| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP002416 | 3,085,428 | (A)7→6 | intergenic (‑269/‑375) | Clo1313_2620 ← / → Clo1313_2621 | cytochrome c biogenesis protein transmembrane region/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP002416 | 3,085,428 | 0 | A | . | 99.4% | 719.1 / ‑2.5 | 158 | intergenic (‑269/‑375) | Clo1313_2620/Clo1313_2621 | cytochrome c biogenesis protein transmembrane region/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base . (75/82); total (75/83) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.28e-01 | |||||||||||
Only 100 of 173 total aligned reads displayed.
TCCAAAACACAACATATCAATTAACACTTCTTTTCCCCGGCTCATATAATATAGTAGCATGCTGTTGTCAAAACACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAAAGCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACAGCAGCGCAATAGGCGGCATTAAACATGATGTTAAAGATGACGACACAATATTGTTCTTTATCCTGGTATTCCTCAAGCTTTTTTATTG > CP002416/3085282‑3085578 | tCCAAAACACAACATATCAATTAACACTTCTTTTCCCCGGCTCATATAATATAGTAGCATGCTGTTGTCAAAACACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGca < 1:3453233/151‑1 (MQ=255) ccAAAACACAACATATCAATTAACACTTCTTTTCCCCGGCTCATATAATATAGTAGCATGCTGTTGTCAAAACACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGcac > 1:2771985/1‑151 (MQ=255) cAAAACACAACATATCAATTAACACTTCTTTTCCCCGGCTCATATAATATAGTAGCATGCTGTTGTCAAAACACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGcaca > 1:2309752/1‑151 (MQ=255) aacaTATCAATTAACACTTCTTTTCCCCGGCTCATATAATATAGTAGCATGCTGTTGTCAAAACACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTc < 1:3455887/151‑1 (MQ=255) aacaTATCAATTAACACTTCTTTTCCCCGGCTCATATAATATAGTAGCATGCTGTTGTCAAAACACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTc > 1:2926813/1‑151 (MQ=255) tatCAATTAACACTTCTTTTCCCCGGCTCATATAATATAGTAGCATGCTGTTGTCAAAACACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAg < 1:936464/151‑1 (MQ=255) tatCAATTAACACTTCTTTTCCCCGGCTCATATAATATAGTAGCATGCTGTTGTCAAAACACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAg > 1:2652918/1‑151 (MQ=255) tatCAATTAACACTTCTTTTCCCCGGCTCATATAATATAGTAGCATGCTGTTGTCAAAACACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAg < 1:2357218/151‑1 (MQ=255) cAATTAACACTTCTTTTCCCCGGCTCATATAATATAGTAGCATGCTGTTGTCAAAACACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCtt > 1:2743231/1‑151 (MQ=255) cAATTAACACTTCTTTTCCCCGGCTCATATAATATAGTAGCATGCTGTTGTCAAAACACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCtt < 1:1898271/151‑1 (MQ=255) ttAACACTTCTTTTCCCCGGCTCATATAATATAGTAGCATGCTGTTGTCAAAACACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTg < 1:978699/151‑1 (MQ=255) ttAACACTTCTTTTCCCCGGCTCATATAATATAGTAGCATGCTGTTGTCAAAACACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTg < 1:912286/151‑1 (MQ=255) tAACACTTCTTTTCCCCGGCTCATATAATATAGTAGCATGCTGTTGTCAAAACACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGt < 1:340776/151‑1 (MQ=255) tAACACTTCTTTTCCCCGGCTCATATAATATAGTAGCATGCTGTTGTCAAAACACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGt < 1:3086915/151‑1 (MQ=255) aaCACTTCTTTTCCCCGGCTCATATAATATAGTAGCATGCTGTTGTCAAAACACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGtt < 1:2662551/151‑1 (MQ=255) acTTCTTTTCCCCGGCTCATATAATATAGTAGCATGCTGTTGTCAAAACACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCtt < 1:3011243/151‑1 (MQ=255) acTTCTTTTCCCCGGCTCATATAATATAGTAGCATGCTGTTGTCAAAACACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCtt > 1:2610862/1‑151 (MQ=255) cttcttTTCCCCGGCTCATATAATATAGTAGCATGCTGTTGTCAAAACACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCttt > 1:2697747/1‑151 (MQ=255) ttcttTTCCCCGGCTCATATAATATAGTAGCATGCTGTTGTCAAAACACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTa < 1:1550344/151‑1 (MQ=255) tcttTTCCCCGGCTCATATAATATAGTAGCATGCTGTTGTCAAAACACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTAt < 1:2108996/151‑1 (MQ=255) tcttTTCCCCGGCTCATATAATATAGTAGCATGCTGTTGTCAAAACACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTAt > 1:2360917/1‑151 (MQ=255) tcttTTCCCCGGCTCATATAATATAGTAGCATGCTGTTGTCAAAACACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTAt < 1:685762/151‑1 (MQ=255) tttCCCCGGCTCATATAATATAGTAGCATGCTGTTGTCAAAACACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTAtttt > 1:2677790/1‑151 (MQ=255) ttCCCCGGCTCATATAATATAGTAGCATGCTGTTGTCAAAACACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTa < 1:842857/151‑1 (MQ=255) ttCCCCGGCTCATATAATATAGTAGCATGCTGTTGTCAAAACACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTa < 1:79493/151‑1 (MQ=255) tCCCCGGCTCATATAATATAGTAGCATGCTGTTGTCAAAACACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTaa > 1:2826892/1‑151 (MQ=255) tCCCCGGCTCATATAATATAGTAGCATGCTGTTGTCAAAACACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTaa > 1:2840426/1‑151 (MQ=255) ccccGGCTCATATAATATAGTAGCATGCTGTTGTCAAAACACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAat > 1:1672832/1‑151 (MQ=255) ccGGCTCATATAATATAGTAGCATGCTGTTGTCAAAACACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAatat < 1:2146693/151‑1 (MQ=255) ccGGCTCATATAATATAGTAGCATGCTGTTGTCAAAACACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAatat > 1:2922519/1‑151 (MQ=255) cGGCTCATATAATATAGTAGCATGCTGTTGTCAAAACACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATAtt > 1:2503047/1‑151 (MQ=255) ggCTCATATAATATAGTAGCATGCTGTTGTCAAAACACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATAttt > 1:785872/1‑151 (MQ=255) gCTCATATAATATAGTAGCATGCTGTTGTCAAAACACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTtc > 1:2245201/1‑151 (MQ=255) cTCATATAATATAGTAGCATGCTGTTGTCAAAACACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTtct < 1:2051261/151‑1 (MQ=255) tCATATAATATAGTAGCATGCTGTTGTCAAAACACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTtctc < 1:772722/151‑1 (MQ=255) atataatataGTAGCATGCTGTTGTCAAAACACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCt < 1:1725249/151‑1 (MQ=255) tataatataGTAGCATGCTGTTGTCAAAACACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTg < 1:3259707/151‑1 (MQ=255) taatataGTAGCATGCTGTTGTCAAAACACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGct < 1:1767534/151‑1 (MQ=255) aatataGTAGCATGCTGTTGTCAAAACACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGctc > 1:1361067/1‑151 (MQ=255) tataGTAGCATGCTGTTGTCAAAACACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCtt < 1:2159897/151‑1 (MQ=255) ataGTAGCATGCTGTTGTCAAAACACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCttt < 1:1613795/151‑1 (MQ=255) agCATGCTGTTGTCAAAACACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGa > 1:3128786/1‑151 (MQ=255) agCATGCTGTTGTCAAAACACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGa < 1:2916610/151‑1 (MQ=255) agCATGCTGTTGTCAAAACACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGa > 1:2407127/1‑151 (MQ=255) cATGCTGTTGTCAAAACACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGAca < 1:3208248/151‑1 (MQ=255) cATGCTGTTGTCAAAACACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGAca < 1:2813068/151‑1 (MQ=255) tgttgtCAAAACACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACagcagc > 1:1018940/1‑151 (MQ=255) gttgtCAAAACACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACAGCAgcg < 1:3091689/151‑1 (MQ=255) ttgtCAAAACACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACAGCAgcgc > 1:497373/1‑151 (MQ=255) ttgtCAAAACACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACAGCAgcgc < 1:561589/151‑1 (MQ=255) tgtCAAAACACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACAGCAGCGCa > 1:1763526/1‑151 (MQ=255) cAAAACACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACAGCAGCGCAATa > 1:2660344/1‑151 (MQ=255) aaaaCACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACAGCAGCGCAATAg > 1:3230539/1‑151 (MQ=255) aaaCACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACAGCAGCGCAATAgg < 1:315680/151‑1 (MQ=255) aaaCACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACAGCAGCGCAATAgg < 1:1807880/151‑1 (MQ=255) aaaCACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACAGCAGCGCAATAgg < 1:1751103/151‑1 (MQ=255) aaCACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACAGCAGCGCAATAggc < 1:2057735/151‑1 (MQ=255) acacCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACAGCAGCGCAATAggcg > 1:83277/1‑151 (MQ=255) cacCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACAGCAGCGCAATAggcgg > 1:45778/1‑151 (MQ=255) cacCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACAGCAGCGCAATAggcgg > 1:1471952/1‑151 (MQ=255) cgtccgtGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACAGCAGCGCAATAGGCGGCAt > 1:1334982/1‑151 (MQ=255) cgtccgtGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACAGCAGCGCAATAGGCGGCAt < 1:2800827/151‑1 (MQ=255) cgtccgtGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACAGCAGCGCAATAGGCGGCAt < 1:1054052/151‑1 (MQ=255) cgtGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACAGCAGCGCAATAGGCGGCATTaaa < 1:3271885/151‑1 (MQ=255) gtTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACAGCAGCGCAATAGGCGGCATTAAACat < 1:536094/151‑1 (MQ=255) aTGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACAGCAGCGCAATAGGCGGCATTAAACatgatg < 1:2487419/151‑1 (MQ=255) aTCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACAGCAGCGCAATAGGCGGCATTAAACATGATGTTAAAGAt > 1:1233480/1‑151 (MQ=255) tCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACAGCAGCGCAATAGGCGGCATTAAACATGATGTTAAAGATg < 1:2874/151‑1 (MQ=255) tCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACAGCAGCGCAATAGGCGGCATTAAACATGATGTTAAAGATg < 1:1506924/151‑1 (MQ=255) tCAGCAAGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACAGCAGCGCAATAGGCGGCATTAAACATGATGTTAAAGATg < 1:370526/151‑1 (MQ=255) cagcagGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACAGCAGCGCAATAGGCGGCATTAAACATGATGTTAAAGATga < 1:825684/151‑1 (MQ=255) cagcagGAATAATAAATGAGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACAGCAGCGCAATAGGCGGCATTAAACATGATGTTAAAGATga < 1:1723602/151‑1 (MQ=255) agcagGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACAGCAGCGCAATAGGCGGCATTAAACATGATGTTAAAGATgac > 1:721655/1‑151 (MQ=255) agGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACAGCAGCGCAATAGGCGGCATTAAACATGATGTTAAAGATgacgac < 1:1882547/151‑1 (MQ=255) ggAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACAGCAGCGCAATAGGCGGCATTAAACATGATGTTAAAGATGACGaca < 1:1966204/151‑1 (MQ=255) gAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACAGCAGCGCAATAGGCGGCATTAAACATGATGTTAAAGATGACGacac > 1:2204517/1‑151 (MQ=255) gAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACAGCAGCGCAATAGGCGGCATTAAACATGATGTTAAAGATGACGacac > 1:174854/1‑151 (MQ=255) aataatAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACAGCAGCGCAATAGGCGGCATTAAACATGATGTTAAAGATGACGAcaca < 1:953016/151‑1 (MQ=255) ataaATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACAGCAGCGCAATAGGCGGCATTAAACATGATGTTAAAGATGACGACACAatat < 1:223345/151‑1 (MQ=255) taaATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACAGCAGCGCAATAGGCGGCATTAAACATGATGTTAAAGATGACGACACAATAtt > 1:1280724/1‑151 (MQ=255) taaATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACAGCAGCGCAATAGGCGGCATTAAACATGATGTTAAAGATGACGACACAATAtt < 1:1246753/151‑1 (MQ=255) aaaTGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACAGCAGCGCAATAGGCGGCATTAAACATGATGTTAAAGATGACGACACAATATTg < 1:1317100/151‑1 (MQ=255) aaTGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACAGCAGCGCAATAGGCGGCATTAAACATGATGTTAAAGATGACGACACAATATTGt < 1:1480796/151‑1 (MQ=255) aTGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACAGCAGCGCAATAGGCGGCATTAAACATGATGTTAAAGATGACGACACAATATTGtt < 1:62962/151‑1 (MQ=255) gAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACAGCAGCGCAATAGGCGGCATTAAACATGATGTTAAAGATGACGACACAATATTGTTCttt > 1:60577/1‑151 (MQ=255) aGGTAGAAAACCATTTCAGAT‑TTTAAAAAGCGCACAAATAATTCCGTGGTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACAGCAGCGCAATAGGCGGCATTAAACATGATGTTAAAGATGACGACACAATATTGTTCTTTa < 1:1517151/151‑1 (MQ=255) ggAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACAGCAGCGCAATAGGCGGCATTAAACATGATGTTAAAGATGACGACACAATATTGTTCTTTATCCt < 1:1870488/151‑1 (MQ=255) gAAAACCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACAGCAGCGCAATAGGCGGCATTAAACATGATGTTAAAGATGACGACACAATATTGTTCTTTATCCTg < 1:3012227/151‑1 (MQ=255) aaaaCCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACAGCAGCGCAATAGGCGGCATTAAACATGATGTTAAAGATGACGACACAATATTGTTCTTTATCCTgg > 1:2642022/1‑151 (MQ=255) aaaCCATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACAGCAGCGCAATAGGCGGCATTAAACATGATGTTAAAGATGACGACCCAATATTGTTCTTTATCCTGGt > 1:584344/1‑151 (MQ=255) ccATGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACAGCAGCGCAATAGGCGGCATTAAACATGATGTTAAAGATGACGACACAATATTGTTCTTTATCCTGGTAtt > 1:296034/1‑151 (MQ=255) aTGTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACAGCAGCGCAATAGGCGGCATTAAACATGATGTTAAAGATGACGACACAATATTGTTCTTTATCCTGGTATTcc < 1:2719786/151‑1 (MQ=255) gTCAGATATAAAAAA‑GCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACAGCAGCGCAATAGGCGGCATTAAACATGATGTTAAAGATGACGACACAATATTGTTCTTTATCCTGGTATTCCTc > 1:1631672/1‑151 (MQ=255) atataaaaaaGCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACAGCAGCGCAATAGGCGGCATTAAACATGATGTTAAAGATGACGACACAATATTGTTCTTTATCCTGGTATTCCTCAAGCt > 1:2462527/5‑151 (MQ=255) taaaaaaGCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACAGCAGCGCAATAGGCGGCATTAAACATGATGTTAAAGATGACGACACAATATTGTTCTTTATCCTGGTATTCCTCAAGCtttt > 1:825942/2‑151 (MQ=255) aaaGCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACAGCAGCGCAATAGGCGGCATTAAACATGATGTTAAAGATGACGACACAATATTGTTCTTTATCCTGGTATTCCTCAAGCTTTTTTAt < 1:2052384/151‑1 (MQ=255) aaaGCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACAGCAGCGCAATAGGCGGCATTAAACATGATGTTAAAGATGACGACACAATATTGTTCTTTATCCTGGTATTCCTCAAGCTTTTTTAt > 1:1092786/1‑151 (MQ=255) aaaGCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACAGCAGCGCAATAGGCGGCATTAAACATGATGTTAAAGATGACGACACAATATTGTTCTTTATCCTGGTATTCCTCAAGCTTTTTTAt < 1:277993/151‑1 (MQ=255) aaaGCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACAGCAGCGCAATAGGCGGCATTAAACATGATGTTAAAGATGACGACACAATATTGTTCTTGATCCTGGTATTCCTCAAGCTTTTTTAt > 1:2354158/1‑151 (MQ=255) aGCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACAGCAGCGCAATAGGCGGCATTAAACATGATGTTAAAGATGACGACACAATATTGTTCTTTATCCTGGTATTCCTCAAGCTTTTTTATTg < 1:1648590/151‑1 (MQ=255) | TCCAAAACACAACATATCAATTAACACTTCTTTTCCCCGGCTCATATAATATAGTAGCATGCTGTTGTCAAAACACCGTCCGTGTTTATGTAAACATCAGCAGGAATAATAAATGGGAGGTGGAAAACCATGTCAGATATAAAAAAAGCGCACAAATAATTCCGAGCTTTTGTTCTTTATTTTAATATTTCTCCTGCTCTTTTATGACAGCAGCGCAATAGGCGGCATTAAACATGATGTTAAAGATGACGACACAATATTGTTCTTTATCCTGGTATTCCTCAAGCTTTTTTATTG > CP002416/3085282‑3085578 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |