| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | CP002416 | 953494 = | NA (NA) | 189 (1.070) | 133/296 | 0.2 | 100% | coding (94/99 nt) | Clo1313_0826 | hypothetical protein |
| ? | CP002416 | = 1600197 | 0 (0.000) | intergenic (+140/+53) | Clo1313_1356/Clo1313_1357 | Pyruvate/ketoisovalerate oxidoreductase, catalytic domain/glutamine synthetase catalytic region | |||||
Only 100 of 381 total aligned reads displayed.
ATGAATGTTAATGCTTAATTAATGCTACAATTATTTGATATTAAGCATTATTAATTAATATTAAACATTATTAAATTCGAAATACGGCTTTTTTGCATTTTAATGTGAAATCATTGATAAAGCCCTCCTTATTGAGAGGAGGGCCTTTTTTTGATTGTTTTGATTTTTAATTCTTATTTTTAATTCTTATACGGTAAAGATTATTACACGTTAAAGAGAAGGTCGCCGTATGTCGGGAACGGCCACATTTTTGAATCAACCAGTGTTTCGAGTTTGTCAGCCACGGCTCTGAGTTCATTCA > CP002416/1600047‑1600347 | gagtaaataaaagcaaaaaataaaaccactttagtggtggcttgagaagaatatgcggttggcgaaccattcaacgcgtcttaagacgctgcaaggaccatgcccttatagggctagagcaaaccaccggctgagccggtggttatgattt > 1:239084‑M1/149‑151 (MQ=255) gagtaaataaaagcaaaaaataaaaccactttagtggtggcttgagaagaatatgcggttggcgaaccattcaacgcgtcttaagacgctgcaaggaccatgcccttatagggctagagcaaaccaccggctgagccggtggttatgattt > 1:2306981‑M1/149‑151 (MQ=255) aataaaagcaaaaaataaaaccactttagtggtggcttgagaagaatatgcggttggcgaaccattcaacgcgtcttaagacgctgcaaggaccatgcccttatagggctagagcaaaccaccggctgagccggtggttatgaTTTGATTg > 1:3358115‑M1/144‑151 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |