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| ? | CP002416 | 3435741 = | 0 (0.000) | coding (44/555 nt) | Clo1313_2927 | hypoxanthine phosphoribosyltransferase | |||||
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1:2451817/1‑150 CCATATCTTCTTTGTCCGTATAAACAAGTTCCTCTCTGGTAACCAAAATTTCTTTAATTTGATTTATCATGAGTTTCCTCCTAAATATACGCTTTTTTAAGCTATTTTTAATCTATATATTTTAATCTGTAATCGGGCAATTTATAAGCT < 1:610894/150‑1 CATATCTTCTTTGTCCGTATAAACAAGTTCCTCTCTGGTAACCAAAATTTCTTTAATTTGATTTATCATGAGTTTCCTCCTAAATATACGCTTTTTTAAGCTATTTTTAATCTATATATTTTAATCTGTAATCGGGCAATTTATAAGCTA > 1:1734740/1‑150 CATATCTTCTTTGTCCGTATAAACAAGTTCCTCTCTGGTAACCAAAATTTCTTTAATTTGATTTATCATGAGTTTCCTCCTAAATATACGCTTTTTTAAGCTATTTTTAATCTATATATTTTAATCTGTAATCGGGCAATTTATAAGCTA < 1:1506191/150‑1 CATATCTTCTTTGTCCGTATAAACAAGTTCCTCTCTGGTAACCAAAATTTCTTTAATTTGATTTATCATGAGTTTCCTACTAAATATACGCTTTTTTAAGCTATTTTTAATCTATATATTTTAATCTGTAATCGGGCAATTTATAAGCTA > 1:413148/1‑150 ATATCTTCTTTGTCCGTATAAACAAGTTCCTCTCTGGTAACCAAAATTTCTTTAATTTGATTTATCATGAGTTTCCTCCTAAATATACGCTTTTTTAAGCTATTTTTAATCTATATATTTTAATCTGTAATCGGGCAATTTATAAGCTAA > 1:1821274/1‑150 TATCTTCTTTGTCCGTATAAACAAGTTCCTCTCTGGTAACCAAAATTTCTTTAATTTGATTTATCATGAGTTTCCTCCTAAATATACGCTTTTTTAAGCTATTTTTAATCTATATATTTTAATCTGTAATCGGGCAATTTATAAGCTAAC > 1:65507/1‑150 TTCTTTGTCCGTATAAACAAGTTCCTCTCTGGTAACCAAAATTTCTTTAATTTGATTTATCATGAGTTTCCTCCTAAATATACGCTTTTTTAAGCTATTTTTAATCTATATATTTTAATCTGTAATCGGGCAATTTATAAGCTAACAATC > 1:554485/1‑150 TTCTTTGTCCGTATAAACAAGTTCCTCTCTGGTAACCAAAATTTCTTTAATTTGATTTATCATGAGTTTCCTCCTAAATATACGCTTTTTTAAGCTATTTTTAATCTATATATTTTAATCTGTAATCGGGCAATTTATAAGCTAACAATC > 1:1430279/1‑150 CTTTGTCCGTATAAACAAGTTCCTCTCTGGTAACCAAAATTTCTTTAATTTGATTTATCATGAGTTTCCTCCTAAATATACGCTTTTTTAAGCTATTTTTAATCTATATATTTTAATCTGTAATCGGGCAATTTATAAGCTAACAATCCA > 1:440302/1‑150 GTCCGTATAAACAAGTTCCTCTCTGGTAACCAAAATTTCTTTAATTTGATTTATCATGAGTTTCCTCCTAAATATACGCTTTTTTAAGCTATTTTTAATCTATATATTTTAATCTGTAATCGGGCAATTTATAAGCTAACAATCCATAAT > 1:1509141/1‑150 CCGTATAAACAAGTTCCTCTCTGGTAACCAAAATTTCTTTAATTTGATTTATCATGAGTTTCCTCCTAAATATACGCTTTTTTAAGCTATTTTTAATCTATATATTTTAATCTGTAATCGGGCAATTTATAAGCTAACAATCCATAATTC > 1:1123142/1‑150 CGTATAAACAAGTTCCTCTCTGGTAACCAAAATTTCTTTAATTTGATTTATCATGAGTTTCCTCCTAAATATACGCTTTTTTAAGCTATTTTTAATCTATATATTTTAATCTGTAATCGGGCAATTTATAAGCTAACAATCCATAATTCA > 1:2336915/1‑150 ACAAGTTCCTCTCTGGTAACCAAAATTTCTTTAATTTGATTTATCATGAGTTTCCTCCTAAATATACGCTTTTTTAAGCTATTTTTAATCTATATATTTTAATCTGTAATCGGGCAATTTATAAGCTAACAATCCATAATTCATAAGACC < 1:1387506/150‑1 CAAGTTCCTCTCTGGTAACCAAAATTTCTTTAATTTGATTTATCATGAGTTTCCTCCTAAATATACGCTTTTTTAAGCTATTTTTAATCTATATATTTTAATCTGTAATCGGGCAATTTATAAGCTAACAATCCATAATTCATAAGACCG > 1:2544369/1‑150 AAGTTCCTCTCTGGTAACCAAAATTTCTTTAATTTGATTTATCATGAGTTTCCTCCTAAATATACGCTTTTTTAAGCTATTTTTAATCTATATATTTTAATCTGTAATCGGGCAATTTATAAGCTAACAATCCATAATTCATAAGACCGT < 1:2688014/150‑1 CTCCTCATTCTTTATAGCAATATAGCAAAACACTATCTCTCATACATATTATTATAAAATATATATTACATTATATTAACATAACGGTATTAAAAACACAAGAAACCTTTGTATATTTTTTAGTCCATATCTTCTTTGTCCGTATAAACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP002416/3435111‑3435260‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aAGTTCCTCTCTGGTAACCAAAATTTCTTTAATTTGATTTATCATGAGTTTCCTCCTAAATATACGCTTTTTTAAGCTATTTTTAATCTATATATTTTAATCTGTAATCGGGCAATTTATAAGCTAACAATCCATAATTCATAAGACCGT > CP002416/3435741‑3435889 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |