| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | CP002416 | 35795 = | 0 (0.000) | 182 (1.270) | 131/296 | 0.0 | 100% | intergenic (+64/‑194) | Clo1313_0033/Clo1313_0034 | Peptidoglycan‑binding lysin domain/4‑diphosphocytidyl‑2C‑methyl‑D‑erythritol kinase |
| ? | CP002416 | = 731058 | NA (NA) | intergenic (+125/+177) | Clo1313_0644/Clo1313_0645 | transposase IS200‑family protein/glycosyl transferase family 2 | |||||
Only 100 of 370 total aligned reads displayed.
AGGATATTTTAAGAGTTAACGAGTTTGGTGCGGATGATGTTATCGGGGTGGGACAGCAAATAATAGTTCCAAGAAAAATAAGTTAATTTCCTGATTTTTATAAAAAATTTTATCAAATTAAGGTCCGAAGTCGAAGATTTCGGACTTTTTTGTGCGAAATTTTCAAGTTTGGATTTTGTTTTGCACATGTCCTGAAAGTACATTGAGAGATTTTATTGAAAAAGGAATGTATATTGTATATAATATAAAAATATATAAAACCCTATAAACATTTGGGTTTGAAATTTAATTTGAAAAAT > CP002416/35646‑35944 | aggaTATTTTAAGAGTTAACGAGTTTGGTGCGGATGATGTTATCGGGGTGGGACATCAAATAATAGTTCCAAGAAAAATAAGTTAATTTCCTGATTTTTATAAAAAATTTTATCAAATTAAGGTCCGAAGTCGAAGATTTCGGACTTTTTT < 1:2850426‑M1/151‑1 (MQ=255) tatTTTAAGAGTTAACGAGTTTGGTGCGGATGATGTTATCGGGGTGGGACAGCAAATAATAGTTCCAAGAAAAATAAGTTAATTTCCTGATTTTTATAAAAAATTTTATCAAATTAAGGTCCGAAGTCGAAGATTTCGGACTTTTTTGTtt < 1:1072331‑M1/151‑3 (MQ=255) taaataaaagcaaaaaataaaaccactttagtggtggcttgagaagaatatgcggttggcgaaccattcaacgcgtcttaagacgctgcaaggaccatgcccttatagggctagagcaaaccaccggctgagccggtggttatgaTTGTGc > 1:1802029‑M1/146‑151 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |