| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | CP002416 | = 2456437 | 136 (0.930) | intergenic (‑178/+22) | Clo1313_2090/Clo1313_2091 | enolase/diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase | |||||
Only 100 of 165 total aligned reads displayed.
AAGGTTTCAAGAGCAGCCGTATCACCCGTAAAAGTTTCAGCCGATTCAACCTTTTTACACATAAAACTTTCAAAAATTGATGACTTACAATTATCAAGTAGGATATAATATTACTAATGCTAAACAGTTATTGATAAAGGAGGAAGGAAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP002416/1381783‑1381634‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAAATATTAAAATGGAAATGTTGAAAAAATGTTTTAAGATGGGTCATTATGGATAAAATATACTATGGTTTTGCAATAAATGCTTTCTATTAATTGGACTTTGTGGTAATATGGTAGAAGGATGCAGTGTTAATTTTTTAACATATAAA < CP002416/2456437‑2456288 AAGGTTTCAAGAGCAGCCGTATCACCCGTAAAAGTTTCAGCCGATTCAACCTTTTTACACATAAAACTTTCAAAAATTGATGACTTACAATTATCAAGTAGGATATAATATTACTAATGCTAAACAGTTATTGATAAAGGAGGAAGGAATG < 1:719462/151‑1AAGGTTTCAAGAGCAGCCGTATCACCCGTAAAAGTTTCAGCCGATTCAACCTTTTTACACATAAAACTTTCAAAAATTGATGACTTACAATTATCAAGTAGGATATAATATTACTAATGCTAAACAGTTATTGATAAAGGAGGAAGGAATG > 1:231129/1‑151 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< 1:1333420/151‑1 AGGAGGAAGGAATGGAAATATTAAAATGGAAATGTTGAAAAAATGTTTTAAGATGGGTCATTATGGATAAAATATACTATGGTTTTGCAATAAATGCTTTCTATTAATTGGACTTTGTGGTAATATGGTAGAAGGATGCAGTGTTAATTTT < 1:323806/151‑1 GGAAGGAATGGAAATATTAAAATGGAAATGTTGAAAAAATGTTTTAAGATGGGTCATTATGGATAAAATATACTATGGTTTTGCAATAAATGCTTTCTATTAATTGGACTTTGTGGTAATATGGTAGAAGGATGCAGTGTTAATTTTTTAA < 1:2095982/151‑1 AGGAATGGAAATATTAAAATGGAAATGTTGAAAAAATGTTTTAAGATGGGTCATTATGGATAAAATATACTATGGTTTTGCAATAAATGCTTTCTATTAATTGGACTTTGTGGTAATATGGTAGAAGGATGCAGTGTTAATTTTTTAACAT < 1:243186/151‑1 AATGGAAATATTAAAATGGAAATGTTGAAAAAATGTTTTAAGATGGGTCATTATGGATAAAATATACTATGGTTTTGCAATAAATGCTTTCTATTAATTGGACTTTGTGGTAATATGGTAGAAGGATGCAGTGTTAATTTTTTAACATATA > 1:2376649/1‑151 AATGGAAATATTAAAATGGAAATGTTGAAAAAATGTTTTAAGATGGGTCATTATGGATAAAATATACTATGGTTTTGCAATAAATGCTTTCTATTAATTGGACTTTGTGGTAATATGGTAGAAGGATGCAGTGTTAATTTTTTAACATATA < 1:18054/151‑1 AAGGTTTCAAGAGCAGCCGTATCACCCGTAAAAGTTTCAGCCGATTCAACCTTTTTACACATAAAACTTTCAAAAATTGATGACTTACAATTATCAAGTAGGATATAATATTACTAATGCTAAACAGTTATTGATAAAGGAGGAAGGAAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP002416/1381783‑1381634‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAAATATTAAAATGGAAATGTTGAAAAAATGTTTTAAGATGGGTCATTATGGATAAAATATACTATGGTTTTGCAATAAATGCTTTCTATTAATTGGACTTTGTGGTAATATGGTAGAAGGATGCAGTGTTAATTTTTTAACATATAAA < CP002416/2456437‑2456288 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |