| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | CP002416 | = 35798 | 5 (0.030) | 184 (1.300) | 123/292 | 0.1 | 97.4% | intergenic (+67/‑191) | Clo1313_0033/Clo1313_0034 | Peptidoglycan‑binding lysin domain/4‑diphosphocytidyl‑2C‑methyl‑D‑erythritol kinase |
| ? | CP002416 | = 3041052 | NA (NA) | intergenic (‑126/+95) | Clo1313_2585/Clo1313_2586 | transposase IS200‑family protein/copper amine oxidase‑like domain‑containing protein | |||||
Only 100 of 404 total aligned reads displayed.
GATATTTTAAGAGTTAACGAGTTTGGTGCGGATGATGTTATCGGGGTGGGACAGCAAATAATAGTTCCAAGAAAAATAAGTTAATTTCCTGATTTTTATAAAAAATTTTATCAAATTAAGGTCCGAAGTCGAAGATTTCGGACTTTTTTGTGCGAAATTTTCAAGTTTGGATTTTGTTTTGCACATGTCCTGAAAGTACATTGAGAGATTTTATTGAAAAAGGAATGTATATTGTATATAATATAAAAATATATAAAACCCTATAAACATTTGGGTTTGAAATTTAATTTGAAAAATCTGA > CP002416/35648‑35948 | taaataaaagcaaaaaataaaaccactttagtggtggcttgagaagaatatgcggttggcgaaccattcaacgcgtcttaagacgctgcaaggaccatgcccttatagggctagagcaaaccaccggctgagccggtggttatgaTTGTGc < 1:207918‑M1/6‑1 (MQ=255) aaagcaaaaaataaaaccactttagtggtggcttgagaagaatatgcggttggcgaaccattcaacgcgtcttaagacgctgcaaggaccatgcccttatagggctagagcaaaccaccggctgagccggtggttatgaTTGTGCGAAAtt < 1:1799419‑M1/12‑1 (MQ=255) gagTTAACGAGTTTGGTGCGGATGATGTTATCGGGGTGGGACAGCAAATAATAGTTCCAAGAAAAATAAGTTAATTTCCTGATTTTTATAAAAAATTTTATCAAATTAAGGTCCGAAGTCGAAGATTTCGGACTTTTTTGTttaaagaaaa < 1:1273922‑M1/151‑11 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |