416/3435741‑3435887 TCCTCATTCTTTATAGCAATATAGCAAAACACTATCTCTCATACATATTATTATAAAATATATATTACATTATATTAACATAACGGTATTAAAAACACAAGAAACCTTTGTATATTTTTTAGTCCATATCTTCTTTGTCCGTATAAACAA > 1:802229/1‑150TCCTCATTCTTTATAGCAATATAGCAAAACACTATCTCTCATACATATTATTATAAAATATATATTACATTATATTAACATAACGGTATTAAAAACACAAGAAACCTTTGTATATTTTTTAGTCCATATCTTCTTTGTCCGTATAAACAA < 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TTTTAGTCCATATCTTCTTTGTCCGTATAAACAAGTTCCTCTCTGGTAACCAAAATTTCTTTAATTTGATTTATCATGAGTTTCCTCCTAAATATACGCTTTTTTAAGCTATTTTTAATCTATATATTTTAATCTGTAATCGGGCAATTT > 1:802337/1‑150 TTTAGTCCATATCTTCTTTGTCCGTATAAACAAGTTCCTCTCTGGTAACCAAAATTTCTTTAATTTGATTTATCATGAGTTTCCTCCTAAATATACGCTTTTTTAAGCTATTTTTAATCTATATATTTTAATCTGTAATCGGGCAATTTA > 1:802339/1‑150 TAGTCCATATCTTCTTTGTCCGTATAAACAAGTTCCTCTCTGGTAACCAAAATTTCTTTAATTTGATTTATCATGAGTTTCCTCCTAAATATACGCTTTTTTAAGCTATTTTTAATCTATATATTTTAATCTGTAATCGGGCAATTTATA > 1:802341/1‑150 TAGTCCATATCTTCTTTGTCCGTATAAACAAGTTCCTCTCTGGTAACCAAAATTTCTTTAATTTGATTTATCATGAGTTTCCTCCTAAATATACGCTTTTTTAAGCTATTTTTAATCTATATATTTTAATCTGTAATCGGGCAATTTATA < 1:802234/150‑1 AGTCCATATCTTCTTTGTCCGTATAAACAAGTTCCTCTCTGGTAACCAAAATTTCTTTAATTTGATTTATCATGAGTTTCCTCCTAAATATACGCTTTTTTAAGCTATTTTTAATCTATATATTTTAATCTGTAATCGGGCAATTTATAA > 1:802343/1‑150 GTCCATATCTTCTTTGTCCGTATAAACAAGTTCCTCTCTGGTAACCAAAATTTCTTTAATTTGATTTATCATGAGTTTCCTCCTAAATATACGCTTTTTTAAGCTATTTTTAATCTATATATTTTAATCTGTAATCGGGCAATTTATAAG > 1:802178/1‑150 CCATATCTTCTTTGTCCGTATAAACAAGTTCCTCTCTGGTAACCAAAATTTCTTTAATTTGATTTATCATGAGTTTCCTCCTAAATATACGCTTTTTTAAGCTATTTTTAATCTATATATTTTAATCTGTAATCGGGCAATTTATAAGCT > 1:802345/1‑150 ATATCTTCTTTGTCCGTATAAACAAGTTCCTCTCTGGTAACCAAAATTTCTTTAATTTGATTTATCATGAGTTTCCTCCTAAATATACGCTTTTTTAAGCTATTTTTAATCTATATATTTTAATCTGTAATCGGGCAATTTATAAGCTAA > 1:771925/1‑150 TCTTCTTTGTCCGTATAAACAAGTTCCTCTCTGGTAACCAAAATTTCTTTAATTTGATTTATCATGAGTTTCCTCCTAAATATACGCTTTTTTAAGCTATTTTTAATCTATATATTTTAATCTGTAATCGGGCAATTTATAAGCTAACAA < 1:785754/150‑1 CTTTGTCCGTATAAACAAGTTCCTCTCTGGTAACCAAAATTTCTTTAATTTGATTTATCATGAGTTTCCTCCTAAATATACGCTTTTTTAAGCTATTTTTAATCTATATATTTTAATCTGTAATCGGGCAATTTATAAGCTAACAATCCA > 1:802188/1‑150 TTTGTCCGTATAAACAAGTTCCTCTCTGGTAACCAAAATTTCTTTAATTTGATTTATCATGAGTTTCCTCCTAAATATACGCTTTTTTAAGCTATTTTTAATCTATATATTTTAATCTGTAATCGGGCAATTTATAAGCTAACAATCCAT > 1:785593/1‑150 TTGTCCGTATAAACAAGTTCCTCTCTGGTAACCAAAATTTCTTTAATTTGATTTATCATGAGTTTCCTCCTAAATATACGCTTTTTTAAGCTATTTTTAATCTATATATTTTAATCTGTAATCGGGCAATTTATAAGCTAACAATCCATA < 1:785804/150‑1 GTCCGTATAAACAAGTTCCTCTCTGGTAACCAAAATTTCTTTAATTTGATTTATCATGAGTTTCCTCCTAAATATACGCTTTTTTAAGCTATTTTTAATCTATATATTTTAATCTGTAATCGGGCAATTTATAAGCTAACAATCCATAAT > 1:785595/1‑150 GTATAAACAAGTTCCTCTCTGGTAACCAAAATTTCTTTAATTTGATTTATCATGAGTTTCCTCCTAAATATACGCTTTTTTAAGCTATTTTTAATCTATATATTTTAATCTGTAATCGGGCAATTTATAAGCTAACAATCCATAATTCAa < 1:785702/150‑2 TATAAACAAGTTCCTCTCTGGTAACCAAAATTTCTTTAATTTGATTTATCATGAGTTTCCTCCTAAATATACGCTTTTTTAAGCTATTTTTAATCTATATATTTTAATCTGTAATCGGGCAATTTATAAGCTAACAATCCATAATTCATA < 1:785778/150‑1 ACAAGTTCCTCTCTGGTAACCAAAATTTCTTTAATTTGATTTATCATGAGTTTCCTCCTAAATATGCGCTTTTTTAAGCTATTTTTAATCTATATATTTTAATCTGTAATCGGGCAATTTATAAGCTAACAATCCATAATTCATAAGACC < 1:764812/150‑1 TCCTCATTCTTTATAGCAATATAGCAAAACACTATCTCTCATACATATTATTATAAAATATATATTACATTATATTAACATAACGGTATTAAAAACACAAGAAACCTTTGTATATTTTTTAGTCCATATCTTCTTTGTCCGTATAAACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP002416/3435112‑3435260‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aAGTTCCTCTCTGGTAACCAAAATTTCTTTAATTTGATTTATCATGAGTTTCCTCCTAAATATACGCTTTTTTAAGCTATTTTTAATCTATATATTTTAATCTGTAATCGGGCAATTTATAAGCTAACAATCCATAATTCATAAGACC > CP002416/3435741‑3435887 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |