| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
CTTGTTCACTTCCGATTGTGCCTATTCTGTTTCAATTCCTCATAGGTACGATACAAACTCCTTTTCTAGCCACCGTGGTATGTAGTATGGGCCAGTTTCAATTCCTCATAGGTACGATACAAACCCGCAAGTATTTTCGCAATTTCACTCTTGGTCATTGAGTTTCAATTCCTCATAGGTACGATACAAACTATCACATGAAACTATCATTGGTCAACATCCTTGGATGTTTCAATTCCTCATAGGTACGATACAAACGTATTAGTGGATGTTTACAGAAAAACAGATTGAGGAGTT > CP002416/1930578‑1930874 | cagcaatctcattcagcgttctttctcccttgatgacctcaatcactatttttgctttttgttcaggtgtaaaatgttttctcttttccatagttccattctaacttatttgggctgttttgtctgtcttaatttttggtatcattatac > 1:659328‑M2/150‑150 (MQ=255) ttCACTTCCGATTGTGCCTATTCTGTTTCAATTCCTCATAGGTACGATACAAACTCCTTTTCTAGCCACCGTGGTATGTAGTATGGGCCAGTTTCAATTCCTCATAGGTACGATACAAACCCGCAAGTATTTTCGCAATTTCACTCTTta > 1:1040963‑M1/1‑148 (MQ=255) aatctcattcagcgttctttctcccttgatgacctcaatcactatttttgctttttgttcaggtgtaaaatgttttctcttttccatagttccattctaacttatttgggctgttttgtctgtcttaatttttggtatcattataCTTgg < 1:791094‑M2/5‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |