| Predicted mutation | ||||||
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| RA | CP002416 | 724,903 | (T)8→9 | coding (52/276 nt) | Clo1313_0638 ← | histone family protein DNA‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP002416 | 724,903 | 1 | . | T | 97.6% | 470.9 / 2.0 | 123 | coding (52/276 nt) | Clo1313_0638 | histone family protein DNA‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (2/1); new base T (62/58); total (64/59) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.18e-01 | |||||||||||
Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
CTTCTTTTGTTTGAGGATTTCTTCCTTTTCTTGCAGCTCTGTTCTTAACTTCGAAAGTGCCGAAACCAACGAGTACTACTTTGTCACCTTTCTTAAGTGCTTCTTCAACAGATGCGATAAAAGCGTTCAGAGCAGCTTCACTGTTTTTTT‑T‑G‑CTCAGACCGGATTTCGAAGCAATTGAGTTTATTAATTCAGTTTTGTTCATGTACACAACCTCCTAAATTTGGAATTCGACAATATTTTATAATGAAAATCGCGGAAAGTCAAGCAATTCCGAATAAATTAATGACATAAATCAAATTT > CP002416/724753‑725052 | cttcttTTGTTTGAGGATTTCTTCCTTTTCTTGCAGCTCTGTTCTTAACTTCGAAAGTGCCGAAACCAACGAGTACTACTTTGTCACCTTTCTTAAGTGCTTCTTCAACAGATGCGATAAAAGCGTTCAGAGCAGCTTCACTGttttttt‑t < 1:2902566/151‑1 (MQ=255) ttcttTTGTTTGAGGATTTCTTCCTTTTCTTGCAGCTCTGTTCTTAGCTTCGAAAGTGCCGAAACCAACGAGTACTACTTTGTCACCTTTCTTAAGTGCTTCTTCAACAGATGCGATAAAAGCGTTCAGAGCAGCTTCACTGttttttt‑tt < 1:1269816/151‑2 (MQ=255) gtttgAGGATTTCTTCCTTTTCTTGCAGCTCTGTTCTTAACTTCGAAAGTGCCGAAACCAACGAGTACTACTTTGTCACCTTTCTTAAGTGCTTCTTCAACAGATGCGATAAAAGCGTTCAGAGCAGCTTCACTGTTTTTTT‑TTG‑CTCAGa < 1:1183380/151‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |