| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP002416 | = 2790291 | 98 (1.010) | 105 (1.090) | 84/296 | 0.2 | 65.6% | intergenic (‑108/+73) | Clo1313_2375/Clo1313_2376 | Integrase catalytic region/Resolvase domain protein |
| ? | CP002416 | = 3242178 | 13 (0.130) | intergenic (‑341/‑91) | Clo1313_2757/Clo1313_2758 | nucleoside recognition domain protein/transcriptional regulator, AbrB family | |||||
Only 100 of 221 total aligned reads displayed.
ATAGCTTAATTTAAGCAAAAGTATTCCTATTTGTTTTATTAATTTTAAGACGAAAGTAATTTGATGCTTTTTGTGACATTATGAAAAAATAGAATTACTATTAACTTACAATCTCACCACAAATTATTATTGAATTTAATTGAATTTTTTTTAAAATATTGTTGACTATTATTGGCATTTATGGTATCATGGAAAGTGAGAAGTTTGTCGAATACTGTATGTTTAGAGGAGGATCAGTTATGAAATCTACTGGAATCGTAAGAAAAGTCGATGAATTAGGAAGGGTTGTTCTGCCTAT > CP002416/3242030‑3242327 | tAGCTTAATTTAAGCAAAAGTATTCCTATTTGTTTTATTAATTTTAAGACGAAAGTAATTTGATGCTTTTTGTGACATTATGAAAAAATAGAATTACTATTAACTTACAATCTCACCACAAATTATTATTGAATTTAATTGAATTTTTtg > 1:822838‑M2/1‑148 (MQ=255) tAGCTTAATTTAAGCAAAAGTATTCCTATTTGTTTTATTAATTTTAAGACGAAAGTAATTTGATGCTTTTTGTGACATTATGAAAAAATAGAATTACTATTAACTTACAATCTCACCACAAATTATTATTGAATTTAATTGAATTTTTtg < 1:822816‑M2/150‑3 (MQ=255) agaaatacaaaggatagagcattggataaataattaccctagaagaatatttggatatagaactgcaaatgaaatggctgcttaaaacagtgttctgtaagaatatgtaaggcaattaaacttgcaatttagatAATTGAATTTTTTTTa < 1:818193‑M2/16‑1 (MQ=255) ttAATTTAAGCAAAAGTATTCCTATTTGTTTTATTAATTTTAAGACGAAAGTAATTTGATGCTTTTTGTGACATTATGAAAAAATAGAATTACTATTAACTTACAATCTCACCACAAATTATTATTGAATTTAATTGAATTTTTtggtaa < 1:822383‑M2/150‑7 (MQ=255) ttAATTTAAGCAAAAGTATTCCTATTTGTTTTATTAATTTTAAGACGAAAGTAATTTGATGCTTTTTGTGACATTATGAAAAAATAGAATTACTATTAACTTACAATCTCACCACAAATTATTATTGAATTTAATTGAATTTTTtggtaa < 1:813399‑M2/150‑7 (MQ=255) aaatacaaaggatagagcattggataaataattaccctagaagaatatttggatatagaactgcaaatgaaatggctgcttaaaacagtgttctgtaagaatatgtaaggcaattaaacttgcaatttagatAATTGAATTTTTTTTaaa < 1:817636‑M2/18‑1 (MQ=255) atacaaaggatagagcattggataaataattaccctagaagaatatttggatatagaactgcaaatgaaatggctgcttaaaacagtgttctgtaagaatatgtaaggcaattaaacttgcaatttagatAATTGAATTTTTTTTAAAat < 1:817927‑M2/20‑1 (MQ=255) atacaaaggatagagcattggataaataattaccctagaagaatatttggatatagaactgcaaatgaaatggctgcttaaaacagtgttctgtaagaatatgtaaggcaattaaacttgcaatttagatAATTGAATTTTTTTTAAAat < 1:817628‑M2/20‑1 (MQ=255) aaTTTAAGCAAAAGTATTCCTATTTGTTTTATTAATTTTAAGACGAAAGTAATTTGATGCTTTTTGTGACATTATGAAAAAATAGAATTACTATTAACTTACAATCTCACCACAAATTATTATTGAATTTAATTGAATTTTTtggtaagt < 1:822425‑M2/150‑9 (MQ=255) caaaggatagagcattggataaataattaccctagaagaatatttggatatagaactgcaaatgaaatggctgcttaaaacagtgttctgtaagaatatgtaaggcaattaaacttgcaatttagatAATTGAATTTTTTTTAAAATAtt > 1:817776‑M2/128‑150 (MQ=255) tAAGCAAAAGTATTCCTATTTGTTTTATTAATTTTAAGACGAAAGTAATTTGATGCTTTTTGTGACATTATGAAAAAATAGAATTTCTATTAACTTACAATCTCACCCCAAATTATTATTGAATTTAATTGAATTTTTtggtaagttgtg > 1:823085‑M2/1‑138 (MQ=255) aggatagagcattggataaataattaccctagaagaatatttggatatagaactgcaaatgaaatggctgcttaaaacagtgttctgtaagaatatgtaaggcaattaaacttgcaatttagatAATTGAATTTTTTTTAAAATAttgtt > 1:817780‑M2/125‑150 (MQ=255) aGCAAAAGTATTCCTATTTGTTTTATTAATTTTAAGACGAAAGTAATTTGATGCTTTTTGTGACATTATGAAAAAATAGAATTACTATTAACTTACAATCTCACCACAAATTATTATTGAATTTAATTGAATTTTTtggtaagttgtaaa < 1:822820‑M2/150‑15 (MQ=255) aGCAAAAGTATTCCTATTTGTTTTATTAATTTTAAGACGAAAGTAATTTGATGCTTTTTGTGACATTATGAAAAAATAGAATTACTATTAACTTACAATCTCACCACAAATTATTATTGAATTTAATTGAATTTTTtggtaagttgtaaa > 1:822977‑M2/1‑136 (MQ=255) aGCAAAAGTATTCCTATTTGTTTTATTAATTTTAAGACGAAAGTAATTTGATGCTTTTTGTGACATTATGAAAAAATAGAATTACTATTAACTTACAATCTCACCACAAATTATTATTGAATTTAATTGAATTTTTtggtaagttgtaaa > 1:822834‑M2/1‑136 (MQ=255) agagcattggataaataattaccctagaagaatatttggatatagaactgcaaatgaaatggctgcttaaaacagtgttctgtaagaatatgtaaggcaattaaacttgcaatttagatAATTGAATTTTTTTTAAAATATTGTTGACta > 1:817786‑M2/120‑150 (MQ=255) gTATTCCTATTTGTTTTATTAATTTTAAGACGAAAGTAATTTGATGCTTTTTGTGACATTATGAAAAAATAGAATTACTATTAACTTACAATCTCACCACAAATTATTATTGAATTTAATTGAATTTTTtggtaagttgtaaaattaatt > 1:822830‑M2/1‑129 (MQ=255) aTTCCTATTTGTTTTATTAATTTTAAGACGAAAGTAATTTGATGCTTTTTGTGACATTATGAAAAAATAGAATTACTATTAACTTACAATCTCACCACAAATTATTATTGAATTTAATTGAATTTTTtggtaagttgtaaaattaattgc < 1:822407‑M2/150‑24 (MQ=255) attggataaataattaccctagaagaatatttggatatagaactgcaaatgaaatggctgcttaaaacagtgttctgtaagaatatgtcaggcaattaaacttgcaatttagatAATTGAATTTTTTTTAAAATATTGTTGACTattatt > 1:813513‑M2/115‑150 (MQ=255) ggataaataattaccctagaagaatatttggatatagaactgcaaatgaaatggctgcttaaaacagtgttctgtaagaatatgtaaggcaattaaacttgcaatttagatAATTGAATTTTTTTTAAAATATTGTTGACTATTATTGGc < 1:817614‑M2/39‑1 (MQ=255) ttGTTTTATTAATTTTAAGACGAAAGTAATTTGATGCTTTTTGTGACATTATGAAAAAATAGAATTACTATTAACTTACAATCTCACCACAAATTATTATTGAATTTAATTGAATTTTTtggtaagttgtaaaattaattgcccaaacat > 1:822826‑M2/1‑119 (MQ=255) aaataattaccctagaagaatatttggatatagaactgcaaatgaaatggctgcttaaaacagtgttctgtaagaatatgtaaggcaattaaacttgcaatttagatAATTGAATTTTTTTTAAAATATTGTTGACTATTATTGGCAttt < 1:812841‑M2/43‑1 (MQ=255) tGTTTTATTAATTTTAAGACGAAAGTAATTTGATGCTTTTTGTGACATTATGAAAAAATAGAATTACTATTAACTTACAATCTTACCACAAATTATTATTGAATTTAATTGAATTTTTtggtaagttgtaaaattaattgcccaaacata < 1:822714‑M2/150‑33 (MQ=255) taattaccctagaagaatatttggatatagaactgcaaatgaaatggctgcttaaaacagtgttctgtaagaatatgtaaggcaattaaacttgcaatttagatAATTGAATTTTTTTTAAAATATTGTTGACTATTATTGGCATTTATg > 1:820415‑M2/105‑150 (MQ=255) ttattaATTTTAAGACGAAAGTAATTTGATGCTTTTTGTGACATTATGAAAAAATAGAATTACTATTAACTTACAATCTCACCACAAATTATTATTGAATTTAATTGAATTTTTtggtaagttgtaaaattaattgcccaaacataataa > 1:822764‑M2/1‑114 (MQ=255) tattaATTTTAAGACGAAAGTAATTTGATGCTTTTTGTGACATTATGAAAAAATAGAATTACTATTAACTTACAATCTCACCACAAATTATTATTGAATTTAATTGAATTTTTtggtaagttgtaaaattaattgcccaaacataataaa < 1:813561‑M2/150‑38 (MQ=255) taccctagaagaatatttggatatagaactgcaaatgaaatggctgcttaaaacagtgttctgtaagaatatgtaaggcaattaaacttgcaatttagatAATTGAATTTTTTTTAAAATATTGTTGACTATTATTGGCATTTATGGTAt > 1:820391‑M2/101‑150 (MQ=255) taccctagaagaatatttggatatagaactgcaaatgaaatggctgcttaaaacagtgttctgtaagaatatgtaaggcaattaaacttgcaatttagatAATTGAATTTTTTTTAAAATATTGTTGACTATTATTGGCATTTATGGTAt < 1:818111‑M2/50‑1 (MQ=255) cctagaagaatatttggatatagaactgcaaatgaaatggctgcttaaaacagtgttctgtaagaatatgtaaggcaattaaacttgcaatttagatAATTGAATTTTTTTTAAAATATTGTTGACTATTATTGGCATTTATGGTATCAt > 1:820385‑M2/98‑150 (MQ=255) ctagaagaatatttggatatagaactgcaaatgaaatggctgcttaaaacagtgttctgtaagaatatgtaaggcaattaaacttgcaatttagatAATTGAATTTTTTTTAAAATATTGTTGACTATTATTGGCATTTATGGTATCATg < 1:813496‑M2/54‑1 (MQ=255) ttttAAGACGAAAGTAATTTGATGCTTTTTGTGACATTATGAAAAAATAGAATTACTATTAACTTACAATCTCACCACAAATTATTATTGAATTTAATTGAATTTTTtggtaagttgtaaaattaattgcccaaacataataaaaaagag < 1:813085‑M2/150‑44 (MQ=255) aagaatatttggatatagaactgcaaatgaaatggctgcttaaaacagtgttctgtaagaatatgtaaggcgattaaacttgcaatttagatAATTGAATTTTTTTTAAAATATTGTTGACTATTATTGGCATTTATGGTATCATGGaaa > 1:820501‑M2/93‑150 (MQ=255) aaGACGAAAGTAATTTGATGCTTTTTGTGACATTATGAAAAAATAGAATTACTATTAACTTACAATCTCACCACAAATTATTATTGAATTTAATTGAATTTTTtggtaagttgtaaaattaattgcccaaacataataaaaaagagtgac > 1:822760‑M2/1‑103 (MQ=255) aGACGAAAGTAATTTGATGCTTTTTGTGACATTATGAAAAAATAGAATTACTATTAACTTACAATCTCACCACAAATTATTATTGAATTTAATTGAATTTTTtggtaagttgtaaaattaattgcccaaacataataaaaaagagtgact < 1:822720‑M2/150‑49 (MQ=255) aatatttggatatagaactgcaaatgaaatggctgcttaaaacagtgttctgtaagaatatgtaaggcaattaaacttgcaatttagatAATTGAATTTTTTTTAAAATATTGTTGACTATTATTGGCATTTATGGTATCATGGAAAGTg > 1:813502‑M2/90‑150 (MQ=255) tttggatatagaactgcaaatgaaatggctgcttaaaacagtgttctgtaagaatatgtaaggcaattaaacttgcaatttagatAATTGAATTTTTTTTAAAATATTGTTGACTATTATTGGCATTTATGGTATCATGGAAAGTGAGaa > 1:820605‑M2/86‑150 (MQ=255) aaGTAATTTGATGCTTTTTGTGACATTATGAAAAAATAGAATTACTATTAACTTACAATCTCACCACAAATTATTATTGAATTTAATTGAATTTTTtggtaagttgtaaaattaattgcccaaacataataaaaaagagtgactcacttc < 1:813407‑M2/150‑55 (MQ=255) tAATTTGATGCTTTTTGTGACATTATGAAAAAATAGAATTACTATTAACTTACAATCTCACCACAAATTATTATTGAATTTAATTGAATTTTTtggtaagttgtaaaattaattacccaaacataataaaaaagagtgactcacttcgga < 1:813575‑M2/150‑58 (MQ=255) gatatagaactgcaaatgaaatggctgcttaaaacagtgttctgtaagaatatgtaaggcaattaaacttgcaatttagatAATTGAATTTTTTTTAAAATATTGTTGACTATTATTGGCATTTATGGTATCATGGAAAGTGAGAAGttt > 1:820377‑M2/82‑150 (MQ=255) ttGATGCTTTTTGTGACATTATGAAAAAATAGAATTACTATTAACTTACAATCTCACCACAAATTATTATTGAATTTAATTGAATTTTTtggtaagttgtaaaattaattgcccaaacataataaaaaagagtgactcacttcggaattt > 1:789647‑M2/1‑89 (MQ=255) ttGATGCTTTTTGTGACATTATGAAAAAATAGAATTACTATTAACTTACAATCTCACCACAAATTATTATTGAATTTAATTGAATTTTTtggtaagttgtaaaattaattgcccaaacataataaaaaagagtgactcacttcggaattt < 1:822724‑M2/150‑62 (MQ=255) tagaactgcaaatgaaatggctgcttaaaacagtgttctgtaagaatatgtaaggcaattaaacttgcaatttagatAATTGAATTTTTTTTAAAATATTGTTGACTATTATTGGCATTTATGGTATCATGGAAAGTGAGAAGTTTGTCg < 1:817923‑M2/73‑1 (MQ=255) tgcaaatgaaatggctgcttaaaacagtgttctgtaagaatatgtaaggcaattaaacttgcaatttagatAATTGAATTTTTTTTAAAATATTGTTGACTATTATTGGCATTTATGGTATCATGGAAAGTGAGAAGTTTGTCGAATACt < 1:818105‑M2/79‑1 (MQ=255) cTTTTTGTGACATTATGAAAAAATAGAATTACTATTAACTTACAATCTCACCACAAATTATTATTGAATTTAATTGAATTTTTtggtaagttgtaaaattaattgcccaaacataataaaaaagagtgactcacttcggaatttctgata > 1:822754‑M2/1‑83 (MQ=255) tttttGTGACATTATGAAAAAATAGAATTACTATTAACTTACAATCTCACCACAAATTATTATTGAATTTAATTGAATTTTTtggtaagttgtaaaattaattgcccaaacataataaaaaagagtgactcacttcggaatttctgataa < 1:822728‑M2/150‑69 (MQ=255) tttttGTGACATTATGAAAAAATAGAATTACTATTAACTTACAATCTCACCACAAATTATTATTGAATTTAATTGAATTTTTtggtaagttgtaaaattaattgcccaaacataataaaaaagagtgactcacttcggaatttctgataa > 1:823113‑M2/1‑82 (MQ=255) caaatgaaatggctgcttaaaacagtgttctgtaagaatatgtaaggcaattaaacttgcaatttagatAATTGAATTTTTTTTAAAATATTGTTGACTATTATTGGCATTTATGGTATCATGGAAAGTGAGAAGTTTGTCGAATACTGt < 1:818173‑M2/81‑1 (MQ=255) atgaaatggctgcttaaaacagtgttctgtaagaatatgtaaggcaattaaacttgcaatttagatAATTGAATTTTTTTTAAAATATTGTTGACTATTATTGGCATTTATGGTATCATGGAAAGTGAGAAGTTTGTCGAATACTGTATg < 1:818119‑M2/84‑1 (MQ=255) gtgACATTATGAAAAAATAGAATTACTATTAACTTACAATCTCACCACAAATTATTATTGAATTTAATTGAATTTTTtggtaagttgtaaaattaattgcccaaacataataaaaaagagtgactcacttcggaatttctgataatgttt < 1:822732‑M2/150‑74 (MQ=255) tgACATTATGAAAAAATAGAATTACTATTAACTTACAATCTCACCACAAATTATTATTGAATTTAATTGAATTTTTtggtaagttgtaaaattaattgcccaaacataataaaaaagagtgactcacttcggaatttctgataatgtttt > 1:789639‑M2/1‑76 (MQ=255) aaatggctgcttaaaacagtgttctgtaagaatatgtaaggcaattaaacttgcaatttagatAATTGAATTTTTTTTAAAATATTGTTGACTATTATTGGCATTTATGGTATCATGGAAAGTGAGAAGTTTGTCGAATACTGTATGttt < 1:818319‑M2/87‑1 (MQ=255) aaatggctgcttaaaacagtgttctgtaagaatatgtaaggcaattaaacttgcaatttagatAATTGAATTTTTTTTAAAATATTGTTGACTATTATTGGCATTTATGGTATCATGGAAAGTGAGAAGTTTGTCGAATACTGTATGttt < 1:813526‑M2/87‑1 (MQ=255) aatggctgcttaaaacagtgttctgtaagaatatgtaaggcaattaaacttgcaatttagatAATTGAATTTTTTTTAAAATATTGTTGACTATTATTGGCATTTATGGTATCATGGAAAGTGAGAAGTTTGTCGAATACTGTATGTTTa > 1:820511‑M2/63‑150 (MQ=255) atggctgcttaaaacagtgttctgtaagaatatgtaaggcaattaaacttgcaatttagatAATTGAATTTTTTTTAAAATATTGTTGACTATTATTGGCATTTATGGTATCATGGAAAGTGAGAAGTTTGTCGAATACTGTATGTTTag > 1:813516‑M2/62‑150 (MQ=255) ctgcttaaaacagtgttctgtaagaatatgtaaggcaattaaacttgcaatttagatAATTGAATTTTTTTTAAAATATTGTTGACTATTATTGGCATTTATGGTATCATGGAAAGTGAGAAGTTTGTCGAATACTGTATGTTTAgagga > 1:813520‑M2/58‑150 (MQ=255) gcttaaaacagtgttctgtaagaatatgtaaggcaattaaacttgcaatttagatAATTGAATTTTTTTTAAAATATTGTTGACTATTATTGGCATTTATGGTATCATGGAAAGTGAGAAGTTTGTCGAATACTGTATGTTTAGaggagg < 1:818159‑M2/95‑1 (MQ=255) aaaaaaTAGAATTACTATTAACTTACAATCTCACCACAAATTATTATTGAATTTAATTGAATTTTTtggtaagttgtaaaattaattgcccaaacataataaaaaagagtgactcacttcggaatttctgataatgttttaagtgacaat < 1:813305‑M2/150‑85 (MQ=255) aaaaTAGAATTACTATTAACTTACAATCTCACCACAAATTATTATTGAATTTAATTGAATTTTTtggtaagttgtaaaattaattgcccaaacataataaaaaagagtgactcacttcggaatttctgataatgttttaagtgaccatac < 1:822738‑M2/150‑87 (MQ=255) aaaaTAGAATTACTATTAACTTACAATCTCACCACAAATTATTATTGAATTTAATTGAATTTTTtggtaagttgtaaaattaattgcccaaacataataaaaaagagtgactcacttcggaatttctgataatgttttaagtgaccatac > 1:822750‑M2/1‑64 (MQ=255) aaacagtgttctgtaagaatatgtaaggcaattaaacttgcaatttagatAATTGAATTTTTTTTAAAATATTGTTGACTATTATTGGCATTTATGGTATCATGGAAAGTGAGAAGTTTGTCGAATACTGTATGTTTAGAGGAGGATCAg < 1:818185‑M2/100‑1 (MQ=255) aTAGAATTACTATTAACTTACAATCTCACCACAAATTATTATTGAATTTAATTGAATTTTTtggtaagttgtaaaattaattgcccaaacataataaaaaagagtgactcacttcggaatttctgataatgttttaagtgaccatacaaa < 1:813325‑M2/150‑90 (MQ=255) agtgttctgtaagaatatgtaaggcaattaaacttgcaatttagatAATTGAATTTTTTTTAAAATATTGTTGACTATTATTGGCATTTATGGTATCATGGAAAGTGAGAAGTTTGTCGAATACTGTATGTTTAGAGGAGGATCAGTTAt < 1:813452‑M2/104‑1 (MQ=255) aTTACTATTAACTTACAATCTCACCACAAATTATTATTGAATTTAATTGAATTTTTtggtaagttgtaaaattaattgcccaaacataataaaaaagagtgactcgcttcggaatttctgataatgttttaagtgaccatacataaaaca > 1:2343719‑M2/1‑56 (MQ=255) cTATTAACTTACAATCTCACCACAAATTATTATTGAATTTAATTGAATTTTTtggtaagttgtaaaattaattgcccaaacataataaaaaagagtgactcacttcggaatttctgataatgttttaagtgaccatacaaaaaacattgg < 1:822742‑M2/150‑99 (MQ=255) aTTAACTTACAATCTCACCACAAATTATTATTGAATTTAATTGAATTTTTtggtaagttgtaaaattaattgcccaaacataataaaaaagagtgactcacttcggaatttctgataatgttttaagtgaccatacaaaaaacattggag > 1:822746‑M2/1‑50 (MQ=255) aagaatatgtaaggcaattaaacttgcaatttagatAATTGAATTTTTTTTAAAATATTGTTGACTATTATTGGCATTTATGGTATCATGGAAAGTGAGAAGTTTGTCGAATACTGTATGTTTAGAGGAGGATCAGTTATGAAATCTACt < 1:813448‑M2/114‑1 (MQ=255) aaCTTACAATCTCACCACAAATTATTATTGAATTTAATTGAATTTTTtggtaagttgtaaaattaattgcccaaacataataaaaaagagtgactcacttcggaatttctgataatgttttaagtgaccatacaaaaaacattggaggaa > 1:822981‑M2/1‑47 (MQ=255) aaCTTACAATCTCACCACAAATTATTATTGAATTTAATTGAAGTTTTtggtaagttgtaaaattaattgcccaaacataataaaaaagagtgactcacttcggaatttctgataatgttttaagtgaccatacaaaaaacattggaggaa > 1:820355‑M2/1‑47 (MQ=255) tgtaaggcaattaaacttgcaatttagatAATTGAATTTTTTTTAAAATATTGTTGACTATTATTGGCATTTATGGTACCATGGAAAGTGAGAAGTTTGTCGAATACTGTATGTTTAGAGGAGGATCAGTTATGAAATCTACTGGAAtca < 1:818201‑M2/121‑2 (MQ=255) aaTCTCACCACAAATTATTATTGAATTTAATTGAATTTTTtggtaagttgtaaaattaattgcccaaacataataaaaaagagtgactcacttcggaatttctgataatgttttaagtgaccatacaaaaaacattggaggaaccgaaat < 1:822546‑M2/150‑111 (MQ=255) tctcACCACAAATTATTATTGAATTTAATTGAATTTTTtggtaagttgtaaaattaattgcccaaacataataaaaaagagtgactcacttcggaatttctgataatgttttaagtgaccatacaaaaaacattggaggaaccgaaatga < 1:813553‑M2/150‑113 (MQ=255) aaggcaattaaacttgcaatttagatAATTGAATTTTTTTTAAAATATTGTTGACTATTATTGGCATTTATGGTATCATGGAAAGTGAGAAGTTTGTCGAATACTGTATGTTTAGAGGAGGATCAGTTATGAAATCTACTGGAATCGTaa < 1:818085‑M2/124‑1 (MQ=255) ctcACCACAAATTATTATTGAATTTAATTGAATTTTTtggtaagttgtaaaattaattgcccaaacataataaaaaagagtgactcactgcggaatttctgataatgttttaagtgaccatacaaaaaacattggaggaaccgaaatgag > 1:822700‑M2/1‑37 (MQ=255) taaacttgcaatttagatAATTGAATTTTTTTTAAAATATTGTTGACTATTATTGGCATTTATGGTATCATGGAAAGTGAGAAGTTTGTCGAATACTGTATGTTTAGAGGAGGATCAGTTATGAAATCTACTGGAATCGTAAGAAAAGTc > 1:820425‑M2/19‑150 (MQ=255) taaacttgcaatttagatAATTGAATTTTTTTTAAAATATTGTTGACTATTATTGGCATTTATGGTATCATGGAAAGTGAGAAGTTTGTCGAATACTGTATGTTTAGAGGAGGATCAGTTATGAAATCTACTGGAATCGTAAGAAAAGTc < 1:817745‑M2/132‑1 (MQ=255) aaacttgcaatttagatAATTGAATTTTTTTTAAAATATTGTTGACTATTATTGGCATTTATGGTATCATGGAAAGTGAGAAGTTTGTCGAATACTGTATGTTTAGAGGAGGATCAGTTATGAAATCTACTGGAATCGTAAGAAAAGTCg > 1:813458‑M2/18‑150 (MQ=255) attattattGAATTTAATTGAATTTTTtggtaagttgtaaaattaattgcccaaacataataaaaaagagtgactcacttcggaatttctgataatgttttaagtgaccatacaaaaaacattggaggaaccgaaatgagtcaacataat > 1:822696‑M2/1‑27 (MQ=255) acttgcaatttagatAATTGAATTTTTTTTAAAATATTGTTGACTATTATTGGCATTTATGGTATCATGGAAAGTGAGAAGTTTGTCGAATACTGTATGTTTAGAGGAGGATCAGTTATGAAATCTACTGGAATCGTAAGAAAAGTCGAt < 1:813444‑M2/135‑1 (MQ=255) ttgcaatttagatAATTGAATTTTTTTTAAAATATTGTTGACTATTATTGGCATTTATGGTATCATGTAAAGTGAGAAGTTTGTCGAATACTGTATGTTTAGAGGAGGATCAGTTATGAAATCTACTGGAATCGTAAGAAAAGTCGATGa > 1:820419‑M2/14‑150 (MQ=255) ttgcaatttagatAATTGAATTTTTTTTAAAATATTGTTGACTATTATTGGCATTTATGGTATCATGGAAAGTGAGAAGTTTGTCGAATACTGTATGTTTAGAGGAGGATCAGTTATGAAATCTACTGGAATCGTAAGAAAAGTCGATGa > 1:820505‑M2/14‑150 (MQ=255) caatttagatAATTGAATTTTTTTTAAAATATTGTTGACTATTATTGGCATTTATGGTATCATGGAAAGTGAGAAGTTTGTCGAATACTGTATGTTTAGAGGAGGATCAGTTATGAAATCTACTGGAATCGTAAGAAAAGTCGATGAAtt > 1:813462‑M2/11‑150 (MQ=255) aaTTTAATTGAATTTTTtggtaagttgtaaaattaattgcccaaacataataaaaaagagtgactcacttcggaatttctgataatgttttaagtgaccatacaaaaaacattggaggaaccgaaatgagtcaacataataataccacga > 1:822553‑M2/1‑17 (MQ=255) agatAATTGAATTTTTTTTAAAATATTGTTGACTATTATTGGCATTTATGGTATCATGGAAAGTGAGAAGTTTGTCGAATACTGTATGTTTAGAGGAGGATCAGTTATGAAATCTACTGGAATCGTAAGAAAAGTCGATGAATTAGGAAg > 1:820405‑M2/5‑150 (MQ=255) agatAATTGAATTTTTTTTAAAATATTGTTGACTATTATTGGCATTTATGGTATCATGGAAAGTGAGAAGTTTGTCGAATACTGTATGTTTAGAGGAGGATCAGTTATGAAATCTACTGGAATCGTAAGAAAAGTCGATGAATTAGGAAg > 1:820621‑M2/5‑150 (MQ=255) tttAATTGAATTTTTtggtaagttgtaaaattgattgcccaaacataataaaaaagagtgactcacttcggaatttctgataatgttttaagtgaccatacaaaaaacattggaggaaccgaaatgagtcaacataataataccacgaag > 1:822958‑M2/1‑15 (MQ=255) tAATTGAATTTTTTTTAAAATATTGTTGACTATTATTGGCATTTATGGTATCATGGAAAGTGAGAAGTTTGTCGAATACTGTATGTTTAGAGGAGGATCAGTTATGAAATCTACTGGAATCGTAAGAAAAGTCGATGAATTAGGAAGGGt > 1:813466‑M2/2‑150 (MQ=255) aTTGAATTTTTtggtaagttgtaaaattaattgcccaaacataataaaaaagagtgactcacttcggaatttctgataatgttttaagtgaccatacaaaaaacattggaggaaccgaaatgagtcaacataataataccacgaaggaaa > 1:822688‑M2/1‑11 (MQ=255) ttGAATTTTTtggtaagttgtaaaattaattgcccaaacataataaaaaagagtgactcacttcggaatttctgataatgttttaagtgaccatacaaaaaacattggaggaaccgaaatgagtcaacataataataccacgaaggaaag < 1:822564‑M2/150‑141 (MQ=255) ttGAATTTTTtggtaagttgtaaaattaattgcccaaacataataaaaaagagtgactcacttcggaatttctgataatgttttaagtgaccatacaaaaaacattggaggaaccgaaatgagtcaacataataataccacgaaggaaag < 1:822560‑M2/150‑141 (MQ=255) ttGAATTTTTtggtaagttgtaaaattaattgcccaaacataataaaaaagagtgactcacttcggaatttctgataatgttttaagtgaccatacaaaaaacattggaggaaccgaaatgagtcaacataataataccacgaaggaaag > 1:822795‑M2/1‑10 (MQ=255) ttGAATTTTTTTTAAAATATTGTTGACTATTATTGGCATTTATGGTATCATGGAAAGTGAGAAGTTTGTCGAATACTGTATGTTTAGAGGAGGATCAGTTATGAAATCTACTGGAATCGTAAGAAAAGTCGATGAATTAGGAAGGgttgt < 1:817727/150‑1 (MQ=255) tGAATTTTTTTTAAAATATTGTTGACTATTATTGGCATTTATGGTATCATGGAAAGTGAGAAGTTTGTCGAATACTGTATGTTTAGAGGAGGATCAGTTATGAAATCTACTGGAATCGTAAGAAAAGTCGATGAATTAGGAAGGgttgtt < 1:813440/150‑1 (MQ=255) gAATTTCTtggtaagttgtaaaattaattgcccaaacatcataaaaaagagtgactcacttcggaatttttgataatgttttaagtgaccatacaaaaaatattggaggaaccgaaatgagtcaacataataataccacgaaggaaagac < 1:813293‑M2/150‑143 (MQ=255) aaTTTTTTTTAAAATATTGTTGACTATTATTGGCATTTATGGTATCATGGAAAGTGAGAAGTTTGTCGAATACTGTATGTTTAGAGGAGGATCAGTTATGAAATCTACTGGAATCGTAAGAAAAGTCGATGAATTAGGAAGGGTTGTTCt > 1:813470/1‑150 (MQ=255) ttttttggtaagttgtaaaattaattgcccaaacataataaaaaagagtgactcacttcggaatttctgataatgttttaagtgaccatacaaaaaacattggaggaaccgaaatgagtcaacataataataccacgaaggaaagacatt < 1:822570‑M2/150‑146 (MQ=255) tttttAAAATATTGTTGACTATTATTGGCATTTATGGTATCATGGAAAGTGAGAAGTTTGTCGAATACTGTATGTTTAGAGGAGGATCAGTTATGAAATCTACTGGAATCGTAAGAAAAGTCGATGAATTAGGAAGGGTTGTTCTGCCTa < 1:813436/150‑1 (MQ=255) tttttAAAATATTGTTGACTATTATTGGCATTTATGGTATCATGGAAAGTGAGAAGTTTGTCGAATACTGTATGTTTAGAGGAGGATCAGTTATGAAATCTACTGGAATCGTAAGAAAAGTCGATGAATTAGGAAGGGTTGTTCTGCCTa < 1:817749/150‑1 (MQ=255) ttttAAAATATTGTTGACTATTATTGGCATTTATGGTATCATGGAAAGTGAGAAGTTTGTCGAATACTGTATGTTTAGAGGAGGATCAGTTATGAAATCTACTGGAATCGTAAGAAAAGTCGATGAATTAGGAAGGGTTGTTCTGCCTAt > 1:820429/1‑150 (MQ=255) ttggtaagttgtaaaattaattgcccaaacataataaaaaagagtgactcacttcggaatttctgataatgttttaagtgaccatacaaaaaacattggaggaaccgaaatgagtcaacataataataccacgaaggaaagacattttaa < 1:822578‑M2/150‑150 (MQ=255) ttggtaagttgtaaaattaattgcccaaacataataaaaaagagtgactcacttcggaatttctgataatgttttaagtgaccatacaaaaaacattggaggaaccgaaatgaggcaacataataataccacgaaggaaagacattttaa > 1:822678‑M2/1‑1 (MQ=255) | ATAGCTTAATTTAAGCAAAAGTATTCCTATTTGTTTTATTAATTTTAAGACGAAAGTAATTTGATGCTTTTTGTGACATTATGAAAAAATAGAATTACTATTAACTTACAATCTCACCACAAATTATTATTGAATTTAATTGAATTTTTTTTAAAATATTGTTGACTATTATTGGCATTTATGGTATCATGGAAAGTGAGAAGTTTGTCGAATACTGTATGTTTAGAGGAGGATCAGTTATGAAATCTACTGGAATCGTAAGAAAAGTCGATGAATTAGGAAGGGTTGTTCTGCCTAT > CP002416/3242030‑3242327 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |