| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP002416 | = 1438372 | 0 (0.000) | 148 (1.030) | 107/296 | 0.4 | 100% | intergenic (+53/‑88) | Clo1313_1210/Clo1313_1211 | translation elongation factor Ts/uridylate kinase |
| ? | CP002416 | = 3041054 | NA (NA) | intergenic (‑128/+93) | Clo1313_2585/Clo1313_2586 | transposase IS200‑family protein/copper amine oxidase‑like domain‑containing protein | |||||
Only 100 of 333 total aligned reads displayed.
CAACATCAGAAGATTTGTAAGATTTGAAAGAGGCGAAGGCATACAGAAGAAGGAAGAAAACTTTGCCGAGGAAGTTATGAAACAAATAAATGGCTAAATGACGGGTAATGGATGAAGGGAACATATAAAGTATTTATATGTTCCCTTTTTAGGGATTATTGTTGTTTTAATAAAATTTGTTTCCAATTATAATGTTTATATGTTAGAATAACATTTAGGAGCGGAGGATTATCTTTAATGCAGAAACCGAAGTATAAAAGAATTATGTTGAAAATAAGCGGAGAGGCCTTGGCGGGGGAA > CP002416/1438223‑1438522 | gagtaaataaaagcaaaaaataaaaccactttagtggtggcttgagaagtatatgcggttggcgaaccattcaacgcgtcttaagacgctgcaaggaccatgcccttatagggctagagcaaaccaccggctgagccggtggttatgaTTa < 1:1854340‑M1/3‑1 (MQ=255)gagtaaataaaagcaaaaaataaaaccactttagtggtggcttgagaagaatatgcggttggcgaaccattcaacgcgtcttaagacgctgcaaggaccatgcccttatagggctagagcaaaccaccggctgagccggtggttatgaTTa > 1:2855920‑M1/149‑151 (MQ=255)gagtaaataaaagcaaaaaataaaaccactttagtggtggcttgagaagaatatgcggttggcgaaccattcaacgcgtcttaagacgctgcaaggaccatgcccttatagggctagagcaaaccaccggctgagccggtggttatgaTTa > 1:3148004‑M1/149‑151 (MQ=255)gagtaaataaaagcaaaaaataaaaccactttagtggtggcttgagaagaatatgcggttggcgaaccattcaacgcgtcttaagacgctgcaaggaccatgcccttatagggctagagcaaaccaccggctgagccggtggttatgaTTa > 1:3291975‑M1/149‑151 (MQ=255) aaCATCAGAAGATTTGTAAGATTTGAAAGAGGCGAAGGCATACAGAAGAAGGAAGAAAACTTTGCCGAGGAAGTTATGAAACAAATAAATGGCTAAATGACGGGTAATGGATGAAGGGAACATATAAAGTATTTATATGTTCCCTTTTTgt > 1:1275462‑M1/1‑149 (MQ=255) aaCATCAGAAGATTTGTAAGATTTGAAAGAGGCGAAGGCATACAGAAGAAGGAAGAAAACTTTGCCGAGGAAGTTATGAAACAAATAAATGGCTAAATGACGGGTAATGGATGAAGGGAACATATAAAGTATTTATATGTTCCCTTTTTgt < 1:3168573‑M1/151‑3 (MQ=255) aCATCAGAAGATTTGTAAGATTTGAAAGAGGCGAAGGCATACAGAAGAAGGAAGAAAACTTTGCCGAGGAAGTTATGAAACAAATAAATGGCTAAATGACGGGTAATGGATGAAGGGAACATATAAAGTATTTATATGTTCCCTTTTTgtt < 1:494695‑M1/151‑4 (MQ=255) aCATCAGAAGATTTGTAAGATTTGAAAGAGGCGAAGGCATACAGAAGAAGGAAGAAAACTTTGCCGAGGAAGTTATGAAACAAATAAATGGCTAAATGACGGGTAATGGATGAAGGGAACATATAAAGTATTTATATGTTCCCTTTTTgtt < 1:782765‑M1/151‑4 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |