| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP002416 | 3474145 = | 164 (1.130) | 19 (0.160) | 19/246 | 10.8 | 12.0% | intergenic (‑711/+135) | Clo1313_2959/Clo1313_2961 | CheW protein/integrase family protein |
| ? | CP002416 | 3475077 = | 144 (1.210) | intergenic (‑237/‑164) | Clo1313_2961/Clo1313_2962 | integrase family protein/transcriptional regulator, AraC family | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
AGGACCAAAAAGACGAACTGTATTCTTTGGTTCAGTTTTAGAACGGTAAAAACCCCCAAACAATCAAGCAAATGGTTTGGGGGTATTATTTATTTTATAAAAAATTTAAAATATGCAGGAAAAAAAA‑TATCATGTCGAAGTATATTTTTAAAGTAACAAAATGGGCATATTGTTAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP002416/3474320‑3474145‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaagtaacaaaatgggcatattgttacTTTAAAAAACAGGAATTTTTTCCTTTCTCTTAATTCTTATATTTTCTCCTTAAAATCTATTTCCCTCTCCAACAGTCCATAATCTGAATTTGCGCATTACAATCGAATTGACCTAATGTAAATCCTTGGCTATAATTAATAATAAAACAA > CP002416/3475077‑3475226 AGGACCAAAAAGACGAACTGTATTCTTTGGTTCAGTTTTAGAACGGTAAAAACCCCCAAACAATCAAGCAAATGGTTTGGGGGTATTATTTATTTTATAAAAAATTTAAAATATGCAGGAAAAAAAAATATCATGTCGAAGTATATTTTTA < 1:265357/151‑1AGGACCAAAAAGACGAACTGTATTCTTTGGTTCAGTTTTAGAACGGTAAAAACCCCCAAACAATCAAGCAAATGGTTTGGGGGTATTATTTATTTTATAAAAAATTTAAAATATGCAGGAAAAAAAAATATCATGTCGAAGTATATTTTTA > 1:2472124/1‑151 GGACCAAAAAGACGAACTGTATTCTTTGGTTCAGTTTTAGAACGGTAAAAACCCCCAAACAATCAAGCAAATGGTTTGGGGGTATTATTTATTTTATAAAAAATTTAAAATATGCAGGAAAAAAAAATATCATGTCGAAGTATATTTTTAA > 1:515198/1‑151 GGACCAAAAAGACGAACTGTATTCTTTGGTTCAGTTTTAGAACGGTAAAAACCCCCAAACAATCAAGCAAATGGTTTGGGGGTATTATTTATTTTATAAAAAATTTAAAATATGCAGGAAAAAAAAATATCATGTCGAAGTATATTTTTAA < 1:1633519/151‑1 GACCAAAAAGACGAACTGTATTCTTTGGTTCAGTTTTAGAACGGTAAAAACCCCCAAACAATCAAGCAAATGGTTTGGGGGTATTATTTATTTTCTAAAAAATTTAAAATATGCAGGAAAAAAAAATATCATGTCGAAGTATATTTTTAAA > 1:2774771/1‑151 GACCAAAAAGACGAACTGTATTCTTTGGTTCAGTTTTAGAACGGTAAAAACCCCCAAACAATCAAGCAAATGGTTTGGGGGTATTATTTATTTTATAAAAAATTTAAAATATGCAGGAAAAAAAAATATCATGTCGAAGTATATTTTTAAA < 1:103062/151‑1 GACCAAAAAGACGAACTGTATTCTTTGGTTCAGTTTTAGAACGGTAAAAACCCCCAAACAATCAAGCAAATGGTTTGGGGGTATTATTTATTTTATAAAAAATTTAAAATATGCAGGAAAAAAAAATATCATGTCGAAGTATATTTTTAAA > 1:3217728/1‑151 GACCAAAAAGACGAACTGTATTCTTTGGTTCAGTTTTAGAACGGTAAAAACCCCCAAACAATCAAGCAAATGGTTTGGGGGTATTATTTATTTTATAAAAAATTTAAAATATGCAGGAAAAAAAAATATCATGTCGAAGTATATTTTTAAA < 1:1969114/151‑1 GACCAAAAAGACGAAATGTATTCTTTGGTTCAGTTTTAGAACGGTAAAAACACACAAACAATCAAGCAAATGGTTTGGGAATATTATTTATTTTATAAAAAATTTAAAATATGCAGGAAAAAAAAATAGCATGTCGAAGTATATTTTTAAA < 1:1287691/151‑1 CCAAAAAGACGAACTGTATTCTTTGGTTCAGTTTTAGAACGGTAAAAACCCCCAAACAATCAAGCAAATGGTTTGGGGGTATTATTTATTTTATAAAAAATTTAAAATATGCAGGAAAAAAAAATATCATGTCGAAGTATATTTTTAAAGT < 1:839972/151‑1 AAAAAGACGAACTGTATTCTTTGGTTCAGTTTTAGAACGGTAAAAACCCCCAAACAATCAAGCAAATGGTTTGGGGGTATTATTTATTTTATAAAAAATTTAAAATATGCAGGAAAAAAAAATATCATGTCGAAGTATATTTTTAAAGTAA < 1:570620/151‑1 AAAAAGACGAACTGTATTCTTTGGTTCAGTTTTAGAACGGTAAAAACCCCCAAACAATCAAGCAAATGGTTTGGGGGTATTATTTATTTTATAAAAAATTTAAAATATGCAGGAAAAAAAAATATCATGTCGAAGTATATTTTTAAAGTAA < 1:2634473/151‑1 AAAAGACGAACTGTATTCTTTGGTTCAGTTTTAGAACGGTAAAAACCCCCAAACAATCAAGCAAATGGTTTGGGGGTATTATTTATTTTATAAAAAATTTAAAATATGCAGGAAAAAAAAATATCATGTCGAAGTATATTTTTAAAGTAAC > 1:1102173/1‑151 AAAAGACGAACTGTATTCTTTGGTTCAGTTTTAGAACGGTAAAAACCCCCAAACAATCAAGCAAATGGTTTGGGGGTATTATTTATTTTATAAAAAATTTAAAATATGCAGGAAAAAAAAATATCATGTCGAAGTATATTTTTAAAGTAAC > 1:3125705/1‑151 AAAGACGAACTGTATTCTTTGGTTCAGTTTTAGAACGGTAAAAACCCCCAAACAATCAAGCAAATGGTTTGGGGGTATTATTTATTTTATAAAAAATTTAAAATATGCAGGAAAAAAAAATATCATGTCGAAGTATATTTTTAAAGTAACA < 1:247683/151‑1 AGACGAACTGTATTCTTTGGTTCAGTTTTAGAACGGTAAAAACCCCCAAACAATCAAGCAAATGGTTTGGGGGTATTATTTATTTTATAAAAAATTTAAAATATGCAGGAAAAAAAAATATCATGTCGAAGTATATTTTTAAAGTAACAAA < 1:83087/151‑1 GACGAACTGTATTCTTTGGTTCAGTTTTAGAACGGTAAAAACCCCCAAACAATCAAGCAAATGGTTTGGGGGTATTATTTATTTTATAAAAAATTTAAAATATGCAGGAAAAAAAAATATCATGTCGAAGTATATTTTTAAAGTAACAAAA < 1:2662326/151‑1 GACGAACTGTATTCTTTGGTTCAGTTTTAGAACGGTAAAAACCCCCAAACAATCAAGCAAATGGTTTGGGGGTATTATTTATTTTATAAAAAATTTAAAATATGCAGGAAAAAAAAATATCATGTCGAAGTATATTTTTAAAGTAACAAAA > 1:1734883/1‑151 ACGAACTGTATTCTTTGGTTCAGTTTTAGAACGGTAAAAACCCCCAAACAATCAAGCAAATGGTTTGGGGGTATTATTTATTTTATAAAAAATTTAAAATATGCAGGAAAAAAAAATATCATGTCGAAGTATATTTTTAAAGTAACAAAAT < 1:2712113/151‑1 CGAACTGTATTCTTTGGTTCAGTTTTAGAACGGTAAAAACCCCCAAACAATCAAGCAAATGGTTTGGGGGTATTATTTATTTTATAAAAAATTTAAAATATGCAGGAAAAAAAAATATCATGTCGAAGTATATTTTTAAAGTAACAAAATG > 1:2756215/1‑151 GAACTGTATTCTTTGGTTCAGTTTTAGAACGGTAAAAACCCCCAAACAATCAAGCAAATGGTTTGGGGGTATTATTTATTTTATAAAAAATTTAAAATATGCAGGAAAAAAAAATATCATGTCGAAGTATATTTTTAAAGTAACAAAATGG > 1:2962510/1‑151 GAACTGTATTCTTTGGTTCAGTTTTAGAACGGTAAAAACCCCCAAACAATCAAGCAAATGGTTTGGGGGTATTATTTATTTTATAAAAAATTTAAAATATGCAGGAAAAAAAAATATCATGTCGAAGTATATTTTTAAAGTAACAAAATGG < 1:3037217/151‑1 GAACTGTATTCTTTGGTTCAGTTTTAGAACGGTAAAAACCCCCAAACAATCAAGCAAATGGTTTGGGGGTATTATTTATTTTATAAAAAATTTAAAATATGCAGGAAAAAAAAATATCATGTCGAAGTATATTTTTAAAGTAACAAAATGG < 1:2220615/151‑1 AACTGTATTCTTTGGTTCAGTTTTAGAACGGTAAAAACCCCCAAACAATCAAGCGAATGGTTTGGGGGTATTATTTATTTTATAAAAAATTTAAAATATGCAGGAAAAAAAAATATCATGTCGAAGTATATTTTTAAAGTAACAAAATGGG > 1:1483082/1‑151 CTGTATTCTTTGGTTCAGTTTTAGAACGGTAAAAACCCCCAAACAATCAAGCAAATGGTTTGGGGGTATTATTTATTTTATAAAAAATTTAAAATATGCAGGAAAAAAAAATATCATGTCGAAGTATATTTTTAAAGTAACAAAATGGGCA < 1:613478/151‑1 TGTATTCTTTGGTTCAGTTTTAGAACGGTAAAAACCCCCAAACAATCAAGCAAATGGTTTGGGGGTATTATTTATTTTATAAAAAATTTAAAATATGCAGGAAAAAAAAATATCATGTCGAAGTATATTTTTAAAGTAACAAAATGGGCAT > 1:575989/1‑151 TGTATTCTTTGGTTCAGTTTTAGAACGGTAAAAACCCCCAAACAATCAAGCAAATGGTTTGGGGGTATTATTTATTTTATAAAAAATTTAAAATATGCAGGAAAAAAAAATATCATGTCGAAGTATATTTTTAAAGTAACAAAATGGGCAT > 1:2041063/1‑151 TTCTTTGGTTCAGTTTTAGAACGGTAAAAACCCCCAAACAATCAAGCAAATGGTTTGGGGGTATTATTTATTTTATAAAAAATTTAAAATATGCAGGAAAAAAAAATATCATGTCGAAGTATATTTTTAAAGTAACAAAATGGGCATATTG > 1:1321732/1‑151 TTTGGTTCAGTTTTAGAACGGTAAAAACCCCCAAACAATCAAGCAAATGGTTTGGGGGTATTATTTATTTTATAAAAAATTTAAAATATGCAGGAAAAAAAAATATCATGTCGAAGTATATTTTTAAAGTAACAAAATGGGCATATTGTTA > 1:657601/1‑151 TTGGTTCAGTTTTAGAACGGTAAAAACCCCCAAACAATCAAGCAAATGGTTTGGGGGTATTATTTATTTTATAAAAAATTTAAAATATGCAGGAAAAAAAAATATCATGTCGAAGTATATTTTTAAAGTAACAAAATGGGCATATTGTTAC > 1:843678/1‑151 TTTAGAACGGTAAAAACCCCCAAACAATCAAGCAAATGGTTTGGGGGTATTATTTATTTTATAAAAAATTTAAAATATGCAGGAAAAAAAAATATCATGTCGAAGTATATTTTTAAAGTAACAAAATGGGCATATTGTTACTTTAAAAAAC < 1:3200191/151‑1 GTAAAAACCCCCAAACAATCAAGCAAATGGTTTGGGGGTATTATTTATTTTATAAAAAATTTAAAATATGCAGGAAAAAAAAATATCATGTCGAAGTATATTTTTAAAGTAACAAAATGGGCATATTGTTACTTTAAAAAACAGGAATTTT > 1:2810967/1‑151 TAAAAACCCCCAAACAATCAAGCAAATGGTTTGGGGGTATTATTTATTTTATAAAAAATTTAAAATATGCAGGAAAAAAAAATATCATGTCGAAGTATATTTTTAAAGTAACAAAATGGGCATATTGTTACTTTAAAAAACAGGAATTTTT > 1:2166907/1‑151 AAACAATCAAGCAAATGGTTTGGGGGTATTATTTATTTTATAAAAAATTTAAAATATGCAGGAAAAAAAAATATCATGTCGAAGTATATTTTTAAAGTAACAAAATGGGCATATTGTTACTTTAAAAAACAGGAATTTTTTCCTTTCTCTT < 1:2965563/151‑1 TCAAGCAAATGGTTTGGGGGTATTATTTATTTTATAAAAAATTTAAAATATGCAGGAAAAAAAAATATCATGTCGAAGTATATTTTTAAAGTAACAAAATGGGCATATTGTTACTTTAAAAAACAGGAATTTTTTCCTTTCTCTTAATTCT < 1:1963249/151‑1 TCAAGCAAATGGTTTGGGGGTATTATTTATTTTATAAAAAATTTAAAATATGCAGGAAAAAAAAATATCATGTCGAAGTATATTTTTAAAGTAACAAAATGGGCATATTGTTACTTTAAAAAACAGGAATTTTTTCCTTTCTCTTAATTCT > 1:2743735/1‑151 AAGCAAATGGTTTGGGGGTATTATTTATTTTATAAAAAATTTAAAATATGCAGGAAAAAAAAATATCATGTCGAAGTATATTTTTAAAGTAACAAAATGGGCATATTGTTACTTTAAAAAACAGGAATTTTTTCCTTTCTCTTAATTCTTA < 1:403376/151‑1 AAATGGTTTGGGGGTATTATTTATTTTATAAAAAATTTAAAATATGCAGGAAAAAAAAATATCATGTCGAAGTATATTTTTAAAGTAACAAAATGGGCATATTGTTACTTTAAAAAACAGGAATTTTTTCCTTTCTCTTAATTCTTATATT > 1:817747/1‑151 TTGGGGGTATTATTTATTTTATAAAAAATTTAAAATATGCAGGAAAAAAAAATATCATGTCGAAGTATATTTTTAAAGTAACAAAATGGGCATATTGTTACTTTAAAAAACAGGAATTTTTTCCTTTCTCTTAATTCTTATATTTTCTCCT < 1:2232220/151‑1 GGTATTATTTATTTTATAAAAAATTTAAAATATGCAGGAAAAAAAAATATCATGTCGAAGTATATTTTTAAAGTAACAAAATGGGCATATTGTTACTTTAAAAAACAGGAATTTTTTCCTTTCTCTTAATTCTTATATTTTCTCCTTAAAA < 1:3155788/151‑1 TATTATTTATTTTATAAAAAATTTAAAATATGCAGGAAAAAAAAATATCATGTCGAAGTATATTTTTAAAGTAACAAAATGGGCATATTGTTACTTTAAAAAACAGGAATTTTTTCCTTTCTCTTAATTCTTATATTTTCTCCTTAAAATC < 1:689301/151‑1 TATTTTATAAAAAATTTAAAATATGCAGGAAAAAAAAATATCATGTCGAAGTATATTTTTAAAGTAACAAAATGGGCATATTGTTACTTTAAAAAACAGGAATTTTTTCCTTTCTCTTAATTCTTATATTTTCTCCTTAAAATCTATTTCC > 1:3407455/1‑151 ATAAAAAATTTAAAATATGCAGGAAAAAAAAATATCATGTCGAAGTATATTTTTAAAGTAACAAAATGGGCATATTGTTACTTTAAAAAACAGGAATTTTTTCCTTTCTCTTAATTCTTATATTTTCTCCTTAAAATCTATTTCCCTCTCC > 1:2945910/1‑151 AATTTAAAATATGCAGGAAAAAAAAATATCATGTCGAAGTATATTTTTAAAGTAACAAAATGGGCATATTGTTACTTTAAAAAACAGGAATTTTTTCCTTTCTCTTAATTCTTATATTTTCTCCTTAAAATCTATTTCCCTCTCCAACAGT > 1:3152265/1‑151 ATTTAAAATATGCAGGAAAAAAAAATATCATGTCGAAGTATATTTTTAAAGTAACAAAATGGGCATATTGTTACTTTAAAAAACAGGAATTTTTTCCTTTCTCTTAATTCTTATATTTTCTCCTTAAAATCTATTTCCCTCTCCAACAGTC > 1:2401667/1‑151 AAAATATGCAGGAAAAAAAAATATCATGTCGAAGTATATTTTTAAAGTAACAAAATGGGCATATTGTTACTTTAAAAAACAGGAATTTTTTCCTTTCTCTTAATTCTTATATTTTCTCCTTAAAATCTATTTCCCTCTCCAACAGTCCATA > 1:2515139/1‑151 AAAAA‑TATCATGTCGAAGTATATTTTTAAAGTAACAAAATGGGCATATTGTTACTTTAAAAAACAGGAATTTTTTCCTTTCTCTTAATTCTTATATTTTCTCCTTAAAATCTATTTCCCTCTCCAACAGTCCATAATCTGAATTTGCGCAT > 1:22131/1‑151 GAAGTATATTTTTAAAGTAACAAAATGGGCATATTGTTACTTTAAAAAACAGGAATTTTTTCCTTTCTCTTAATTCTTATATTTTCTCCTTAAAATCTATTTCCCTCTCCAACAGTCCATAATCTGAATTTGCGCATTACAATCGAATTGA > 1:2449430/1‑151 ATTTTTAAAGTAACAAAATGGGCATATTGTTACTTTAAAAAACAGGAATTTTTTCCTTTCTCTTAATTCTTATATTTTCTCCTTAAAATCTATTTCCCTCTCCAACAGTCCATAATCTGAATTTGCGCATTACAATCGAATTGACCTAATG < 1:1445112/151‑1 AAAGTAACAAAATGGGCATATTGTTACTTTAAAAAACAGGAATTTTTTCCTTTCTCTTAATTCTTATATTTTCTCCTTAAAATCTATTTCCCTCTCCAACAGTCCATAATCTGAATTTGCGCATTACAATCGAATTGACCTAATGTAAATC < 1:2241682/151‑1 GTAACAAAATGGGCATATTGTTACTTTAAAAAACAGGAATTTTTTCCTTTCTCTTAATTCTTATATTTTCTCCTTAAAATCTATTTCCCTCTCCAACAGTCCATAATCTGAATTTGCGCATTACAATCGAATTGACCTAATGTAAATCCTT < 1:326509/151‑1 TAACAAAATGGGCATATTGTTACTTTAAAAAACAGGAATTTTTTCCTTTCTCTTAATTCTTATATTTTCTCCTTAAAATCTATTTCCCTCTCCAACAGTCCATAATCTGAATTTGCGCATTACAATCGAATTGACCTAATGTAAATCCTTG > 1:1866550/1‑151 AACAAAATGGGCATATTGTTACTTTAAAAAACAGGAATTTTTTCCTTTCTCTTAATTCTTATATTTTCTCCTTAAAATCTATTTCCCTCTCCAACAGTCCATAATCTGAATTTGCGCATTACAATCGAATTGACCTAATGTAAATCCTTGG < 1:77607/151‑1 AACAAAATGGGCATATTGTTACTTTAAAAAACAGGAATTTTTTCCTTTCTCTTAATTCTTATATTTTCTCCTTAAAATCTATTTCCCTCTCCAACAGTCCATAATCTGAATTTGCGCATTACAATCGAATTGACCTAATGTAAATCCTTGG > 1:1162769/1‑151 AAAATGGGCATATTGTTACTTTAAAAAACAGGAATTTTTTCCTTTCTCTTAATTCTTATATTTTCTCCTTAAAATCTATTTCCCTCTCCAACAGTCCATAATCTGAATTTGCGCATTACAATCGAATTGACCTAATGTAAATCCTTGGCTA < 1:3167915/151‑1 AAATGGGCATATTGTTACTTTAAAAAACAGGAATTTTTTCCTTTCTCTTAATTCTTATATTTTCTCCTTAAAATCTATTTCCCTCTCCAACAGTCCATAATCTGAATTTGCGCATTACAATCGAATTGACCTAATGTAAATCCTTGGCTAT > 1:1913471/1‑151 AATGGGCATATTGTTACTTTAAAAAACAGGAATTTTTTCCTTTCTCTTAATTCTTATATTTTCTCCTTAAAATCTATTTCCCTCTCCAACAGTCCATAATCTGAATTTGCGCATTACAATCGAATTGACCTAATGTAAATCCTTGGCTATA > 1:233244/1‑151 AATGGGCATATTGTTACTTTAAAAAACAGGAATTTTTTCCTTTCTCTTAATTCTTATATTTTCTCCTTAAAATCTATTTCCCTCTCCAACAGTCCATAATCTGAATTTGCGCATTACAATCGAATTGACCTAATGTAAATCCTTGGCTATA < 1:1860460/151‑1 TGGGCATATTGTTACTTTAAAAAACAGGAATTTTTTCCTTTCTCTTAATTCTTATATTTTCTCCTTAAAATCTATTTCCCTCTCCACCAGTCCATAATCTGAATTTGCGCATTACAATCGAATTGACCTAATGTAAATCCTTGGCTATAAT < 1:3276604/151‑1 TGGGCATATTGTTACTTTAAAAAACAGGAATTTTTTCCTTTCTCTTAATTCTTATATTTTCTCCTTAAAATCTATTTCCCTCTCCAACAGTCCATAATCTGAATTTGCGCATTACAATCGAATTGACCTAATGTAAATCCTTGGCTATAAT < 1:2155550/151‑1 GGCATATTGTTACTTTAAAAAACAGGAATTTTTTCCTTTCTCTTAATTCTTATATTTTCTCCTTAAAATCTATTTCCCTCTCCAACAGTCCATAATCTGAATTTGCGCATTACAATCGAATTGACCTAATGTAAATCCTTGGCTATAATTA < 1:2812099/151‑1 CATATTGTTACTTTAAAAAACAGGAATTTTTTCCTTTCTCTTAATTCTTATATTTTCTCCTTAAAATCTATTTCCCTCTCCAACAGTCCATAATCTGAATTTGCGCATTACAATCGAATTGACCTAATGTAAATCCTTGGCTATAATTAAT > 1:3387060/1‑151 ATTGTTACTTTAAAAAACAGGAATTTTTTCCTTTCTCTTAATTCTTATATTTTCTCCTTAAAATCTATTTCCCTCTCCAACAGTCCATAATCTGAATTTGCGCATTACAATCGAATTGACCTAATGTAAATCCTTGGCTATAATTAATAAT > 1:1494068/1‑151 ATTGTTACTTTAAAAAACAGGAATTTTTTCCTTTCTCTTAATTCTTATATTTTCTCCTTAAAATCTATTTCCCTCTCCAACAGTCCATAATCTGAATTTGCGCATTACAATCGAATTGACCTAATGTAAATCCTTGGCTATAATTAATAAT > 1:992024/1‑151 ATTGTTACTTTAAAAAACAGGAATTTTTTCCTTTCTCTTAATTCTTATATTTTCTCCTTAAAATCTATTTCCCTCTCCAACAGTCCATAATCTGAATTTGCGCATTACAATCGAATTGACCTAATGTAAATCCTTGGCTATAATTAATAAT > 1:2397167/1‑151 ATTGTTACTTTAAAAAACAGGAATTTTTTCCTTTCTCTTAATTCTTATATTTTCTCCTTAAAATCTATTTCCCTCTCCAACAGTCCATAATCTGAATTTGCGCATTACAATCGAATTGACCTAATGTAAATCCTTGGCTATAATTAATAAT < 1:3480606/151‑1 TGTTACTTTAAAAAACAGGAATTTTTTCCTTTCTCTTAATTCTTATATTTTCTCCTTAAAATCTATTTCCCTCTCCAACAGTCCATAATCTGAATTTGCGCATTACAATCGAATTGACCTAATGTAAATCCTTGGCTATAATTAATAATAA > 1:1231632/1‑151 TGTTACTTTAAAAAACAGGAATTTTTTCCTTTCTCTTAATTCTTATATTTTCTCCTTAAAATCTATTTCCCTCTCCAACAGTCCATAATCTGAATTTGCGCATTACAATCGAATTGACCTAATGTAAATCCTTGGCTATAATTAATAATAA < 1:3262933/151‑1 TGTTACTTTAAAAAACAGGAATTTTTTCCTTTCTCTTAATTCTTATATTTTCTCCTTAAAATCTATTTCCCTCTCCAACAGTCCATAATCTGAATTTGCGCATTACAATCGAATTGACCTAATGTAAATCCTTGGCTATAATTAATAATAA < 1:370034/151‑1 GTTACTTTAAAAAACAGGAATTTTTTCCTTTCTCTTAATTCTTATATTTTCTCCTTAAAATCTATTTCCCTCTCCAACAGTCCATAATCTGAATTTGCGCATTACAATCGAATTGACCTAATGTAAATCCTTGGCTATAATTAATAATAAA < 1:2899797/151‑1 TTACTTTAAAAAACAGGAATTTTTTCCTTTCTCTTAATTCTTATATTTTCTCCTTAAAATCTATTTCCCTCTCCAACAGTCCATAATCTGAATTTGCGCATTACAATCGAATTGACCTAATGTAAATCCTTGGCTATAATTAATAATAAAA > 1:812775/1‑151 TTACTTTAAAAAACAGGAATTTTTTCCTTTCTCTTAATTCTTATATTTTCTCCTTAAAATCTATTTCCCTCTCCAACAGTCCATAATCTGAATTTGCGCATTACAATCGAATTGACCTAATGTAAATCCTTGGCTATAATTAATAATAAAA > 1:35894/1‑151 TACTTTAAAAAACAGGAATTTTTTCCTTTCTCTTAATTCTTATATTTTCTCCTTAAAATCTATTTCCCTCTCCAACAGTCCATAATCTGAATTTGCGCATTACAATCGAATTGACCTAATGTAAATCCTTGGCTATAATTAATAATAAAAC < 1:2140123/151‑1 CTTTAAAAAACAGGAATTTTTTCCTTTCTCTTAATTCTTATATTTTCTCCTTAAAATCTATTTCCCTCTCCAACAGTCCATAATCTGAATTTGCGCATTACAATCGAATTGACCTAATGTAAATCCTTGGCTATAATTAATAATAAAACAA < 1:388099/151‑1 CTTTAAAAAACAGGAATTTTTTCCTTTCTCTTAATTCTTATATTTTCTCCTTAAAATCTATTTCCCTCTCCAACAGTCCATAATCTGAATTTGCGCATTACAATCGAATTGACCTAATGTAAATCCTTGGCTATAATTAATAATAAAACAA < 1:231968/151‑1 CTTTAAAAAACAGGAATTTTTTCCTTTCTCTTAATTCTTATATTTTCTCCTTAAAATCTATTTCCCTCTCCAACAGTCCATAATCTGAATTTGCGCATTACAATCGAATTGACCTAATGTAAATCCTTGGCTATAATTAATAATAAAACAA < 1:964086/151‑1 AGGACCAAAAAGACGAACTGTATTCTTTGGTTCAGTTTTAGAACGGTAAAAACCCCCAAACAATCAAGCAAATGGTTTGGGGGTATTATTTATTTTATAAAAAATTTAAAATATGCAGGAAAAAAAA‑TATCATGTCGAAGTATATTTTTAAAGTAACAAAATGGGCATATTGTTAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP002416/3474320‑3474145‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaagtaacaaaatgggcatattgttacTTTAAAAAACAGGAATTTTTTCCTTTCTCTTAATTCTTATATTTTCTCCTTAAAATCTATTTCCCTCTCCAACAGTCCATAATCTGAATTTGCGCATTACAATCGAATTGACCTAATGTAAATCCTTGGCTATAATTAATAATAAAACAA > CP002416/3475077‑3475226 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |