| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | CP002416 | = 1123119 | 0 (0.000) | 166 (0.940) | 115/296 | 0.7 | 100% | intergenic (+36/‑55) | Clo1313_0962/Clo1313_0963 | 5‑formyltetrahydrofolate cyclo‑ligase/hypothetical protein |
| ? | CP002416 | = 2005743 | NA (NA) | intergenic (‑128/+51) | Clo1313_1710/Clo1313_R0045 | transposase IS200‑family protein/tRNA‑Leu | |||||
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GGATTGCCTGAAAATAGGAATCGCTTTTGATATTCAGGTTTTTCCGAGTATTCCGAAGGAAGAGCATGATATATTGATGGATGCGGTTGTTACGGAAAACGAAATCTATTTTTGATTGTCCGGATTAAAAATAATCCGGACAATTTTTATTATATTTTCCTTTGGCATATATATTAGTTAGCATCCACAAACGAGGTATTCGGCAATGGAGAACAGGGATTCGAAATCAAGGGTAATTATAAAAAAATACACAGGTCAGAAGAAGGCTGAAGAAATTTTGTCAAAAATCATTCAGCTGTT > CP002416/1122969‑1123268 | ggATTGCCTGAAAATAGGAATCGCTTTTGATATTCAGGTTTTTCCGAGTATTCCGAAGGAAGAGCATGATATATTGATGGATGCGGTTGTTACGGAAAACGAAATCTATTTTTGATTGTCCGGATTAAAAATAATCCGGACAATTTTTATT < 1:3095767‑M1/151‑1 (MQ=255)cgagtaaataaaagcaaaaaatgaaaccactttagtggtggcttgagaagaatatgcggttggcgaaccattcaacgcgtcttaagacgctgcaaggaccatgcccttatagggctagagcaaaccaccggctgagccggtggttatgAtt < 1:287839‑M2/3‑1 (MQ=255)cgagtaaataaaagcaaaaaataaaaccactttagtggtggcttgagaagaatatgcggttggcgaaccattcaacgcgtcttaagacgctgcaaggaccatgcccttctagggctagagcaaaccaccggctgagccggtggttatgAtt > 1:3466623‑M2/149‑151 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |