| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP002416 | 1 = | 0 (0.000) | 173 (1.190) | 131/300 | 0.0 | 100% | intergenic (–/‑211) | –/Clo1313_0001 | –/chromosomal replication initiator protein DnaA |
| ? | CP002416 | = 3561619 | 0 (0.000) | intergenic (‑494/–) | Clo1313_3033/– | ribosomal protein L34/– | |||||
Only 100 of 176 total aligned reads displayed.
ACAGAAATTGTTAATAACTTTGTTGACAACTTGAACAAAAAACTTTTTTCGCCTTCGTCATTTTACTAAACAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP002416/3561469‑3561619 | aCAGAAATTGTTAATAACTTTGTTGACAACTTGAACAAAAAACTTTTTTCGCCTTCGTCATTTTACTAAACAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCttt < 1:552595/151‑1 (MQ=255) gAAATTGTTAATAACTTTGTTGACAACTTGAACAAAAAACTTTTTTCGCCTTCGTCATTTTACTAAACAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTatt > 1:1971391‑M2/1‑148 (MQ=255) aaTTGTTAATAACTTTGTTGACAACTTGAACAAAAAACTTTTTTCGCCTTCGTCATTTTACTAAACAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTatttt > 1:2208609‑M2/1‑146 (MQ=255) ataaCTTTGTTGACAACTTGAACAAAAAACTTTTTTCGCCTTCGTCATTTTACTAAACAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaatta > 1:1698848‑M2/1‑138 (MQ=255) ataaCTTTGTTGACAACTTGAACAAAAAACTTTTTTCGCCTTCGTCATTTTACTAAACAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaatta < 1:1328385‑M2/151‑14 (MQ=255) ataaCTTTGTTGACAACTTGAACAAAAAACTTTTTTCGCCTTCGTCATTTTACTAAACAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaatta < 1:619595‑M2/151‑14 (MQ=255) ataaCTTTGTTGACAACTTGAACAAAAAACTTTTTTCGCCTTCGTCATTTTACTAAACAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaatta > 1:804431‑M2/1‑138 (MQ=255) taaCTTTGTTGACAACTTGAACAAAAAACTTTTTTCGCCTTCGTCATTTTACTAAACAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattat > 1:1117299‑M2/1‑137 (MQ=255) cTTTGTTGACAACTTGAACAAAAAACTTTTTTCGCCTTCGTCATTTTACTAAACAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattatttt > 1:3294818‑M2/1‑134 (MQ=255) cTTTGTTGACAACTTGAACAAAAAACTTTTTTCGCCTTCGTCATTTTACTAAACAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattatttt < 1:3354679‑M2/151‑18 (MQ=255) tttGTTGACAACTTGAACAAAAAACTTTTTTCGCCTTCGTCATTTTACTAAACAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttg < 1:578430‑M2/151‑19 (MQ=255) gttgACAACTTGAACAAAAAACTTTTTTCGCCTTCGTCATTTTACTAAACAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtat < 1:1821364‑M2/151‑22 (MQ=255) ttgACAACTTGAACAAAAAACTTTTTTCGCCTTCGTCATTTTACTAAACAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACACCTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatg > 1:1234443‑M2/1‑129 (MQ=255) ttgACAACTTGAACAAAAAACTTTTTTCGCCTTCGTCATTTTACTAAACAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatg > 1:1798496‑M2/1‑129 (MQ=255) tgACAACTTGAACAAAAAACTTTTTTCGCCTTCGTCATTTTACTAAACAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatga > 1:291854‑M2/1‑128 (MQ=255) aCAACTTGAACAAAAAACTTTTTTCGCCTTCGTCATTTTACTAAACAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcgg > 1:1682097‑M2/1‑126 (MQ=255) aCAACTTGAACAAAAAACTTTTTCCGCCTTCGTCATTTTACTAAACAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTCTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgacaattattttgaatgcgg < 1:1495011‑M2/151‑26 (MQ=255) tGAACAAAAAACTTTTTTCGCCTTCGTCATTTTACTAAACAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatat < 1:1293639‑M2/151‑32 (MQ=255) tGAACAAAAAACTTTTTTCGCCTTCGTCATTTTACTAAACAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatat < 1:672651‑M2/151‑32 (MQ=255) aaCAAAAAACTTTTTTCGCCTTCGTCATTTTACTAAACAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattt > 1:890438‑M2/1‑118 (MQ=255) aaCAAAAAACTTTTTTCGCCTTCGTCATTTTACTAAACAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattt < 1:1811566‑M2/151‑34 (MQ=255) cAAAAAACTTTTTTCGCCTTCGTCATTTTACTAAACAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatatttta < 1:283320‑M2/151‑36 (MQ=255) aaaaaaCTTTTTTCGCCTTCGTCATTTTACTAAACAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaa < 1:3132317‑M2/151‑37 (MQ=255) aaaaaCTTTTTTCGCCTTCGTCATTTTACTAAACAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaat < 1:27876‑M2/151‑38 (MQ=255) aaaCTTTTTTCGCCTTCGTCATTTTACTAAACAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgc < 1:2669516‑M2/151‑40 (MQ=255) ttttttCGCCTTCGTCATTTTTCTAAACAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTGAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattc > 1:2256826‑M2/1‑108 (MQ=255) tttttCGCCTTCGTCATTTTACTAAACAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattca < 1:3258940‑M2/151‑45 (MQ=255) tttCGCCTTCGTCATTTTACTAAACAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatt > 1:236058‑M2/1‑105 (MQ=255) ttCGCCTTCGTCATTTTACTAAACAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcattt < 1:2216616‑M2/151‑48 (MQ=255) tCGCCTTCGTCATTTTACTAAACAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcattta < 1:1424709‑M2/151‑49 (MQ=255) tCGCCTTCGTCATTTTACTAAACAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcattta < 1:1845624‑M2/151‑49 (MQ=255) cGCCTTCGTCATTTTACTAAACAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttac < 1:1953432‑M2/151‑50 (MQ=255) gCCTTCGTCATTTTACTAAACAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttaca > 1:3232023‑M2/1‑101 (MQ=255) cTTCGTCATTTTACTAAACAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacaga < 1:2816709‑M2/151‑53 (MQ=255) ttCGTCATTTTACTAAACAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagac < 1:1069101‑M2/151‑54 (MQ=255) ttCGTCATTTTACTAAACAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagac < 1:2173281‑M2/151‑54 (MQ=255) ttCGTCATTTTACTAAACAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagac > 1:2585129‑M2/1‑98 (MQ=255) tCGTCATTTTACTAAACAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacg > 1:1129971‑M2/1‑97 (MQ=255) tCGTCATTTTACTAAACAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacg > 1:2091988‑M2/1‑97 (MQ=255) cGTCATTTTACTAAACAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacgg < 1:1143589‑M2/151‑56 (MQ=255) cATTTTACTAAACAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggatt > 1:2540201‑M2/1‑93 (MQ=255) aTTTTACTAAACAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggattt > 1:2775699‑M2/1‑92 (MQ=255) aTTTTACTAAACAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggattt > 1:43949‑M2/1‑92 (MQ=255) aTTTTACTAAACAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggattt < 1:445644‑M2/151‑60 (MQ=255) tttACTAAACAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggattttt > 1:754503‑M2/1‑90 (MQ=255) ttACTAAACAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggattttta > 1:2512063‑M2/1‑89 (MQ=255) tACTAAACAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggatttttaa < 1:3427440‑M2/151‑64 (MQ=255) tACTAAACAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggatttttaa > 1:1161555‑M2/1‑88 (MQ=255) cTAAACAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggatttttaaaa > 1:2966454‑M2/1‑86 (MQ=255) tAAACAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggatttttaaaat < 1:969245‑M2/151‑67 (MQ=255) aaaCAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggatttttaaaatc < 1:1535358‑M2/151‑68 (MQ=255) aCAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggatttttaaaatcaa > 1:374409‑M2/1‑82 (MQ=255) cAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggatttttaaaatcaac > 1:615498‑M2/1‑81 (MQ=255) cAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggatttttaaaatcaac < 1:1022078‑M2/151‑71 (MQ=255) aTACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggatttttaaaatcaacgc < 1:2574169‑M2/151‑73 (MQ=255) ttACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggatttttaaaatcaacgcaaaatca > 1:2804746‑M2/1‑72 (MQ=255) tACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggatttttaaaatcaacgcaaaatcat < 1:2744186‑M2/151‑81 (MQ=255) ccACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggatttttaaaatcaacgcaaaatcataa > 1:2265024‑M2/1‑69 (MQ=255) aCTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggatttttaaaatcaacgcaaaatcataaac < 1:1235880‑M2/151‑85 (MQ=255) attatatGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggatttttaaaatcaacgcaaaatcataaacaataa < 1:880659‑M2/151‑90 (MQ=255) tatatGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggatttttaaaatcaacgcaaaatcataaacaataaac > 1:1314732‑M2/1‑60 (MQ=255) tatatGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggatttttaaaatcaacgcaaaatcataaacaataaac < 1:3458897‑M2/151‑92 (MQ=255) tatGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggatttttaaaatcaacgcaaaatcataaacaataaacca < 1:2733432‑M2/151‑94 (MQ=255) tatGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggatttttaaaatcaacgcaaaatcataaacaataaacca > 1:3179274‑M2/1‑58 (MQ=255) tatGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTCCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggatttttaaaatcaacgcaaaatcataaacaataaacca < 1:1419733‑M2/151‑94 (MQ=255) atGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggatttttaaaatcaacgcaaaatcataaacaataaaccac > 1:2082844‑M2/1‑57 (MQ=255) gttgttTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggatttttaaaatcaacgcaaaatcataaacaataaaccacta < 1:2921851‑M2/151‑97 (MQ=255) gttgttTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggatttttaaaatcaacgcaaaatcataaacaataaaccacta > 1:1394297‑M2/1‑55 (MQ=255) gttTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggatttttaaaatcaacgcaaaatcataaacaataaaccactaaag < 1:3053118‑M2/151‑100 (MQ=255) ttttAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggatttttaaaatcaacgcaaaatcataaacaataaaccactaaagat < 1:1847099‑M2/151‑102 (MQ=255) tttAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggatttttaaaatcaacgcaaaatcataaacaataaaccactaaagata < 1:1027046‑M2/151‑103 (MQ=255) tttAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggatttttaaaatcaacgcaaaatcataaacaataaaccactaaagata > 1:2057748‑M2/1‑49 (MQ=255) ttAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggatttttaaaatcaacgcaaaatcataaacaataaaccactaaagataa < 1:916103‑M2/151‑104 (MQ=255) aacTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggatttttaaaatcaacgcaaaatcataaacaataaaccactaaagataaatctt > 1:2620233‑M2/1‑43 (MQ=255) acTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggatttttaaaatcaacgcaaaatcataaacaataaaccactaaagataaatcttt > 1:1287838‑M2/1‑42 (MQ=255) acTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggatttttaaaatcaacgcaaaatcataaacaataaaccactaaagataaatcttt < 1:483141‑M2/151‑110 (MQ=255) ttATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggatttttaaaatcaacgcaaaatcataaacaataaaccactaaagataaatcttttt < 1:206354‑M2/151‑112 (MQ=255) ttATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggatttttaaaatcaacgcaaaatcataaacaataaaccactaaagataaatcttttt < 1:3221985‑M2/151‑112 (MQ=255) ttATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggatttttaaaatcaacgcaaaatcataaacaataaaccactaaagataaatcttttt < 1:3444031‑M2/151‑112 (MQ=255) ttATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggatttttaaaatcaacgcaaaatcataaacaataaaccactaaagataaatcttttt < 1:1864736‑M2/151‑112 (MQ=255) aCAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggatttttaaaatcaacgcaaaatcataaacaataaaccactaaagataaatctttttataa < 1:2039459‑M2/151‑116 (MQ=255) aCAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggatttttaaaatcaacgcaaaatcataaacaataaaccactaaagataaatctttttataa > 1:2950344‑M2/1‑36 (MQ=255) cAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggatttttaaaatcaacgcaaaatcataaacaataaaccactaaagataaatctttttataaa > 1:3282375‑M2/1‑35 (MQ=255) aaaaTTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggatttttaaaatcaacgcaaaatcataaacaataaaccactaaagataaatctttttataaaa > 1:2437674‑M2/1‑34 (MQ=255) aaaTTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggatttttaaaatcaacgcaaaatcataaacaataaaccactaaagataaatctttttataaaac < 1:109158‑M2/151‑119 (MQ=255) aaTTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggatttttaaaatcaacgcaaaatcataaacaataaaccactaaagataaatctttttataaaaca < 1:1284773‑M2/151‑120 (MQ=255) attattTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggatttttaaaatcaacgcaaaatcataaacaataaaccactaaagataaatctttttataaaacac < 1:524641‑M2/151‑121 (MQ=255) tattTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggatttttaaaatcaacgcaaaatcataaacaataaaccactaaagataaatctttttataaaacacca < 1:2287844‑M2/151‑123 (MQ=255) aTTAAATGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggatttttaaaatcaacgcaaaatcataaacaataaaccactaaagataaatctttttataaaacaccaaggaaat > 1:621687‑M2/1‑22 (MQ=255) aaTGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggatttttaaaatcaacgcaaaatcataaacaataaaccactaaagataaatctttttataaaacaccaaggaaataatt > 1:887145‑M2/1‑18 (MQ=255) tGCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggatttttaaaatcaacgcaaaatcataaacaataaaccactaaagataaatctttttataaaacaccaaggaaataatttt > 1:931354‑M2/1‑16 (MQ=255) gCTTAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggatttttaaaatcaacgcaaaatcataaacaataaaccactaaagataaatctttttataaaacaccaaggaaataatttta > 1:484782‑M2/1‑15 (MQ=255) ttAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggatttttaaaatcaacgcaaaatcataaacaataaaccactaaagataaatctttttataaaacaccaaggaaataattttaca < 1:1447182‑M2/151‑139 (MQ=255) tAAGATGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggatttttaaaatcaacgcaaaatcataaacaataaaccactaaagataaatctttttataaaacaccaaggaaataattttacaa > 1:3427441‑M2/1‑12 (MQ=255) aTGCCTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggatttttaaaatcaacgcaaaatcataaacaataaaccactaaagataaatctttttataaaacaccaaggaaataattttacaaacca > 1:2360997‑M2/1‑8 (MQ=255) ccTTTattttgtaaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttccagacggatttttaaaatcaacgcaaaatcataaacaataaaccactaaagataaatctttttataaaacaccaaggaaataattttacaaaccaccg > 1:432372‑M2/1‑5 (MQ=255) cTTTattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggatttttaaaatcaacgcaaaatcataaacaataaaccactaaagataaatctttttataaaacaccaaggaaataattttacaaaccaccga < 1:1586217‑M2/151‑148 (MQ=255) tttattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggatttttaaaatcaacgcaaaatcataaacaataaaccactaaagataaatctttttataaaacaccaaggaaataattttacaaaccaccgac < 1:2869376‑M2/151‑149 (MQ=255) tattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggatttttaaaatcaacgcaaaatcataaacaataaaccactaaagataaatctttttataaaacaccaaggaaataattttacaaaccaccgacaa < 1:2301310‑M2/151‑151 (MQ=255) tattttgtcaattattttgtatgcggaaatattttaatgcattcatttacagacggatttttaaaatcaacgcaaaatcataaacaataaaccactaaagataaatctttttataaaacaccaaggaaataattttacaaaccaccgacaa > 1:1529371‑M2/1‑1 (MQ=255) | ACAGAAATTGTTAATAACTTTGTTGACAACTTGAACAAAAAACTTTTTTCGCCTTCGTCATTTTACTAAACAATACTTTTTACCACTATATTATATGTTGTTTTTAACAACTTATACAAAATTATTTCAATTAAATGCTTAAGATGCCTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP002416/3561469‑3561619 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |