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                                 ctcCTTTAAAATATCAGCCTGCTTCTTAAAATCCTTCAAAGCAAGAAATTTATCCATAAGTCCTTCAGACAATTCCTTCGGACCTCTGTATTTCATATATTCCAGTATCTGCGCTCTTAAAACCTCCGGTTCCGACAGGTTATATATTggt           >  1:1092455/1‑150 (MQ=21)
                                 ctcCTTTAAAATATCAGCCTGCTTCTTAAAATCCTTCAAAGCAAGAAATTTATCCATAAGTCCTTCAGACAATTCCTTCGGACCTCTGTATTTCATATATTCCAGTATCTGCGCTCTTAAAACCTCCGGTTCCGACAGGTTATATATTggt           <  1:4018045/151‑2 (MQ=21)
                                 ctcCTTTAAAATATCAGCCTGCTTCTTAAAATCCTTCAAAGCAAGAAATTTATCCATAAGTCCTTCAGACAATTCCTTCGGACCTCTGTATTTCATATATTCCAGTATCTGCGCTCTTAAAACCTCCGGCTCCGACAGGTTATATATTGGc           >  1:3232840/1‑151 (MQ=35)
                                  tcCTTTAAAATATCAGCCTGCTTCTTAAAATCCTTCAAAGCAAGAAATTTATCCATAAGTCCTTCAGACAATTCCTTCGGACCTCTGTATTTCATATATTCCAGTATCTGCGCTCTTAAAACCTCCGGTTCCGACAGGTTATATATTggtt          <  1:2389619/151‑3 (MQ=18)
                                   ccTTTAAAATATCAGCCTGCTTCTTAAAATCCTTCAAAGCAAGAAATTTATCCATAAGTCCTTCAGACAATTCCTTCGGACCTCTGTATTTCATATATTCCAGTATCTGCGCTCTTAAAACCTCCGGTTCCGACAGGTTATATATTggttg         <  1:3082513/151‑4 (MQ=18)
                                   ccTTTAAAATATCAGCCTGCTTCTTAAAATCCTTCAAAGCAAGAAATTTATCCATAAGTCCTTCAGACAATTCCTTCGGACCTCTGTATTTCATATATTCCAGTATCTGCGCTCTTAAAACCTCCGGCTCCGACAGGTTATATATTGGCTg         <  1:2308160/151‑1 (MQ=38)
                                   ccTTTAAAATATCAGCCTGCTTCTTAAAATCCTTCAAAGCAAGAAATTTATCCATAAGTCCTTCAGACAATTCCTTCGGACCTCTGTATTTCATATATTCCAGTATCTGCGCTCTTAAAACCTCCGGCTCCGACAGGTTATATATTGGCTg         <  1:3408608/151‑1 (MQ=38)
                                    cTTTAAAATATCAGCCTGCTTCTTAAAATCCTTCAAAGCAAGAAATTTATCCATAAGTCCTTCAGACAATTCCTTCGGACCTCTGTATTTCATATATTCCAGTATCTGCGCTCTTAAAACCTCCGGCTCCGACAGGTTATATATTGGCTGa        >  1:58241/1‑151 (MQ=38)
                                    cTTTAAAATATCAGCCTGCTTCTTAAAATCCTTCAAAGCAAGAAATTTATCCATAAGTCCTTCAGACAATTCCTTCGGACCTCTGTATTTCATATATTCCAGTATCTGCGCTCTTAAAACCTCCGGCTCCGACAGGTTATATATTGGCTGa        >  1:2115553/1‑151 (MQ=38)
                                     tttAAAATATCAGCCTGCTTCTTAAAATCCTTCAAAGCAAGAAATTTATCCATAAGTCCTTCAGACAATTCCTTCGGACCTCTGTATTTCATATATTCCAGTATCTGCGCTCTTAAAACCTCCGGTTCCGACAGGTTATATATTGGTTGaa       >  1:677325/1‑151 (MQ=12)
                                     tttAAAATATCAGCCTGCTTCTTAAAATCCTTCAAAGCAAGAAATTTATCCATAAGTCCTTCAGACAATTCCTTCGGACCTCTGTATTTCATATATTCCAGTATCTGCGCTCTTAAAACCTCCGGCTCCGACAGGTTATATATTGGCTGaa       >  1:2674009/1‑151 (MQ=38)
                                      ttAAAATATCAGCCTGCTTCTTAAAATCCTTCAAAGCAAGAAATTTATCCATAAGTCCTTCAGACAATTCCTTCGGACCTCTGTATTTCATATATTCCAGTATCTGCGCTCTTAAAACCTCCGGTTCCGACAGGTTATATATTGGTTGAAc      <  1:3811841/151‑1 (MQ=12)
                                      ttAAAATATCAGCCTGCTTCTTAAAATCCTTCAAAACAAGAAATTTATCCATAAGTCCTTCAGACAATTCCTTCGGACCTCTGTATTTCATATATTCCAGTATCTGCGCTCTTAAAACCTCCGGTTCCGACAGGTTATATATTGGTTGAAc      <  1:4075750/151‑1 (MQ=255)
                                       tataaTATCAGCCTGCTTCTTAAAATCCTTCAAAACAAGAAATTTATCCAAAAGTCCTTCTGACAATTCCTACGGACCTCTGTATTACTTATATTCCAGTATCTGCGCACTTAAGAAATCCGACTCCGACAGGAAATATATTGGCTGagct     <  1:3701320/148‑4 (MQ=2)
                                       tAAAATATCAGCCTGCTTCTTAAAATCCTTCAAAGCAAGAAATTTATCCATAAGTCCTTCAGACAATTCCTTCGGACCTCTGTATTTCATATATTCCAGTATCTGCGCTCTTAAAACCTCCGGTTCCGACAGGTTATATATTGGTTGAACt     >  1:1676055/1‑151 (MQ=12)
                                       tAAAATATCAGCCTGCTTCTTAAAATCCTTCAAAGCAAGAAATTTATCCATAAGTCCTTCAGACAATTCCTTCGGACCTCTGTATTTCATATATTCCAGTATCTGCGCTCTTAAAACCTCCGGCTCCGACAGGTTATATATTGGCTGAACt     <  1:297590/151‑1 (MQ=38)
                                        aaaaTATCAGCCTGCTTCTTAAAATCCTTCAAAGCAAGAAATTTATCCATAAGTCCTTCAGACAATTCCTTCGGACCTCTGTATTTCATATATTCCAGTATCTGCGCTCTTAAAACCTCCGGCTCCGACAGGTTATATATTGGCTGAACtt    >  1:2662277/1‑151 (MQ=38)
                                        aaaaTATCAGCCTGCTTCTTAAAATCCTTCAAAGCAAGAAATTTATCCATAAGTCCTTCAGACAATTCCTTCGGACCTCTGTATTTCATATATTCCAGTATCTGCGCTCTTAAAACCTCCGGCTCCGACAGGTTATATATTGGCTGAACtt    <  1:1497479/151‑1 (MQ=38)
                                        aaaaTATCAGCCTGCTTCTTAAAATCCTTCAAAGCAAGAAATTTATCCATAAGTCCTTCAGACAATTCCTTCGGACCTCTGTATTTCATATATTCCAGTATCTGCGCTCTTAAAACCTCCGGCTCCGACAGGTTATATATTGGCTGAACtt    >  1:3321199/1‑151 (MQ=38)
                                         aaaTATCAGCCTGCTTCTTAAAATCCTTCAAAGCAAGAAATTTATCCATAAGTCCTTCAGACAATTCCTTCGGACCTCTGTATTTCATATATTCCAGTATCTGCGCTCTTAAAACCTCCGGTTCCGACAGGTTATATATTGGTTGAACttt   <  1:1339501/151‑1 (MQ=12)
                                          aaTATCAGCCTGCTTCTTAAAATCCTTCAAAGCAAGAAATTTATCCATAAGTCCTTCGGACAATTCCTGAATCCCTCGGTATTTCATATATTCCAGTATCTGCGCTCTTAAAACCTCCGGCTCCGACAGGTTATATATTTGCTGAACTTTa  <  1:2956027/151‑1 (MQ=14)
                                          aaTATCAGCCTGCTTCTTAAAATCCTTCAAAGCAAGAAATTTATCCATAAGTCCTTCAGACAATTCCTTCGGACCTCTGTATTTCATATATTCCAGTATCTGCGCTCTTAAAACCTCCGGTTCCGACAGGTTATATATTGGTTGAACTTTa  <  1:2055612/151‑1 (MQ=12)
                                          aaTATCAGCCTGCTTCTTAAAATCCTTCAAAGCAAGAAATTTATCCATAAGTCCTTCAGACAATTCCTTCGGACCTCTGTATTTCATATATTCCAGTATCTGCGCTCTTAAAACCTCCGGCTCCGACAGGTTATATATTGGCTGAACTTTa  <  1:247566/151‑1 (MQ=38)
                                          aaTATCAACCTGCTTCTTAAAATCCTTCAAAGCAAGAAATTTATCCATAAGTCCTTCAGACAATTCCTTCGGACCTCTGTATTTCATATATTCCAGTATCTGCGCTCTTAAAACCTCCGGCTCCGACAGGTTATATATTGGCTGAACTTTa  >  1:518478/1‑151 (MQ=255)
                                          |                                                                                                                                                      
AATCTCCGTTAAATTCTTGTCAACATCAAGCTTCTCCTTTAAAATATCAGCCTGCTTCTTAAAATCCTTCAAAGCAAGAAATTTATCCATAAGTCCTTCAGACAATTCCTTCGGACCTCTGTATTTCATATATTCCAGTATCTGCGCTCTTAAAACCTCCGGCTCCGACAGGTTATATATTGGCTGAACTTTA  >  CP002416/2940881‑2941073

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: