| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | CP002416 | 1438371 = | 0 (0.000) | 182 (1.270) | 124/296 | 0.1 | 100% | intergenic (+52/‑89) | Clo1313_1210/Clo1313_1211 | translation elongation factor Ts/uridylate kinase |
| ? | CP002416 | = 1618385 | NA (NA) | intergenic (+125/‑148) | Clo1313_1375/Clo1313_1376 | transposase IS200‑family protein/stage III sporulation protein AA | |||||
Only 100 of 335 total aligned reads displayed.
ATCAACATCAGAAGATTTGTAAGATTTGAAAGAGGCGAAGGCATACAGAAGAAGGAAGAAAACTTTGCCGAGGAAGTTATGAAACAAATAAATGGCTAAATGACGGGTAATGGATGAAGGGAACATATAAAGTATTTATATGTTCCCTTTTTAGGGATTATTGTTGTTTTAATAAAATTTGTTTCCAATTATAATGTTTATATGTTAGAATAACATTTAGGAGCGGAGGATTATCTTTAATGCAGAAACCGAAGTATAAAAGAATTATGTTGAAAATAAGCGGAGAGGCCTTGGCGGGGGA > CP002416/1438221‑1438521 | gagtaaataaaagcaaaaaataaaacctctttagtggtggcttgagaagaatatgcggttggcgaaccattcaacgcgtcttaagacgctgcaaggaccatgcccttatagggctagagcaaaccaccggctgagccggtggttatgaTTa > 1:2400152‑M1/149‑151 (MQ=255) gagtaaataaaagcaaaaaataaaaccactttagtggtggcttgagaagtatatgcggttggcgaaccattcaacgcgtcttaagacgctgcaaggaccatgcccttatagggctagagcaaaccaccggctgagccggtggttatgaTTa < 1:1854340‑M1/3‑1 (MQ=255) agtaaataaaagcaaaaaataaaaccactttagtggtggcttgagaagaatatgcggttggcgaaccattcaacgcgtcttaagacgctgcaaggaccatgcccttatagggctagagcaaaccaccggctgagccggtggttatgaTTAg < 1:2874661‑M1/4‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |