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                                 tcCTTTAAAATATCAGCCTGCTTCTTAAAATCCTTCAAAGCAAGAAATTTATCCATAAGTCCTTCAGACAATTCCTTCGGACCTCTGTATTTCATATATTCCAGTATCTGCGCTCTTAAAACCTCCGGCTCCGACAGGTTATATATTGGc   >  1:1002439/1‑150 (MQ=37)
                                 tcCTTTAAAATATCAGCCTGCTTCTTAAAATCCTTCAAAGCAAGAAATTTATCCATAAGTCCTTCAGACAATTCCTTCGGACCTCTGTATTTCATATATTCCAGTATCTGCGCTCTTAAAACCTCCGGCTCCGACAGGTTATATATTGGc   >  1:1002550/1‑150 (MQ=37)
                                  ccTTTAAAATATCAGCCTGCTTCTTAAAATCCTTCAAAGCAAGAAATTTATCCATAAGTCCTTCAGACAATTCCTTCGGACCTCTGTATTTCATATATTCCAGTATCTGCGCTCTTAAAACCTCCGGTTCCGACAGGTTATATATTggtt  <  1:1002168/150‑3 (MQ=21)
                                  ccTTTAAAATATCAGCCTGCTTCTTAAAATCCTTCAAAGCAAGAAATTTATCCATAAGTCCTTCAGACAATTCCTTCGGACCTCTGTATTTCATATATTCCAGTATCTGCGCTCTTAAAACCTCCGGTTCCGACAGGTTATATATTggtt  <  1:1001982/150‑3 (MQ=21)
                                  ccTTTAAAATATCAGCCTGCTTCTTAAAATCCTTCAAAGCAAGAAATTTATCCATAAGTCCTTCAGACAATTCCTTCGGACCTCTGTATTTCATATATTCCAGTATCTGCGCTCTTAAAACCTCCGGTTCCGACAGGTTATATATTggtt  <  1:1001615/150‑3 (MQ=21)
                                  ccTTTAAAATATCAGCCTGCTTCTTAAAATCCTTCAAAGCAAGAAATTTATCCATAAGTCCTTCAGACAATTCCTTCGGACCTCTGTATTTCATATATTCCAGTATCTGCGCTCTTAAAACCTCCGGTTCCGACAGGTTATATATTggtt  >  1:1001546/1‑148 (MQ=21)
                                  ccTTTAAAATATCAGCCTGCTTCTTAAAATCCTTCAAAGCAAGAAATTTATCCATAAGTCCTTCAGACAATTCCTTCGGACCTCTGTATTTCATATATTCCAGTATCTGCGCTCTTAAAACCTCCGGTTCCGACAGGTTATATATTggtt  >  1:1001469/1‑148 (MQ=21)
                                  ccTTTAAAATATCAGCCTGCTTCTTAAAATCCTTCAAAGCAAGAAATTTATCCATAAGTCCTTCAGACAATTCCTTCGGACCTCTGTATTTCATATATTCCAGTATCTGCGCTCTTAAAACCTCCGGCTCCGACAGGTTATATATTGGCt  <  1:1002615/150‑1 (MQ=38)
                                  |                                                                                                                                                     
ATCTCCGTTAAATTCTTGTCAACATCAAGCTTCTCCTTTAAAATATCAGCCTGCTTCTTAAAATCCTTCAAAGCAAGAAATTTATCCATAAGTCCTTCAGACAATTCCTTCGGACCTCTGTATTTCATATATTCCAGTATCTGCGCTCTTAAAACCTCCGGCTCCGACAGGTTATATATTGGCT  >  CP002416/2940882‑2941065

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: