| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP002416 | = 1438372 | 0 (0.000) | 148 (1.030) | 107/296 | 0.4 | 100% | intergenic (+53/‑88) | Clo1313_1210/Clo1313_1211 | translation elongation factor Ts/uridylate kinase |
| ? | CP002416 | = 3041054 | NA (NA) | intergenic (‑128/+93) | Clo1313_2585/Clo1313_2586 | transposase IS200‑family protein/copper amine oxidase‑like domain‑containing protein | |||||
Only 100 of 151 total aligned reads displayed.
ATCAACATCAGAAGATTTGTAAGATTTGAAAGAGGCGAAGGCATACAGAAGAAGGAAGAAAACTTTGCCGAGGAAGTTATGAAACAAATAAATGGCTAAATGACGGGTAATGGATGAAGGGAACATATAAAGTATTTATATGTTCCCTTTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP002416/1438221‑1438372‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttGTTTAAAGAAAACCACTGGCTATGCCAGTGGTTCTAAAGAGACAGTGTCTATGAGTAGAAAAAAGTAACCTCCTTTGTTACAATAATGTAGGTTCGCCAACTACATTAAAAACAAAGGAGGTATCACGATGCGTGATAATGCTAG < CP002416/3041054‑3040910 ATCAACATCAGAAGATTTGTAAGATTTGAAAGAGGCGAAGGCATACAGAAGAAGGAAGAAAACTTTGCCGAGGAAGTTATGAAACAAATAAATGGCTAAATGACGGGTAATGGATGAAGGGAACATATAAAGTATTTATATGTTCCCTTTT > 1:682310/1‑151ATCAACATCAGAAGATTTGTAAGATTTGAAAGAGGCGAAGGCATACAGAAGAAGGAAGAAAACTTTGCCGAGGAAGTTATGAAACAAATAAATGGCTAAATGACGGGTAATGGATGAAGGGAACATATAAAGTATTTATATGTTCCCTTTT < 1:1734204/151‑1 AACATCAGAAGATTTGTAAGATTTGAAAGAGGCGAAGGCATACAGAAGAAGGAAGAAAACTTTGCCGAGGAAGTTATGAAACAAATAAATGGCTAAATGACGGGTAATGGATGAAGGGAACATATAAAGTATTTATATGTTCCCTTTTTGT > 1:2330073/1‑151 AACATCAGAAGATTTGTAAGATTTGAAAGAGGCGAAGGCATACAGAAGAAGGAAGAAAACTTTGCCGAGGAAGTTATGAAACAAATAAATGGCTAAATGACGGGTAATGGATGAAGGGAACATATAAAGTATTTATATGTTCCCTTTTTGT > 1:1275462/1‑151 AACATCAGAAGATTTGTAAGATTTGAAAGAGGCGAAGGCATACAGAAGAAGGAAGAAAACTTTGCCGAGGAAGTTATGAAACAAATAAATGGCTAAATGACGGGTAATGGATGAAGGGAACATATAAAGTATTTATATGTTCCCTTTTTGT < 1:474132/151‑1 ACATCAGAAGATTTGTAAGATTTGAAAGAGGCGAAGGCATACAGAAGAAGGAAGAAAACTTTGCCGAGGAAGTTATGAAACAAATAAATGGCTAAATGACGGGTAATGGATGAAGGGAACATATAAAGTATTTATATGTTCCCTTTTTGTT < 1:782765/151‑1 ACATCAGAAGATTTGTAAGATTTGAAAGAGGCGAAGGCATACAGAAGAAGGAAGAAAACTTTGCCGAGGAAGTTATGAAACAAATAAATGGCTAAATGACGGGTAATGGATGAAGGGAACATATAAAGTATTTATATGTTCCCTTTTTGTT < 1:494695/151‑1 ATCAGAAGATTTGTAAGATTTGAAAGAGGCGAAGGCATACAGAAGAAGGAAGAAAACTTTGCCGAGGAAGTTATGAAACAAATAAATGGCTAAATGACGGGTAATGGATGAAGGGAACATATAAAGTATTTATATGTTCCCTTTTTGTTTA < 1:2454743/151‑1 ATCAGAAGATTTGTAAGATTTGAAAGAGGCGAAGGCATACAGAAGAAGGAAGAAAACTTTGCCGAGGAAGTTATGAAACAAATAAATGGCTAAATGACGGGTAATGGATGAAGGGAACATATAAAGTATTTATATGTTCCCTTTTTGTTTA < 1:3033375/151‑1 ATCAGAAGATTTGTAAGATTTGAAAGAGGCGAAGGCATACAGAAGAAGGAAGAAAACTTTGCCGAGGAAGTTATGAAACAAATAAATGGCTAAATGACGGGTAATGGATGAAGGGAACATATAAAGTATTTATATGTTCCCTTTTTGTTTA < 1:3148518/151‑1 CAGAAGATTTGTAAGATTTGAAAGAGGCGAAGGCATACAGAAGAAGGAAGAAAACTTTGCCGAGGAAGTTATGAAACAAATAAATGGCTAAATGACGGGTAATGGATGAAGGGAACATATAAAGTATTTATATGTTCCCTTTTTGTTTAAA < 1:2542709/151‑1 AGAAGATTTGTAAGATTTGAAAGAGGCGAAGGCATACAGAAGAAGGAAGAAAACTTTGCCGAGGAAGTTATGAAACAAATAAATGGCTAAATGACGGGTAATGGATGAAGGGAACATATAAAGTATTTATATGTTCCCTTTTTGTTTAAAG < 1:133094/151‑1 TGTAAGATTTGAAAGAGGCGAAGGCATACAGAAGAAGGAAGAAAACTTTGCCGAGGAAGTTATGAAACAAATAAATGGCTAAATGACGGGTAATGGATGAAGGGAACATATAAAGTATTTATATGTTCCCTTTTTGTTTAAAGAAAACCAC > 1:2071072/1‑151 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> 1:2754918/1‑151 AAGGCATACAGAAGAAGGAAGAAAACTTTGCCGAGGAAGTTATGAAACAAATAAATGGCTAAATGACGGGTAATGGATGAAGGGAACATATAAAGTATTTATATGTTCCCTTTTTGTTTAAAGAAAACCACTGGCTATGCCAGTGGTTCTA > 1:1082109/1‑151 TACAGAAGAAGGAAGAAAACTTTGCCGAGGAAGTTATGAAACAAATAAATGGCTAAATGACGGGTAATGGATGAAGGGAACATATAAAGTATTTATATGTTCCCTTTTTGTTTAAAGAAAACCACTGGCTATGCCAGTGGTTCTAAAGAGA < 1:2401988/151‑1 ACAGAAGAAGGAAGAAAACTTTGCCGAGGAAGTTATGAAACAAATAAATGGCTAAATGACGGGTAATGGATGAAGGGAACATATAAAGTATTTATATGTTCCCTTTTTGTTTAAAGAAAACCACTGGCTATGCCAGTGGTTCTAAAGAGAC < 1:2013505/151‑1 ACAGAAGAAGGAAGAAAACTTTGCCGAGGAAGTTATGAAACAAATAAATGGCTAAATGACGGGTAATGGATGAAGGGAACATATAAAGTATTTATATGTTCCCTTTTTGTTTAAAGAAAACCACTGGCTATGCCAGTGGTTCTAAAGAGAC < 1:2309810/151‑1 ACAGAAGAAGGAAGAAAACTTTGCCGAGGAAGTTATGAAACAAATAAATGGCTAAATGACGGGTAATGGATGAAGGGAACATATAAAGTATTTATATGTTCCCTTTTTGTTTAAAGAAAACCACTGGCTATGCCAGTGGTTCTAAAGAGAC > 1:2107483/1‑151 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< 1:2801440/151‑1 AAGTATTTATATGTTCCCTTTTTGTTTAAAGAAAACCACTGGCTATGCCAGTGGTTCTAAAGAGACAGTGTCTATGAGTAGAAAAAAGTAACCTCCTTTGTTACAATAATGTAGGTTCGCCAACTACATTAAAAACAAAGGAGGTATCACG > 1:2046022/1‑151 GTATTTATATGTTCCCTTTTTGTTTAAAGAAAACCACTGGCTATGACAGTGGTTCTAAAGAGACAGTGTCTATGAGTAGAAAAAAGTAACCTCCTTTGTTACAATAATGTAGGTTCGCCAACTACATTAAAAACAAAGGAGGTATCACGAT < 1:2952758/151‑1 TATTTATATGTTCCCTTTTTGTTTAAAGAAAACCACTGGCTATGCCAGTGGTTCTAAAGAGACAGTGTCTATGAGTAGAAAAAAGTAACCTCCTTTGTTACAATAATGTAGGTTCGCCAACTACATTAAAAACAAAGGAGGTATCACGATG > 1:1146669/1‑151 TATTTATATGTTCCCTTTTTGTTTAAAGAAAACCACTGGCTATGCCAGTGGTTCTAAAGAGACAGTGTCTATGAGTAGAAAAAAGTAACCTCCTTTGTTACAATAATGTAGGTTCGCCAACTACATTAAAAACAAAGGAGGTATCACGATG < 1:2926656/151‑1 TTATATGTTCCCTTTTTGTTTAAAGAAAACCACTGGCTATGCCAGTGGTTCTAAAGAGACAGTGTCTATGAGTAGAAAAAAGTAACCTCCTTTGTTACAATAATGTAGGTTCGCCAACTACATTAAAAACAAAGGAGGTATCACGATGCGT > 1:2373667/1‑151 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ATCAACATCAGAAGATTTGTAAGATTTGAAAGAGGCGAAGGCATACAGAAGAAGGAAGAAAACTTTGCCGAGGAAGTTATGAAACAAATAAATGGCTAAATGACGGGTAATGGATGAAGGGAACATATAAAGTATTTATATGTTCCCTTTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP002416/1438221‑1438372‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttGTTTAAAGAAAACCACTGGCTATGCCAGTGGTTCTAAAGAGACAGTGTCTATGAGTAGAAAAAAGTAACCTCCTTTGTTACAATAATGTAGGTTCGCCAACTACATTAAAAACAAAGGAGGTATCACGATGCGTGATAATGCTAG < CP002416/3041054‑3040910 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |