| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP002416 | 712028 = | 170 (1.020) | 64 (0.400) +CGGTTCG |
20/282 | 14.2 | 31.9% | coding (3205/4848 nt) | Clo1313_0628 | cellulosome anchoring protein cohesin region |
| ? | CP002416 | = 712278 | 117 (0.700) | coding (3455/4848 nt) | Clo1313_0628 | cellulosome anchoring protein cohesin region | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
GTCTGACGGTGTCGGTTCGTCTGATGGTGTATCCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP002416/712168‑712028‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TCTGATGGTGTATCCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTG < CP002416/712278‑712194 ||||||| GTCTGACGGTGTCGGTTCGGCTGATGGTGTATCCGTCGGTGTCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGT < 1:49358/145‑1 TCTGACGGTGTCGGTTCGTCTGATGGTGTATCCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGT < 1:49627/144‑1 GACGGTGTCGGTTCGTCTGATGGTGTATCCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGTTCGTC > 1:49365/1‑146 GGTGTCGGTTCGTCTGATGGTGTATCCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGCGTTGGCTCATCAGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGTTCGTCTGATGGT > 1:49373/1‑150 CGGTTCGTCTGATGGTGTATCCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGTGTTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGTT > 1:49407/1‑134 CGGTTCGTCTGATGGTGTATCCGGGGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGTTC < 1:2911592/135‑1 TCGTCTGATGGTGTATCCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGCCGGTGTCGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGTTC > 1:50478/1‑131 CGTCTGATGGTGTATCCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTGGGTT > 1:49624/1‑129 TCTGATGGTGTATCCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTTGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTCACGGTGTCGGTTCCTCTGATGGTG > 1:50378/1‑139 ATGGTGTATCCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGGGTCGGTTCGTCAGATGGTG > 1:49471/1‑135 ATGGTGTATCCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGGCGGTTCATCAGATGGTGTTTGCCCGTCAGACGGGGTTGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGTTCGTCTGATGGTGT > 1:50092/1‑136 GGTGTATCCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGTTCGTC > 1:49610/1‑125 TATCCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGGGTCGGTTCGTCTGAT > 1:50692/1‑125 CCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTTGGTTCGTCTGATGGTGT > 1:49524/1‑127 CCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGGGTTGGCTCATCAGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGTTCGTCTGATGG > 1:50518/1‑124 GTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGTTCGTCTGATG > 1:49598/1‑121 GTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGTGTAggc > 1:49534/1‑126 GGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGAGTCGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGTTCGTCTGATGGcg > 1:50000/1‑119 TATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTTGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGTTCGTCTGATGGTGTAGCCGTCGGTATCGG > 1:49944/1‑135 TATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGTTCGTCTGATGGTGTATCCGTCGGTATCGG > 1:50500/1‑135 ATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTTGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGGTCGTCTtgtgg > 1:49668/1‑111 ATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTTGGTTCGTCTGATGGTG > 1:49562/1‑118 ATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGTTCGTCTGATGGggt > 1:49558/1‑116 ATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGTTCGTCTGATGGagatcg > 1:49580/1‑116 ATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGTTCGTCTGATGGTGTATCC > 1:50409/1‑123 ATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGGGTCGGTTCGTCTGATGGTG > 1:50680/1‑118 ATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGGGTCGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGGGTCGGTTCGTCTGATGGTGga > 1:49838/1‑118 TCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTTGGTTCGTCTGATGGgg > 1:4026030/1‑115 TCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTCGGTTCATCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGTTCGTCTGGTGGCGTGTCCGGCGGTATCGG > 1:49650/1‑133 CGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTTGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGTGTAggcgt > 1:50218/1‑118 GGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTCGGTTCGTCTGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGTTCTTCTGTTGGTG > 1:2911558/1‑115 GCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGACGGTGTTGGCTCTTCAGACGGTGTTGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGTTCGGCTGATGGTGgaaagggcg > 1:50616/1‑114 TCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGTTCGTCTGATGGTGT > 1:49564/1‑113 CTCAGGTGTCTCTGCCGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTCGG < 1:49122/96‑1 CAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGTTCGTCTGGTGGTG > 1:49622/1‑108 CAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGTGT > 1:50030/1‑109 CAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGGCGGTTCGTCTGATGG > 1:4011107/1‑106 AGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGTTCGTCTGATGGTGTAgcc > 1:49512/1‑109 GGTGTGTCTGACGGAGTCGGTTACTCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTTGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGT < 1:49262/93‑1 gttctTCTGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTTGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGTTCGTCTGATGGTGTA < 1:50422/102‑1 GTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGACGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGT > 1:50956/1‑102 CTCTGACGGTGTCGGTTGCTCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTTGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGTTCGTCTGATGGTGTATCCGTCGGTATCG < 1:3996637/116‑1 CTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGTTCGTCTGATGGTGTATCCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATC > 1:49151/1‑150 CTGACGGGGTTGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCTGGCGGTGTTGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGTTCGTCTGATGGTGTATCCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGAC < 1:50017/134‑1 CTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGCGTTGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGCGTCGGTTCGTCTGATGGTGTATGCGTCGGTATCGG > 1:49876/1‑115 TGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGGTGGTTCGTCTGATGGTGTAggc > 1:50006/1‑100 ACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTTGGTTCGTCTGATGGTGT > 1:2911579/1‑97 ACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGTGTATCCtccgctgtcgg > 1:50086/1‑101 ACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGGCTGACGGTGTCG > 1:3996639/1‑81 CGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTTGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGTTCGTCTGATGGTGTAGCCGTCGGTATCGG > 1:50496/1‑111 GGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGTTCGTCTGATGGTGTATGCGTCGGTATCGG > 1:50468/1‑110 GAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGGGTCGG > 1:50464/1‑79 AGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTGTGACGGCGTCGGTTCGGCAGATGGTGTAg > 1:49718/1‑94 gttGGTTCGTCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTTGGTTCGTCTGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGTTCGTCTGATGGTGTATCCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGT < 1:50080/128‑1 TCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGGCGGTTCGTCTGATGGGGTATCCGT > 1:50708/1‑92 TCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGTTCGTCTGATGGTGTAGCCGTCGGTATCGGCTCGTCAGG > 1:49594/1‑107 TGGCTCATCAGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGTGTAggc > 1:49824/1‑73 AGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGTTCGTCTGATGGTGTATCCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGctg > 1:49904/1‑113 CGGTGTCGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTGGGCTCGTCTGAT > 1:4009247/1‑55 CGGTGTCGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGTTCGTCTGATGGTGTATCCGTCGGTATCGGCTCCTCcgg > 1:50492/1‑81 CGGTGTAGGTTCGTCAGATGGTGTTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGTTCGTCTGATGGTGTATCCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCT < 1:49861/122‑1 GTTCGTCTGATGGCGTCGGCTCGTCTGACGGTGTCGGTTCGTCTGATGGTGTATCCGTCGGTATCGGCTCCTCCGGTGTTTCTGACGGAGTCGGTTCATCTGATGGTGTTGGCTCATCAGACGG > 1:4022302/1‑124 GTTCGTCAGATGGCGTCGGCTCGTCTGACGGTGTCGGTTCGTCTGATGGTGTATCCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTC < 1:49849/115‑1 CAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGTTCGTCGGATGGTGTATCCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGGCGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGT < 1:49817/119‑1 GATGGCGTCGGCTCGTCTGACGGTGTCGGTTCGTCTGATGGTGTATCCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACTGAGTCGGTTCA < 1:49286/90‑1 TGGCTCTTCTGACGGTGTCGGTTCGTCTGATGGTGTATCCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTG < 1:49390/110‑1 GCTCGTCTGACGGTGTCGGTTCGTCTGATGGTGTATCCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTT > 1:49952/1‑78 TCGTCTGACGGTGTCGGTTCGTCTGATGGTGTATCCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGGGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACG > 1:49560/1‑103 GTCTGACGGTGTCGGTTCGTCTGATGGTGTATCCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGAC > 1:49920/1‑64 TGACGGTGTCGGTTCGTCTGATGGTGTATCCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGGTCATCAGATGGGGTTGGGTCATCAGA > 1:50036/1‑96 ACGGTGTCGGTTCGTCTGATGGAGTATCCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGATTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCTGACGGT > 1:50942/1‑98 ACGGTGTCGATTCGTCTGATGGTGTATCCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGG < 1:49879/85‑1 gttttGGTTCGTCTGATGGTGTATCCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAG < 1:49412/85‑1 TGTCGGTTCGTCTGATGGTGTATCCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAG > 1:49866/1‑89 TCGGTTCGTCTGATGGTGTATCCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCA < 1:49384/86‑1 tggGTCTGCTGGCGTATCAGACGGTGTCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTG < 1:48812/86‑1 TTCGTCTGATGGTGTATCCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCAT < 1:49424/80‑1 TTCGTCTGATGGTGTATCCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCT < 1:49426/77‑1 CGTCTGATGGTGTATCCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTC < 1:50624/76‑1 GTCTGATGGTGTGCCCTTCCGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTG < 1:50648/86‑1 GTCTGATGGTGTATCCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAG < 1:49468/80‑1 ||||||| GTCTGACGGTGTCGGTTCGTCTGATGGTGTATCCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP002416/712168‑712028‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TCTGATGGTGTATCCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTG < CP002416/712278‑712194 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |