| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP002416 | 103767 = | 78 (0.540) | 22 (0.260) +CTCCGGCGTCGGTGTCGGGCTCGGCTCCGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCT |
20/172 | 6.7 | 32.7% | coding (1996/3180 nt) | Clo1313_0090 | S‑layer domain‑containing protein |
| ? | CP002416 | = 103768 | 80 (0.550) | coding (1997/3180 nt) | Clo1313_0090 | S‑layer domain‑containing protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
AGTTCCGGTGTCGGCGTCGGGCTTGGGCTCGGTTCCGGCTCCGGCGTCGGTGTCGGGCTCGGCTCCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP002416/103834‑103767‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCG < CP002416/103768‑103672 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ggtgCCGGTGTCGGCGTCGGGGTCGGGCTCGGTTCCGGGGCCGGCGTCGGTGTCGGGCTCGGCTCCGGCTCCGGCGTCGGTGTCGGGCTCGGCTCCGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCGTCG < 1:3230857/147‑1 CGGTGTGGGCGTCGGGGTCGGGCTCGGTTCCGGGTCCGGCGTCGGGGTCGGGCTCGGCTCCGGCGCCGGCGTCGGTGTCGGGCTCGGCTCCGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTC < 1:2749036/151‑1 tgttgTTGGGCTCGGTTCCGGTTTCGGCGTCGGAGTTGGGCTCGGCTCCGGCGCCGGCGTCGGTGTCGGGCTCGGTGTCGGTTCCGGTGTCGGCGTCGGTGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCT < 1:123314/146‑1 gcCTCGGTTCCGGCTCCGGCGTCGGTGTCGGGCTCGGCTCCGGCTCCGGCGTCGGTGTCGGGCTCGGCTCCGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGG < 1:3054343/149‑1 GGTTCCGGCTCCGGCGTCGGTGTCGGGCTCGGCTCCGGCTCCGGCGTCGGTGTCGGGCTCGGCTCCGGGTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGCTCTGGTTCCGGTGGCGGCGTCGGTGTCGGCTGCGGCTCTGGTTCCGGcggcg > 1:453325/1‑146 GTTCCGGCTCCGGCGTCGGTGTCGGGCTCGGGTCCGGCTCCGGCGTCGGTGTCGGGCTCGGGTCCGGTTCCGGTGTCGGCGTCGGTGTCGGGTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGG < 1:766480/151‑1 GTTCCGGCGCCGGCGTCGGTGTCGGGCTCGGGGCCGGTTCCGGCGTCGGTGTCGGGCTCGGCGCCGGTTCCGGTGTCGGCGTCGGTGTCGGGTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGG < 1:1926792/151‑1 TCCGGCTCCGGCGTCGGTGTCGGGCTCGGCTCCGGCTCCGGCGTCGGTGTCGGGCTCGGCTCCGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTTGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCG < 1:2956370/151‑1 CCGGCTCCGGCGTCGGTGTCGGGCTCGGCTCCGGCTCCGGCGTCGGTGTCGGGCTCGGCTCCGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCGT > 1:2150048/1‑151 CCGGCGCCGGCGTCGGTCTCGGGCTCGGCTCCGGCTCCGGCGTCGGTGTCGGGCTCGGCTCCGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCGT < 1:2474219/151‑1 CGGCTCCGGCGTCGGGGTCGGGGTCGGCTCCGGCTCCGGCGTCGGTGTCGGGCTCGGGTCCGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCGTC < 1:2406111/151‑1 GGCTCCGGCGTCGGGGTCGGGCTCGGCTCCGGTTCCGGCGTCGGTGTCGGGCTCGGCTCCGGTTCCGGTGTCGGCGTCGAGGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCGTCG < 1:2861016/151‑1 TCCGGCGTCGGTGTCGGGCTCGGCTCCGGCTCCGGCGTCGGTGTCGGGCTCGGCTCCGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATG > 1:844016/1‑151 CGGCGTCGGTGTCGGGCTCGGCTCCGGCTCCGGCGTCGGTGTCGGGCTCGGCTCCGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTC < 1:228407/151‑1 GGCGTCGGTGTCGGGGTCGGCTCCGGCTCCGGCGTCGGTGTCGGGCTCGGCTCCGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCG < 1:1100953/151‑1 GTGTCGGGCTCGGCTCCGGCTCCGGCGTCGGTGTCGGGCTCGGCTCCGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGG > 1:3284900/1‑151 GGGCTCGGCTCCGGCTCCGGCGTCGGTGTCGGGCTCGGCTCCGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTG > 1:2484695/1‑151 CGGCTCCGGCTCCGGCGTCGGTGTCGGGCTCGGCTCCGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCC > 1:1469307/1‑151 GCTCCGGTCCCGGCGGCGGGGTCGGGCTCGGCTCCGGTTCCGGTGTCGGCGTCGGTGTCGGCTGCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGG < 1:396063/151‑1 GCTCCGGCTCCGGCGTCGGTGTCGGGCTCGGCTCCGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTTTGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGGGTCGGCGTCGAGGTCGGCTCCGGGTCTGGTgtcgg > 1:1978488/1‑146 CTCCGGCTCCGGCGTCGGTGTCGGGCTCGGCTCCGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTTCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGT < 1:130587/151‑1 CCGGCTCCGGCGTCGGTGTCGGGCTCGGCTCCGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGTTTTGGTTCTGGCGCCGGTGTCGGCGTCGGTGTCGGTTCCGGTTCTGGCTCCGGggt > 1:414792/1‑148 ctgCCGGCGTCGGTGTGGGGCTGGGGGGCGGTTCCGGTTTCGGTGTCGGTGTCGGCTTCGGGTCTGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGG < 1:959715/148‑1 ggCCGGCGTCGGTGTCGGGCTCGGGTCCGGTTCCGGTGTCGGGGTCGGTGTCGGCGTCGGTTCGGGGTCCGGTGTGGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGC < 1:1734023/149‑1 CTCCGGCGTCGGTGTCGGGCTCGGCTCCGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGC > 1:2911300/1‑151 TCCGGCGTCGGTGTCGGGCTCGGCTCCGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCG < 1:1356537/151‑1 CCGGCGTCGGTGTCGGGCTCGGCTCCGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGCCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGCCGGCTTCGGTTCTGGTGTCGGCGGCGGCGTCGATGTCGGCCCCGGTTCCGGTTCCGGTGTCGGtgt > 1:2065919/1‑148 CGGCGTCGGTGTCGGGCTCGGCTCCGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGGGTCGGCGTC > 1:2959921/1‑151 GGCGTCGGTGTCGGGCTCGGCTCCGGTTCCGGCGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTCCCGGTGTCGGCGTCGATGCCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGCCGGCGCCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCGTCG > 1:3243046/1‑151 TCGGTGTCGGGCTCGGCTCCGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGT < 1:3154575/151‑1 CGGTGTCGGGCTCGGCTCCGGTTCCGGTGTCGGCGTCGGTGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTC < 1:207097/151‑1 GGTGCCGGGCTCGGTTCCGGTTTCGGTGTCGGCGTCGGTGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTTCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCG < 1:1254962/151‑1 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AGTTCCGGTGTCGGCGTCGGGCTTGGGCTCGGTTCCGGCTCCGGCGTCGGTGTCGGGCTCGGCTCCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP002416/103834‑103767‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCGGCTCCGGTTCTGGTTCCGGTGTCGGCGTCGATGTCG < CP002416/103768‑103672 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |