| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP002416 | 712028 = | 168 (1.150) | 15 (0.110) +CGGTTCG |
7/286 | 18.4 | 10.7% | coding (3205/4848 nt) | Clo1313_0628 | cellulosome anchoring protein cohesin region |
| ? | CP002416 | = 712278 | 96 (0.660) | coding (3455/4848 nt) | Clo1313_0628 | cellulosome anchoring protein cohesin region | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGTTCGTCTGATGGTGTATCCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP002416/712175‑712028‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TCTGATGGTGTATCCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTTGGTTCATCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACG < CP002416/712278‑712161 ||||||| TTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGTTCGTCTGATGGTGTATCCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGGGTCGG > 1:35401/1‑151 GGCTCGTCTGACGGTGTCGGTTCGTCTGATGGTGTATCCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGTT < 1:2804527/151‑1 GGCTCGTCTGACGGTGTCGGTGCGTCTGATGGTGTTGCCGTCGGTTTCGGCTCCTGTGGCGCCTCTGGCGGTGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGTT < 1:1653384/151‑1 CTCGTCTGACGGTGTCGGTTCGTCTGATGGTGTATCCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCAACAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGAGTCGGTTTGTGAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGAGTCGGTTCG > 1:1534918/1‑151 TCGTCTGACGGTGTCGGTTCGTCTGATGGTGTATCCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGCGCCGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCGCGTCTGCCGGTGGCGGTTCGT > 1:1895327/1‑151 ACGGTGTCGGTTCGTCTGATGGTGTATCCGTCGGTATCGGCTCCGCAGGGGTCTCTGGCGGGGTCGGTTCGTCAGATGGGGTTGGCTCATCAGACGGTGTCGGGTCGTCAGATGGGGTTGGCTCGTCTGACGGGGTCGGTTCGTCggttgg > 1:929831/1‑145 TTCGTCTGATGGTGTATCCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGTTCGTCTGCTGGTGaggtcggg > 1:2443623/1‑143 TGGTGTATCCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGCGTTGGCTCGTCAGACGGAGTCGGGTCGTCAGCTGGCGTTGGCTCGTCTGTCGGTGGCGGTTCGTCTGATGGTGTATCCGTCGGTGTCGGC > 1:435877/1‑151 TATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGCGTCGGTTCGTCTGGTGGTGTATCCGTCGGTATCGGCcccgccgggttctct > 1:1194105/1‑136 CGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGCTGGTTCGCCTGATGGCGTATGCGCCGGTATCGGCTCCTCtgctggcgttgac > 1:820628/1‑138 GCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGCGTTGGCTCATCAGACGGGGCGGGTTCGTCAGGTGGCGTTGGCTCGGCTGACGGTGTCGGTTCGTCTGATGGTGTATGCGTCGGTATCGGCCCCCCAGGCGTCTCTGACGG > 1:2438159/1‑151 AGGTGTCTCTGACGGGGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGGCGGTGTTGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGTTCGTCTGATGGTGTATCCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGT < 1:688485/151‑1 GGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTTGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGTTCGTCTGGTGGCGTATCCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGCCTCTGACGGAGTCGGTT > 1:2592484/1‑151 gggCGGTTCATCGGATGGTGTTGGCTTGTCTGACGCGGTGGGTTCGTCAGATGGGGTTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGTTCGTCTGATGGTGTATCCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTT < 1:1043386/148‑1 GTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCGCTTCAGACGGTGTTGGTTCGTCTGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGTTCGTCTGATGGTGTATCCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTG < 1:3003290/151‑1 TCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTTGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGTTCGTCTGATGGTGTATCCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCAT < 1:1031387/151‑1 CATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGGCGGTTCGTCTGGTGGGGTATCCGTCGGCAGCGGCCCCTCAGGGGTCTCTGACGGAGGCGGTTCATCAGCTGGTGTTGGCTCATC > 1:3367071/1‑151 tTTGGCTCCTCCGGCGGCGTCGGTTTGTCCGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGTTCGTCTGATGGTGTATCCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTcg < 1:1260937/150‑3 GATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGTTCGTCTGATGGTGTATCCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGCGTCGGTTCATCTGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTTGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACG < 1:2265318/151‑1 ||||||| TTGGCTCGTCTGACGGTGTCGGTTCGTCTGATGGTGTATCCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTCGGTTCGTCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACGGTGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP002416/712175‑712028‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TCTGATGGTGTATCCGTCGGTATCGGCTCCTCAGGTGTCTCTGACGGAGTCGGTTCATCAGATGGTGTTGGCTCATCAGACGGTGTTGGTTCATCAGATGGCGTTGGCTCGTCTGACG < CP002416/712278‑712161 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |