| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP002416 | 677,287 | A→G | intergenic (+931/+1716) | Clo1313_0606 → / ← Clo1313_0609 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP002416 | 677,287 | 0 | A | G | 99.4% | 635.5 / NA | 171 | intergenic (+931/+1716) | Clo1313_0606/Clo1313_0609 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (83/87); total (84/87) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.91e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.57e-01 | |||||||||||
Only 100 of 171 total aligned reads displayed.
CAAAAGCTCTAAAGGAAAATGTTGTGGATATCGGTAAAAGTACAGTTTGCAATCTCTTAAAAAAAAGAAACACTGGTTGTTGACAAAAAGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGAACAATTATGATAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTAAAAACATATCCAAATCTTAGTGTGATATCAAGAGATGGATCTGTTATCTATAATAATGCAATTGC > CP002416/677141‑677433 | cAAAAGCTCTAAAGGAAAATGTTGTGGATATCGGTAAAAGTACAGTTTGCAATCTCTTAAAAAAAAGAAACACTGGTTGTTGACAAAAAGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACaa > 1:1526694/1‑151 (MQ=255) aaGCTCTAAAGGAAAATGTTGTGGATATCGGTAAAAGTACAGTTTGCAATCTCTTAAAAAAAAGAAACACTGGTTGTTGACAAAAAGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTa < 1:1525523/151‑1 (MQ=255) tctctAAAGGAAAATGTTGTGGATATCGGTAAAAGTACAGTTTGCAATCTCTTAAAAAAAAGAAACACTGGTTGTTGACAAAAAGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATg > 1:3021139/2‑151 (MQ=255) tctAAAGGAAAATGTTGTGGATATCGGTAAAAGTACAGTTTGCAATCTCTTAAAAAAAAGAAACACTGGTTGTTGACAAAAAGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATggt < 1:2658962/151‑3 (MQ=255) ctAAAGGAAAATGTTGTGGATATCGGTAAAAGTACAGTTTGCAATCTCTTAAAAAAAAGAAACACTGGTTGTTGACAAAAAGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATggta > 1:1212037/1‑148 (MQ=255) aaaTGTTGTGGATATCGGTAAAAGTACAGTTTGCAATCTCTTAAAAAAAAGAAACACTGGTTGTTGACAAAAAGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATAtttt < 1:828086/151‑1 (MQ=255) aTGTTGTGGATATCGGTAAAAGTACAGTTTGCAATCTCTTAAAAAAAAGAAACACTGGTTGTTGACAAAAAGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTa > 1:3165223/1‑151 (MQ=255) gttgtGGATATCGGTAAAAGTACAGTTTGCAATCTCTTAAAAAAAAGAAACACTGGTTGTTGACAAAAAGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACg < 1:843824/151‑1 (MQ=255) ttgtGGATATCGGTAAAAGTACAGTTTGCAATCTCTTAAAAAAAAGAAACACTGGTTGTTGACAAAAAGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGc < 1:2930874/151‑1 (MQ=255) tgtgGATATCGGTAAAAGTACAGTTTGCAATCTCTTAAAAAAAAGAAACACTGGTTGTTGACAAAAAGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCa < 1:2027809/151‑1 (MQ=255) gATATCGGTAAAAGTACAGTTTGCAATCTCTTAAAAAAAAGAAACACTGGTTGTTGACAAAAAGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCaa > 1:757039/1‑151 (MQ=255) atatCGGTAAAAGTACAGTTTGCAATCTCTTAAAAAAAAGAAACACTGGTTGTTGACAAAAAGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCaaa > 1:2916112/1‑151 (MQ=255) tatCGGTAAAAGTACAGTTTGCAATCTCTTAAAAAAAAGAAACACTGGTTGTTGACAAAAAGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAAt < 1:2354976/151‑1 (MQ=255) tatCGGTAAAAGTACAGTTTGCAATCTCTTAAAAAAAAGAAACACTGGTTGTTGACAAAAAGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAAt < 1:2623267/151‑1 (MQ=255) tatCGGTAAAAGTACAGTTTGCAATCTCTTAAAAAAAAGAAACACTGGTTGTTGACAAAAAGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAAt < 1:2940055/151‑1 (MQ=255) tatCGGTAAAAGTACAGTTTGCAATCTCTTAAAAAAAAGAAACACTGGTTGTTGACAAAAAGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAAt < 1:3390512/151‑1 (MQ=255) tatCGGTAAAAGTACAGTTTGCAATCTCTTAAAAAAAAGAAACACTGGTTGTTGACAAAAAGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAAt < 1:708526/151‑1 (MQ=255) cGGTAAAAGTACAGTTTGCAATCTCTTAAAAAAAAGAAACACTGGTTGTTGACAAAAAGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACt > 1:2214372/1‑151 (MQ=255) cGGTAAAAGTACAGTTTGCAATCTCTTAAAAAAAAGAAACACTGGTTGTTGACAAAAAGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACt > 1:2464672/1‑151 (MQ=255) aaaaGTACAGTTTGCAATCTCTTAAAAAAAAGAAACACTGGTTGTTGACAAAAAGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATGTTTTTACGCATCAAATACTTGat < 1:726576/151‑1 (MQ=255) aaaaGTACAGTTTGCAATCTCTTAAAAAAAAGAAACACTGGTTGTTGACAAAAAGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGat > 1:1612808/1‑151 (MQ=255) aaGTACAGTTTGCAATCTCTTAAAAAAAAGAAACACTGGTTGTTGACAAAAAGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGatat < 1:293824/151‑1 (MQ=255) aGTACAGTTTGCAATCTCTTAAAAAAAAGAAACACTGGTTGTTGACAAAAAGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATg < 1:1084810/151‑1 (MQ=255) gTACAGTTTGCAATCTCTTAAAAAAAAGAAACACTGGTTGTTGACAAAAAGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGa > 1:535117/1‑151 (MQ=255) gTACAGTTTGCAATCTCTTAAAAAAAAGAAACACTGGTTGTTGACAAAAAGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGa > 1:848568/1‑151 (MQ=255) aCAGTTTGCAATCTCTTAAAAAAAAGAAACACTGGTTGTTGACAAAAAGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGAtt > 1:2075786/1‑151 (MQ=255) ttAAAAAAAAGAAACACTGGTTGTTGACAAAAAGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTAt < 1:1062757/151‑1 (MQ=255) tAAAAAAAAGAAACACTGGTTGTTGACAAAAAGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATg > 1:1108399/1‑151 (MQ=255) aaaaaaaaGAAACACTGGTTGTTGACAAAAAGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATga > 1:953278/1‑151 (MQ=255) aaaaaaGAAACACTGGTTGTTGACAAAAAGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATgaga > 1:2110908/1‑151 (MQ=255) aaaaGAAACACTGGTTGTTGACAAAAAGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACt < 1:1003131/151‑1 (MQ=255) aaGAAACACTGGTTGTTGACAAAAAGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGt < 1:3118346/151‑1 (MQ=255) aGAAACACTGGTTGTTGACAAAAAGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGtt < 1:1647137/151‑1 (MQ=255) aGAAACACTGGTTGTTGACAAAAAGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGtt < 1:1496671/151‑1 (MQ=255) gAAACACTGGTTGTTGACAAAAAGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGttt < 1:190030/151‑1 (MQ=255) aaCACTGGTTGTTGACAAAAAGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGc > 1:1006321/1‑151 (MQ=255) acacTGGTTGTTGACAAAAAGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCg > 1:1069381/1‑151 (MQ=255) cacTGGTTGTTGACAAAAAGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGa > 1:112282/1‑151 (MQ=255) cacTGGTTGTTGACAAAAAGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGa > 1:1375390/1‑151 (MQ=255) acTGGTTGTTGACAAAAAGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAg > 1:2830213/1‑151 (MQ=19) acTGGTTGTTGACAAAAAGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAg < 1:3233412/151‑1 (MQ=19) cTGGTTGTTGACAAAAAGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGt < 1:975363/151‑1 (MQ=16) cTGGTTGTTGACAAAAAGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGt < 1:2283786/151‑1 (MQ=16) ggTTGTTGACAAAAAGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTgg < 1:32924/151‑1 (MQ=12) ttgttgACAAAAAGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGtt < 1:3069042/151‑1 (MQ=12) gttgACAAAAAGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTaa > 1:1322236/1‑151 (MQ=12) tgACAAAAAGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTaaaa > 1:3356085/1‑151 (MQ=12) tgACAAAAAGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTaaaa > 1:729877/1‑151 (MQ=12) aaaaaGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTAAAAACat < 1:2552383/151‑1 (MQ=12) aaaaaGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTAAAAACat > 1:2106117/1‑151 (MQ=12) aaaGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTAAAAACatat < 1:1593880/151‑1 (MQ=12) aaaGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTAAAAACatat > 1:3314136/1‑151 (MQ=12) aaaGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGAACAATTATGATAGTTATTTTTATGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTCAAAACatat > 1:2355269/1‑151 (MQ=255) aaGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTCGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTAAAAACATATc < 1:1259105/151‑1 (MQ=255) aGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTAAAAACATATcc > 1:2650849/1‑151 (MQ=16) aCAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTAAAAACATATCCaa > 1:2671282/1‑151 (MQ=19) aGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTAAAAACATATCCAAAt > 1:875116/1‑151 (MQ=255) aaCAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTAAAAACATATCCAAATCtt < 1:726782/151‑1 (MQ=255) cAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTAAAAACATATCCAAATCTTAg > 1:904070/1‑151 (MQ=255) cAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTAAAAACATATCCAAATCTTAg < 1:2239204/151‑1 (MQ=255) aGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTAAAAACATATCCAAATCTTAgt < 1:1769422/151‑1 (MQ=255) ttgttTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTAAAAACATATCCAAATCTTAgtgt > 1:1996952/1‑151 (MQ=255) tgttTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTAAAAACATATCCAAATCTTAGtgtg > 1:1801271/1‑151 (MQ=255) tgttTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTAAAAACATATCCAAATCTTAGtgtg < 1:2303666/151‑1 (MQ=255) tGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTAAAAACATATCCAAATCTTAGTGTGatat > 1:1233887/1‑151 (MQ=255) tGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTAAAAACATATCCAAATCTTAGTGTGatat < 1:1212710/151‑1 (MQ=255) gCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTAAAAACATATCCAAATCTTAGTGTGATATc < 1:3275379/151‑1 (MQ=255) gCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTAAAAACATATCCAAATCTTAGTGTGATATc < 1:811425/151‑1 (MQ=255) cATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTAAAAACATATCCAAATCTTAGTGTGATATCa < 1:1966959/151‑1 (MQ=255) aTTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTAAAAACATATCCAAATCTTAGTGTGATATCaa > 1:1297959/1‑151 (MQ=255) gatgatTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCACCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTAAAAACATATCCAAATCTTAGTGTGAAATCAagag < 1:1420602/151‑1 (MQ=11) atgatTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTAAAAACATATCCAAATCTTAGTGTGATATCAAgaga > 1:1195378/1‑151 (MQ=255) atgatTATGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTAAAAACATATCCAAATCTTAGTGTGATTTCAAgaga < 1:1048887/151‑1 (MQ=11) tgatTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTAAAAACATATCCAAATCTTAGTGTGATATCAAGAGAt > 1:585320/1‑151 (MQ=255) gatTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTAAAAACATATCCAAATCTTAGTGTGATATCAAGAGATg > 1:603731/1‑151 (MQ=255) gatTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTAAAAACATATCCAAATCTTAGTGTGATATCAAGAGATg < 1:738219/151‑1 (MQ=255) atTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTAAAAACATATCCAAATCTTAGTGTGATATCAAGAGATgg < 1:3180045/151‑1 (MQ=255) atTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTAAAAACATATCCAAATCTTAGTGTGATATCAAGAGATgg > 1:17266/1‑151 (MQ=255) tttGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTAAAAACATATCCAAATCTTAGTGTGATATCAAGAGATGGAt < 1:2501557/151‑1 (MQ=255) tGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTAAAAACATATCCAAATCTTAGTGTGATATCAAGAGATGGATCt > 1:1193252/1‑151 (MQ=255) tGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTAAAAACATATCCAAATCTTAGTGTGATATCAAGAGATGGATCt > 1:3072087/1‑151 (MQ=255) gCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTAAAAACATATCCAAATCTTAGTGTGATATCAAGAGATGGATCTg > 1:2393629/1‑151 (MQ=255) aTTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTAAAAACATATCCAAATCTTAGTGTGATATCAAGAGATGGATCTGTTa > 1:427664/1‑151 (MQ=255) tAAAAAGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTAAAAACATATCCAAATCTTAGTGTGATATCAAGAGATGGATCTGTTATc > 1:1658481/1‑151 (MQ=255) aaaaGCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTAAAAACATATCCAAATCTTAGTGTGATATCAAGAGATGGATCTGTTATCta < 1:90487/151‑1 (MQ=255) gCGAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTAAAAACATATCCAAATCTTAGTGTGATATCAAGAGATGGATCTGTTATCTataat < 1:2677699/151‑1 (MQ=255) gAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTAAAAACATATCCAAATCTTAGTGTGATATCAAGAGATGGATCTGTTATCTAtaataa > 1:426574/1‑151 (MQ=255) gAAAAAGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTAAAAACATATCCAAATCTTAGTGTGATATCAAGAGATGGATCTGTTATCTAtaataa > 1:2985854/1‑151 (MQ=255) aaaaaGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTAAAAACATATCCAAATCTTAGTGTGATATCAAGAGATGGATCTGTTATCTATaataat > 1:457087/1‑151 (MQ=255) aaaaaGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTAAAAACATATCCAAATCTTAGTGTGATATCAAGAGATGGATCTGTTATCTATaataat < 1:1415570/151‑1 (MQ=255) aaaaaGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTAAAAACATATCCAAATCTTAGTGTGATATCAAGAGATGGATCTGTTATCTATaataat > 1:3339242/1‑151 (MQ=255) aaaaGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTAAAAACATATCCAAATCTTAGTGTGATATCAAGAGATGGATCTGTTATCTATAATAATg < 1:2602693/151‑1 (MQ=255) aaGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTAAAAACATATCCAAATCTTAGTGTGATATCAAGAGATGGATCTGTTATCTATAATAATGCa > 1:1878661/1‑151 (MQ=255) aaGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTAAAAACATATCCAAATCTTAGTGTGATATCAAGAGATGGATCTGTTATCTATAATAATGCa < 1:1936223/151‑1 (MQ=255) aGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTAAAAACATATCCAAATCTTAGTGTGATATCAAGAGATGGATCTGTTATCTATAATAATGCaa > 1:2121071/1‑151 (MQ=255) aGCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTAAAAACATATCCAAATCTTAGTGTGATATCAAGAGATGGATCTGTTATCTATAATAATGCaa < 1:2698093/151‑1 (MQ=255) gCTATGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTAAAAACATATCCAAATCTTAGTGTGATATCAAGAGATGGATCTGTTATCTATAATAATGCAAt > 1:1831840/1‑151 (MQ=255) cTATGGGATAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTAAAAACATATCCAAATCTTAGTGTGATATCAAGAGATGGATCTGTTATCTATAATAATGCAAtt > 1:3469746/1‑151 (MQ=255) aTGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTAAAAACATATCCAAATCTTAGTGTGATATCAAGAGATGGATCTGTTATCTATAATAATGCAATTGc < 1:2430660/151‑1 (MQ=255) aTGGGACAATTATGGTAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTAAAAACATATCCAAATCTTAGTGTGATATCAAGAGATGGATCTGTTATCTATAATAATGCAATTGc > 1:3359531/1‑151 (MQ=255) | CAAAAGCTCTAAAGGAAAATGTTGTGGATATCGGTAAAAGTACAGTTTGCAATCTCTTAAAAAAAAGAAACACTGGTTGTTGACAAAAAGACAGTAACAGTTGTTTGCATTGATGATTTTGCTATTAAAAAGCGAAAAAGCTATGGAACAATTATGATAGATATTTTTACGCATCAAATACTTGATATGATTGACTCAAGGGATTATGAGACTGTTTGCGAGTGGTTAAAAACATATCCAAATCTTAGTGTGATATCAAGAGATGGATCTGTTATCTATAATAATGCAATTGC > CP002416/677141‑677433 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |